基因页：LIMK2
Summary？
| GeneID | 3985 |
| Symbol | LIMK2 |
| 同义词 | - |
| 描述 | LIM域激酶2 |
| 参考 | MIM：601988|HGNC：HGNC：6614|ENSEMBL：ENSG00000182541|HPRD:03585|Vega：Otthumg00000151251 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 22q12.2 |
| Pascal P值 | 0.012 |
| Sherlock P值 | 0.696 |
| 胎儿β | 0.782 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | Psr: 0.031 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG00518989 | 22 | 31608519 | LIMK2 | -0.026 | 0.25 | DMG：Nishioka_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6896924 | CHR5 | 128995117 | LIMK2 | 3985 | 0.16 | 反式 | ||
| RS17111364 | Chr10 | 97901813 | LIMK2 | 3985 | 0.02 | 反式 | ||
| RS10841420 | CHR12 | 20136526 | LIMK2 | 3985 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0004672 | 蛋白激酶活性 | IEA | - | |
| 去：0004674 | protein serine/threonine kinase activity | 塔斯 | 8537403 | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
| GO：0042325 | 调节磷酸化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | 塔斯 | 8954941 | |
| 去：0005737 | cytoplasm | IEA | - | |
| 去：0005737 | cytoplasm | 塔斯 | 8537403|8954941 | |
| 去：0005739 | 线粒体 | 艾达 | 18029348 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-135 | 124 | 130 | M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
| HSA-MIR-135B | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
| mir-194 | 280 | 286 | M8 | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |
| mir-27 | 236 | 242 | 1a | HSA-MIR-27A脑 | uucacaguggcuaaguuccgc |
| HSA-MIR-27B脑 | uucacaguggcuaaguucugc | ||||