概括?
基因ID 396
Symbol Arhgdia
同义词 GDIA1 | HEL-S-47E | NPHS8 | RHOGDI | RHOGDI-1
描述 RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha
参考 MIM:601925|HGNC:HGNC:678|Ensembl:ENSG00000141522|HPRD:03565|Vega:OTTHUMG00000178352
基因type protein-coding
地图位置 17q25.3
Pascal P值 0.799
Sherlock P值 0.342
Fetal beta -0.63
支持 EXOCYTOSIS
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统搜索PubMed的共病的基因with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
C1QA 0.49 0.41
C1QB 0.49 0.44
暴利 0.48 0.41
SERPINA1 0.47 0.40
C1QC 0.47 0.41
fcer1g 0.46 0.40
GPR34 0.46 0.36
RGS10 0.46 0.43
NAPSB 0.44 0.33
PLN 0.44 0.23
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
SRGAP1 -0.27 -0.24
EIF2C4 -0.26 -0.22
Scube1 -0.26 -0.28
ATXN7L1 -0.26 -0.24
mycn -0.26 -0.24
GJC1 -0.26 -0.23
ZEB2 -0.26 -0.24
AL033532.1 -0.26 -0.25
BCORL1 -0.26 -0.26
KIAA1949 -0.26 -0.23

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ACTL6A ACTL6 | Arp4 | BAF53A | INO80K | MGC5382 actin-like 6A 两个杂交 BioGRID 16169070
Arhgdia GDIA1 |MGC117248 |Rhogdi |Rhogdi-1 RHO GDP解离抑制剂(GDI)alpha Reconstituted Complex BioGRID 11513578
BID FP497 | MGC15319 | MGC42355 BH3互动域死亡激动剂 Co-purification BioGRID 15659383
CASP10 Alps2 |flice2 |MCH4 caspase 10, apoptosis-related cysteine peptidase Co-purification BioGRID 15659383
CASP8 ALPS2B | CAP4 | FLICE | FLJ17672 | MACH | MCH5 | MGC78473 caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 Co-purification BioGRID 15659383
CDC42 cdc42hs |G25K 细胞分裂周期42(GTP结合蛋白,25KDA) - HPRD 10676816
CDC42 cdc42hs |G25K 细胞分裂周期42(GTP结合蛋白,25KDA) 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
CDKN1B CDKN4 | KIP1 | MEN1B | MEN4 | P27KIP1 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1B(P27,KIP1) 两个杂交 BioGRID 16169070
DHX9 ddx9 |LKP |ndhii |RHA DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 9 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
EIF2B1 EIF-2B | EIF-2Balpha | EIF2B | EIF2BA | MGC117409 | MGC125868 | MGC125869 eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 1 alpha, 26kDa 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
EWSR1 EWS 尤因肉瘤断裂点区域1 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
EZR CVIL | CVL | DKFZp762H157 | FLJ26216 | MGC1584 | VIL2 ezrin Co-purification BioGRID 15659383
FADD Gig3 |MGC8528 |Mort1 FAS(TNFRSF6)通过死亡域关联 Co-purification BioGRID 15659383
fas ALPS1A | APO-1 | APT1 | CD95 | FAS1 | FASTM | TNFRSF6 Fas (TNF receptor superfamily, member 6) Co-purification BioGRID 15659383
fasLG APT1LG1 | CD178 | CD95L | FASL | TNFSF6 Fas ligand (TNF superfamily, member 6) Co-purification BioGRID 15659383
FEN1 FEN-1 | MF1 | RAD2 flap structure-specific endonuclease 1 两个杂交 BioGRID 16169070
HNRNPA3 2610510d13rik |D10S102 |fbrnp |HNRPA3 |MGC138232 |MGC142030 异质核核糖核蛋白A3 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
HNRNPAB ABBP1 | FLJ40338 | HNRPAB heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
IGF2BP1 CRD-BP | CRDBP | IMP-1 | IMP1 | VICKZ1 | ZBP1 insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
JUP ARVD12 |ctnng |dp3 |dpiii |PDGB |PKGB junction plakoglobin 两个杂交 BioGRID 16169070
MAPK8 JNK | JNK1 | JNK1A2 | JNK21B1/2 | PRKM8 | SAPK1 mitogen-activated protein kinase 8 Co-purification BioGRID 15659383
MSN - Moesin Co-purification BioGRID 15659383
NEDD4L FLJ33870 | KIAA0439 | NEDD4-2 | RSP5 | hNedd4-2 神经前体细胞表达,发育下调的4样细胞 两个杂交 BioGRID 16169070
PAK1 MGC130000 | MGC130001 | PAKalpha p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 1 Pak1 interacts with and phosphorylates RhoGDI. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between Pak1 from an unspecified species and human RhoGDI. BIND 15225553
Rac1 MGC111543 |Mig5 |TC-25 |P21-RAC1 ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 (rho family, small GTP binding protein Rac1) - HPRD 10346909|10673424 | 11513579
Rac1 MGC111543 |Mig5 |TC-25 |P21-RAC1 ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 (rho family, small GTP binding protein Rac1) - HPRD,Biogrid 10673424
Rac2 EN-7 |GX |HSPC022 ras-related C3 botulinum toxin substrate 2 (rho family, small GTP binding protein Rac2) - HPRD 11513578
RDX DFNB24 radixin - HPRD,Biogrid 9287351
Rhoa ARH12 |arha |Rho12 |RHOH12 RAS同源基因家族,成员 - HPRD,Biogrid 11149925
Rhoc arh9 |ARHC |H9 |MGC1448 |MGC61427 |RHOH9 RAS同源基因家族,成员C 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
Rhoh ARHH | TTF RAS同源基因家族,成员H Affinity Capture-Western BioGRID 11809807
SH3GL3 CNSA3 | EEN-2B-L3 | EEN-B2 | HsT19371 | SH3D2C | SH3P13 SH3域grb2状3 两个杂交 BioGRID 16169070
TNFRSF10B CD262 | DR5 | KILLER | KILLER/DR5 | TRAIL-R2 | TRAILR2 | TRICK2 | TRICK2A | TRICK2B | TRICKB | ZTNFR9 肿瘤坏死因子受体超家族,成员10b Co-purification BioGRID 15659383
TNFRSF1A CD120a | FPF | MGC19588 | TBP1 | TNF-R | TNF-R-I | TNF-R55 | TNFAR | TNFR1 | TNFR55 | TNFR60 | p55 | p55-R | p60 肿瘤坏死因子受体超家族,成员1a Co-purification BioGRID 15659383


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG NEUROTROPHIN SIGNALING PATHWAY 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG VASOPRESSIN REGULATED WATER REABSORPTION 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RHOA REG PATHWAY 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CDC42 PATHWAY 70 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CDC42 REG途径 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR PATHWAY 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB PATHWAY 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID THROMBIN PAR1 PATHWAY 43 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RAC1 REG PATHWAY 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Rac1途径 54 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY RHO GTPASES 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME P75 NTR RECEPTOR MEDIATED SIGNALLING 81 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WILCOX RESPONSE TO PROGESTERONE DN 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS UP 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES DCC TARGETS DN 121 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE NEURAL CREST STEM CELL UP 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 8HR UP 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 12HR UP 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA DN 146 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLOSSER SERUM RESPONSE AUGMENTED BY MYC 108 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOOD EBV EBNA1 TARGETS UP 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 240 HELA 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN APC TARGETS 77 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weigel氧化应激反应 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEIGEL OXIDATIVE STRESS BY HNE AND H2O2 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MURAKAMI UV RESPONSE 6HR UP 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C2的反应 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MACLACHLAN BRCA1 TARGETS UP 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAJATE RESPONSE TO TRABECTEDIN DN 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1的早期反应 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G4 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND ENDOTHELIUM 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND FIBROBLAST 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ITO PTTG1靶向DN 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG BREAST CANCER PROGENITORS DN 145 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG TIP30 TARGETS DN 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS KERATINOCYTE UP 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS FIBROBLAST UP 84 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 14 143 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINSLEY MIR16 TARGETS 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ TRANSLATION VIA FN1 SIGNALING 35 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因