Gene Page:LGALS3BP

Summary？
基因 3959
象征 LGALS3BP
Synonyms 90K|BTBD17B|CyCAP|M2BP|MAC-2-BP|TANGO10B|gp90
Description 凝集素，半乳糖苷结合，可溶性，3结合蛋白
参考erence MIM：600626|HGNC：HGNC：6564|ENSEMBL：ENSG00000108679|HPRD：02796|Vega：Otthumg00000177572
基因类型 蛋白质编码
Map location 17Q25
Pascal p-value 0.152
Sherlock p-value 0.351
胎儿β -1.368
DMG 1 (# studies)
主持人 Myers' cis & trans

Gene in Data Sources
基因集名称 Method of gene set Description 信息
CV:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 2

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@DNM表

Gene 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 Mutation type 筛 CG46 特征 学习
LGALS3BP CHR17 76967715 G 一个 NM_005567 。 沉默的 Schizophrenia DNM:Fromer_2014

@差异甲基化基因

Probe 染色体 位置 最近的基因 p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
CG11105610 17 76976352 LGALS3BP 0.003 -3.528 DMG：Vaneijk_2014
cg14870271 17 76976010 LGALS3BP 2。261E-4 -3.986 DMG：Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID pvalue QVALUE TSS距离 EQTL类型
rs4796798 CHR17 76616546 LGALS3BP 3959 0.18 顺式
snp_a-2274505 0 LGALS3BP 3959 0.01 反式
rs4501739 Chrx 35960848 LGALS3BP 3959 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
一个total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
Gene 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GPI 0.89 0.87
DENND4B 0.87 0.87
KLC2 0.86 0.84
Aars 0.86 0.83
WBP2 0.86 0.83
NFE2L1 0.85 0.84
CYFIP2 0.85 0.87
PDXK 0.85 0.82
iffo1 0.84 0.82
AC135048.1 0.84 0.82
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GNG11 -0.53 -0.51
AF347015.21 -0.51 -0.40
IL32 -0.51 -0.49
鼻孔 -0.47 -0.41
AF347015.18 -0.46 -0.31
FAM159B -0.46 -0.67
AL050337.1 -0.45 -0.49
C1orf54 -0.45 -0.43
AP002478.3 -0.44 -0.40
CLEC3B -0.44 -0.47

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
CD14 - CD14molecule - HPRD 7583357
COL5A1 - 胶原蛋白，V型，Alpha 1 - HPRD 9501082
COL6A1 OPLL 胶原蛋白，VI型，Alpha 1 - HPRD 9501082
FN1 CIG |DKFZP686F10164 |DKFZP686H0342 |DKFZP686I1370 |DKFZP686O13149 |ed-b |Finc |fn |fnz |gfnd | GFND2 | LETS | MSF 纤连蛋白1 - HPRD 9501082
ITGB1 CD29 |fnrb |GPIIA |MDF2 |MSK12 |vla-beta |vlab integrin, beta 1 (fibronectin receptor, beta polypeptide, antigen CD29 includes MDF2, MSK12) - HPRD 9501082
LGALS1 DKFZP686E23103 |gal1 |英镑 凝集素，半乳糖苷结合，可溶性，1 体外
in vivo		 Biogrid 11146440
LGALS3 CBP35 | GAL3 | GALBP | GALIG | LGALS2 | MAC2 凝集素，半乳糖苷结合，可溶性，3 - HPRD,BioGRID 1917996|8390986
|8813152|9501082
LGALS3BP 90k |BTBD17B |Mac-2-bp 凝集素，半乳糖苷结合，可溶性，3结合蛋白 - HPRD 9501082
MAP3K7IP2 FLJ21885 | KIAA0733 | TAB2 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶7相互作用蛋白2 - HPRD 14743216
nid1 nid nidogen 1 - HPRD 9501082
PHB2 bap |BCAP37 |BAP37 |MGC117268 |PNAS-141 |Rea |p22 禁止素2 一个ffinity Capture-MS Biogrid 17353931
传统 HS.89862 |MGC11078 TNFRSF1A-associated via death domain - HPRD 14743216


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
HOLLMANN APOPTOSIS VIA CD40 DN 267 178 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
deurig t细胞促进性白血病 368 234 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Horiuchi WTAP靶向 306 188 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL DN 275 168 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 3D UP 182 110 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Scibetta KDM5B靶向DN 81 55 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
HAHTOLA MYCOSIS FUNGOIDES SKIN DN 27 20 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Markey RB1急性lof 215 137 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN APOPTOSIS BY SERUM DEPRIVATION UP 552 347 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND SERUM DEPRIVATION UP 211 136 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN UP 612 367 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
LI AMPLIFIED IN LUNG CANCER 178 108 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
帕特森多西他赛电阻 29 20 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Wood EBV EBNA1靶向 110 71 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Dairkee Tert目标 380 213 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 UP 209 139 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
通过ELK3和HIF1A DN的缺氧总缺氧 103 71 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Koyama Sema3b靶向 292 168 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
NIKOLSKY BREAST CANCER 17Q21 Q25 AMPLICON 335 181 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Rozanov MMP14靶向 266 171 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
羔羊CCND1靶标 19 14 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
贝克莫昔芬的抵抗 50 36 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Radaeva对IFNA1的响应 52 40 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
LEE LIVER CANCER ACOX1 UP 64 40 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
SANA RESPONSE TO IFNG UP 78 50 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
sana tnf发出信号 83 56 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHAN MULTIPLE MYELOMA SPIKED 22 13 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
LEI MYB目标 318 215 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Lenaour树突状细胞成熟 114 84 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
VERHAAK AML WITH NPM1 MUTATED UP 183 111 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
BENNETT SYSTEMIC LUPUS ERYTHEMATOSUS 31 21 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
REN ALVEOLAR RHABDOMYOSARCOMA DN 408 274 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向DN 371 218 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindvall因TERT DN永生 80 56 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee衰老的新皮层 89 59 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
李小脑老化 84 58 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Liu Smarca4目标 64 39 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 77 50 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和内皮的钟分泌组 66 47 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
LEIN CHOROID PLEXUS MARKERS 103 61 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGINS TAMOXIFEN RESISTANCE DN 220 147 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee转移和替代剪接 74 51 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向 673 430 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
MARTINEZ TP53 TARGETS DN 593 372 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 78 49 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
TSAI对放射治疗的反应 32 20 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
ICHIBA GRAFT VERSUS HOST DISEASE D7 UP 107 67 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
CHEN METABOLIC SYNDROM NETWORK 1210 725 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
VALK AML WITH FLT3 ITD 40 22 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G56 DN 17 9 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K4Me3 162 80 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 128 68 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
FONTAINE FOLLICULAR THYROID ADENOMA UP 75 43 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
fontaine乳头状甲状腺癌 66 38 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
黄成人组织茎模块 721 492 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇12的时间反应12 79 54 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Nielsen Gist vs滑膜肉瘤DN 20 17 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
li诱导了自然杀手 307 182 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1靶向衰老 572 352 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 430 288 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG BOUND 36HR 29 23 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D 882 506 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang MLL目标 289 188 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
寄养KDM1A靶向 266 142 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
林乳腺干细胞DN 428 246 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
HECKER IFNB1 TARGETS 95 54 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway