基因页:Arhgdia
概括?
基因ID | 396 |
Symbol | Arhgdia |
同义词 | GDIA1 | HEL-S-47E | NPHS8 | RHOGDI | RHOGDI-1 |
描述 | RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha |
参考 | MIM:601925|HGNC:HGNC:678|Ensembl:ENSG00000141522|HPRD:03565|Vega:OTTHUMG00000178352 |
基因type | protein-coding |
地图位置 | 17q25.3 |
Pascal P值 | 0.799 |
Sherlock P值 | 0.342 |
Fetal beta | -0.63 |
支持 | EXOCYTOSIS COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | 系统搜索PubMed的共病的基因with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | Click to show details |
第一节遗传学和表观遗传学注释
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ARHGDIA_DE_GTEx.png)
基因expression during devlopment (BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
Top 10 positively co-expressed genes | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
C1QA | 0.49 | 0.41 |
C1QB | 0.49 | 0.44 |
暴利 | 0.48 | 0.41 |
SERPINA1 | 0.47 | 0.40 |
C1QC | 0.47 | 0.41 |
fcer1g | 0.46 | 0.40 |
GPR34 | 0.46 | 0.36 |
RGS10 | 0.46 | 0.43 |
NAPSB | 0.44 | 0.33 |
PLN | 0.44 | 0.23 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
SRGAP1 | -0.27 | -0.24 |
EIF2C4 | -0.26 | -0.22 |
Scube1 | -0.26 | -0.28 |
ATXN7L1 | -0.26 | -0.24 |
mycn | -0.26 | -0.24 |
GJC1 | -0.26 | -0.23 |
ZEB2 | -0.26 | -0.24 |
AL033532.1 | -0.26 | -0.25 |
BCORL1 | -0.26 | -0.26 |
KIAA1949 | -0.26 | -0.23 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ACTL6A | ACTL6 | Arp4 | BAF53A | INO80K | MGC5382 | actin-like 6A | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
Arhgdia | GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 | RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha | Reconstituted Complex | BioGRID | 11513578 |
BID | FP497 | MGC15319 | MGC42355 | BH3互动域死亡激动剂 | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
CASP10 | Alps2 |flice2 |MCH4 | caspase 10, apoptosis-related cysteine peptidase | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
CASP8 | ALPS2B | CAP4 | FLICE | FLJ17672 | MACH | MCH5 | MGC78473 | caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
CDC42 | cdc42hs |G25K | 细胞分裂周期42(GTP结合蛋白,25KDA) | - | HPRD | 10676816 |
CDC42 | cdc42hs |G25K | 细胞分裂周期42(GTP结合蛋白,25KDA) | 亲和力捕获ms | BioGRID | 17353931 |
CDKN1B | CDKN4 | KIP1 | MEN1B | MEN4 | P27KIP1 | 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(P27,KIP1) | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
DHX9 | ddx9 |LKP |ndhii |RHA | DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 9 | 亲和力捕获ms | BioGRID | 17353931 |
EIF2B1 | EIF-2B | EIF-2Balpha | EIF2B | EIF2BA | MGC117409 | MGC125868 | MGC125869 | eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 1 alpha, 26kDa | 亲和力捕获ms | BioGRID | 17353931 |
EWSR1 | EWS | 尤因肉瘤断裂点区域1 | 亲和力捕获ms | BioGRID | 17353931 |
EZR | CVIL | CVL | DKFZp762H157 | FLJ26216 | MGC1584 | VIL2 | ezrin | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
FADD | Gig3 |MGC8528 |Mort1 | FAS(TNFRSF6)通过死亡域关联 | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
fas | ALPS1A | APO-1 | APT1 | CD95 | FAS1 | FASTM | TNFRSF6 | Fas (TNF receptor superfamily, member 6) | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
fasLG | APT1LG1 | CD178 | CD95L | FASL | TNFSF6 | Fas ligand (TNF superfamily, member 6) | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
FEN1 | FEN-1 | MF1 | RAD2 | flap structure-specific endonuclease 1 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
HNRNPA3 | 2610510d13rik |D10S102 |fbrnp |HNRPA3 |MGC138232 |MGC142030 | 异质核核糖核蛋白A3 | 亲和力捕获ms | BioGRID | 17353931 |
HNRNPAB | ABBP1 | FLJ40338 | HNRPAB | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B | 亲和力捕获ms | BioGRID | 17353931 |
IGF2BP1 | CRD-BP | CRDBP | IMP-1 | IMP1 | VICKZ1 | ZBP1 | insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1 | 亲和力捕获ms | BioGRID | 17353931 |
JUP | ARVD12 |ctnng |dp3 |dpiii |PDGB |PKGB | junction plakoglobin | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
MAPK8 | JNK | JNK1 | JNK1A2 | JNK21B1/2 | PRKM8 | SAPK1 | mitogen-activated protein kinase 8 | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
MSN | - | Moesin | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
NEDD4L | FLJ33870 | KIAA0439 | NEDD4-2 | RSP5 | hNedd4-2 | 神经前体细胞表达,发育下调的4样细胞 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
PAK1 | MGC130000 | MGC130001 | PAKalpha | p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 1 | Pak1 interacts with and phosphorylates RhoGDI. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between Pak1 from an unspecified species and human RhoGDI. | BIND | 15225553 |
Rac1 | MGC111543 |Mig5 |TC-25 |P21-RAC1 | ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 (rho family, small GTP binding protein Rac1) | - | HPRD | 10346909|10673424 | 11513579 |
