SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因ID	3983
Symbol	ABLIM1
同义词	ABLIM\|LIMAB1\|LIMATIN\|abLIM-1
描述	肌动蛋白结合林蛋白1
参考	MIM:602330\|HGNC：HGNC：78\|Ensembl:ENSG00000099204\|HPRD:03819\|Vega:OTTHUMG00000019088
基因type	protein-coding
地图位置	10q25
Pascal P值	0.122
Sherlock P值	0.843
Fetal beta	-0.71
DMG	1（＃研究）
eGene	迈尔斯的顺式和跨性别
支持	STRUCTURAL PLASTICITY G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_TAP-PSD-95-CORE G2Cdb.humanNRC COMPOSITESET Potential synaptic genes

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG:Wockner_2014	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24).	1
PMID:cooccur	高通量文献搜索	系统的海rch in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

Differentially methylated gene

探测	Chromosome	Position	Nearest gene	P (dis)	beta（dis）	FDR (dis)	Study
CG12649038	10	116282534	ABLIM1	2.72E-5	0.502	0.018	DMG:Wockner_2014

eQTL annotation

SNP ID	Chromosome	Position	eGene	基因Entrez ID	qvalue	eQTL type
rs16829545	chr2	151977407	ABLIM1	3983	7.857E-9	trans
RS3845734	chr2	171125572	ABLIM1	3983	0	trans
rs7584986	chr2	184111432	ABLIM1	3983	6.216E-6	trans
rs2183142	chr4	159232695	ABLIM1	3983	0.13	trans
RS9461864	chr6	33481468	ABLIM1	3983	0.15	trans
rs3118341	chr9	25185518	ABLIM1	3983	0.06	trans
RS16955618	chr15	29937543	ABLIM1	3983	2.44e-16	trans
rs1041786	chr21	22617710	ABLIM1	3983	4.22E-4	trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
FAM59A	0.90	0.86
CTTNBP2	0.90	0.85
RP1-21O18.1	0.89	0.86
LIMCH1	0.89	0.85
OSBPL10	0.89	0.86
GPD1L	0.89	0.87
TIAM2	0.89	0.88
AFF3	0.89	0.88
WASF1	0.88	0.86
TBR1	0.88	0.86

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
SERPINB6	-0.67	-0.73
RHOC	-0.62	-0.77
HSD17B14	-0.61	-0.75
BDH2	-0.59	-0.71
法	-0.58	-0.68
S100A16	-0.58	-0.73
TTYH1	-0.57	-0.64
AF347015.31	-0.57	-0.72
DBI	-0.57	-0.76
FXYD1	-0.57	-0.72

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
开始	KIAA1446	brain-enriched guanylate kinase-associated homolog (rat)	两个杂交	BioGRID	16189514
CALCOCO2	MGC17318 \| NDP52	钙结合和盘绕螺旋结构域2	两个杂交	BioGRID	16189514
GOLGA2	GM130 \|MGC20672	golgi autoantigen, golgin subfamily a, 2	两个杂交	BioGRID	16189514
钩2	FLJ26218 \| HK2	钩同源2（果蝇）	两个杂交	BioGRID	16189514
KCNJ12	FLJ14167 \| IRK2 \| KCNJN1 \| Kir2.2 \| Kir2.2v \| hIRK \| hIRK1 \| hkir2.2x \| kcnj12x	钾内切割通道，亚家族J，成员12	-	HPRD，Biogrid	15024025
KRT15	CK15 \| K15 \| K1CO	keratin 15	两个杂交	BioGRID	16189514
LDOC1	bcur1 \|mar7 \|mart7	leucine zipper, down-regulated in cancer 1	Affinity Capture-Western 两个杂交	BioGRID	16189514
SFN	是的	stratifin	亲和力捕获ms	BioGRID	15778465
TRAF2	MGC:45012 \| TRAP \| TRAP3	TNF receptor-associated factor 2	两个杂交	BioGRID	16189514
TSC22D4	THG-1 \| THG1	TSC22 domain family, member 4	两个杂交	BioGRID	16189514
USHBP1	AIEBP \| FLJ38709 \| FLJ90681 \| MCC2	亚瑟综合征1 c结合蛋白1	两个杂交	BioGRID	16189514
vim	FLJ36605	vimentin	两个杂交	BioGRID	16189514

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
KEGG AXON GUIDANCE	129	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学	396	292	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME AXON GUIDANCE	251	188	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NETRIN1 SIGNALING	41	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DCC介导的有吸引力的信号	13	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN	526	357	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN	349	157	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN	663	425	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gal白血病干细胞向上	133	78	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAEGER METASTASIS DN	258	141	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 10D UP	194	122	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 AND HDAC2 TARGETS DN	232	139	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC3 TARGETS DN	536	332	该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌	1821	933	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN	805	505	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS DN	781	465	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION KRAS DN	142	95	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 3 DN	229	142	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤DN	67	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS F UP	185	119	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN	394	258	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLOSSER SERUM RESPONSE AUGMENTED BY MYC	108	74	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATTIOLI MULTIPLE MYELOMA WITH 14Q32 TRANSLOCATIONS	36	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN	514	330	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SOX2 TARGETS	734	436	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI PRE BI LYMPHOCYTE DN	77	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI PLASMA CELL DN	33	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE TARGETS OF PTCH1 AND SUFU DN	83	69	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN	464	276	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cheok对高清MTX的反应	23	13	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA MF UP	47	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK AML WITH NPM1 MUTATED DN	246	180	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION	405	264	该途径中的所有SZGR 2.0基因
对顺铂的反应	22	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL LONG TERM	302	191	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAMALHO STEMNESS DN	74	55	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAMASWAMY METASTASIS DN	61	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP	1691年	1088	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRACHAT RESPONSE TO METHOTREXATE UP	26	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAAB HEART ATRIUM VS VENTRICLE DN	261	183	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN	245	144	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C5	46	36	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 24HR UP	148	96	该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱	393	244	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG BOUND BY FOXP3	491	310	该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）瞄准	388	234	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP	476	285	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN	546	362	该途径中的所有SZGR 2.0基因
mirlet7a3的Brueckner目标	111	69	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI炎症反应LPS DN	23	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN	435	289	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES	389	245	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存	73	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标	535	325	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 0	76	54	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZEMBUTSU SENSITIVITY TO VINCRISTINE	19	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NIELSEN LEIOMYOSARCOMA DN	18	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应	87	66	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin DN的反应	88	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG METASTASIS OF BREAST CANCER ESR1 DN	30	18	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FIGUEROA AML METHYLATION CLUSTER 1 UP	125	61	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FIGUEROA AML METHYLATION CLUSTER 2 UP	54	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FIGUEROA AML METHYLATION CLUSTER 3 UP	170	97	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FIGUEROA AML METHYLATION CLUSTER 4 UP	112	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6	140	81	该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇7	118	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN	1972年	1213	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向	682	433	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3	824	528	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN	1080	713	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KATSANOU ELAVL1 TARGETS UP	169	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG BOUND 8D	658	397	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN	244	157	该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定	517	302	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：ABLIM1