Rac1 | MGC111543 |Mig5 |TC-25 |P21-RAC1 | ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 (rho family, small GTP binding protein Rac1) | - | HPRD,Biogrid | 10673424 |
Rac2 | EN-7 |GX |HSPC022 | ras-related C3 botulinum toxin substrate 2 (rho family, small GTP binding protein Rac2) | - | HPRD | 11513578 |
RDX | DFNB24 | radixin | - | HPRD,Biogrid | 9287351 |
Rhoa | ARH12 |arha |Rho12 |RHOH12 | RAS同源基因家族,成员 | - | HPRD,Biogrid | 11149925 |
Rhoc | arh9 |ARHC |H9 |MGC1448 |MGC61427 |RHOH9 | RAS同源基因家族,成员C | 亲和力捕获ms | BioGRID | 17353931 |
Rhoh | ARHH | TTF | RAS同源基因家族,成员H | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11809807 |
SH3GL3 | CNSA3 | EEN-2B-L3 | EEN-B2 | HsT19371 | SH3D2C | SH3P13 | SH3域grb2状3 | 两个杂交 | BioGRID | 16169070 |
TNFRSF10B | CD262 | DR5 | KILLER | KILLER/DR5 | TRAIL-R2 | TRAILR2 | TRICK2 | TRICK2A | TRICK2B | TRICKB | ZTNFR9 | 肿瘤坏死因子受体超家族,成员10b | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
TNFRSF1A | CD120a | FPF | MGC19588 | TBP1 | TNF-R | TNF-R-I | TNF-R55 | TNFAR | TNFR1 | TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 | 肿瘤坏死因子受体超家族,成员1a | Co-purification | BioGRID | 15659383 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
KEGG NEUROTROPHIN SIGNALING PATHWAY | 126 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG VASOPRESSIN REGULATED WATER REABSORPTION | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID RHOA REG PATHWAY | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CDC42 PATHWAY | 70 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CDC42 REG途径 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P75 NTR PATHWAY | 69 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PDGFRB PATHWAY | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID THROMBIN PAR1 PATHWAY | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID RAC1 REG PATHWAY | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Rac1途径 | 54 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNALING BY RHO GTPASES | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME P75 NTR RECEPTOR MEDIATED SIGNALLING | 81 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WILCOX RESPONSE TO PROGESTERONE DN | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GARY CD5 TARGETS UP | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RODRIGUES DCC TARGETS DN | 121 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SENESE HDAC1 TARGETS UP | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE NEURAL CREST STEM CELL UP | 146 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM WT1 TARGETS 8HR UP | 164 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM WT1 TARGETS 12HR UP | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ELVIDGE HYPOXIA DN | 146 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHLOSSER SERUM RESPONSE AUGMENTED BY MYC | 108 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WOOD EBV EBNA1 TARGETS UP | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LOPEZ MBD TARGETS | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AMIT EGF RESPONSE 240 HELA | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AMIT EGF RESPONSE 480 HELA | 164 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN APC TARGETS | 77 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Weigel氧化应激反应 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WEIGEL OXIDATIVE STRESS BY HNE AND H2O2 | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MURAKAMI UV RESPONSE 6HR UP | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verrecchia对TGFB1 C2的反应 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MACLACHLAN BRCA1 TARGETS UP | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAJATE RESPONSE TO TRABECTEDIN DN | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verrecchia对TGFB1的早期反应 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G4 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND ENDOTHELIUM | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND FIBROBLAST | 132 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ITO PTTG1靶向DN | 9 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHANG BREAST CANCER PROGENITORS DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRADE COLON CANCER UP | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JIANG TIP30 TARGETS DN | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HINATA NFKB TARGETS KERATINOCYTE UP | 91 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HINATA NFKB TARGETS FIBROBLAST UP | 84 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 14 | 143 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LINSLEY MIR16 TARGETS | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LOPEZ TRANSLATION VIA FN1 SIGNALING | 35 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |