SZGR2 - Beplay体育中心

概括？

基因	4000
象征	LMNA
同义词	cdcd1 \| cddc \| cmd1a \| cmt2b1 \| emd2 \| fpl \| fpld \| fpld2 \| hgps \| idc \| idc \| ldp1 \| lfp \| lgmd1b \| lmn1 \| lmnc \| lmnc \| lmnl1 \| lmnl1 \| pro1 \| pro1 \| pro1
描述	lamin a/c
参考	MIM：150330\|HGNC：HGNC：6636\|ENSEMBL：ENSG00000160789\|HPRD：01035\|Vega：Otthumg0000000013961
基因类型	蛋白质编码
地图位置	1q22
Sherlock P值	0.912
胎儿β	-0.455
主持人	迈尔斯的顺式和跨性别元

数据源中的基因

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
PMID：cooccur	高通量文献搜索	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I	基因组扫描荟萃分析	PSR：0.0235
GSMA_IIA	基因组扫描荟萃分析（所有样品）	PSR：0.00814
表达	基因表达的荟萃分析	p价值：1.52
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	点击显示详细信息
网络	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	PPI网络中最短路径的贡献：0.0545

第一节遗传学和表观遗传学注释

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	QVALUE	EQTL类型
RS7022505	Chr9	121213148	LMNA	4000	0.17	反式
RS289799	CHR15	63720989	LMNA	4000	0.04	反式
RS4501739	Chrx	35960848	LMNA	4000	0.02	反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
ptk2b	0.67	0.59
NRIP3	0.66	0.64
SUSD4	0.65	0.58
myo18b	0.64	0.49
esyt3	0.64	0.59
tuba8	0.63	0.62
OGDHL	0.63	0.56
SGPP2	0.62	0.56
哦	0.62	0.58
STEAP3	0.61	0.48

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
RBMX2	-0.31	-0.31
anp32c	-0.29	-0.34
GTF3C6	-0.28	-0.27
plekho1	-0.28	-0.17
RPS20	-0.27	-0.35
carhsp1	-0.27	-0.29
AC005393.1	-0.27	-0.19
RPL27A	-0.27	-0.35
RPL18	-0.26	-0.30
C9orf46	-0.26	-0.30

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005515	蛋白质结合	IPI		11801724
去：0005198	结构分子活性	IEA		-
细胞分量	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005882	中间细丝	IEA		-
去：0005634	核	艾达		18029348
去：0005634	核	IEA		-
去：0005737	细胞质	艾达		18029348
去：0005886	质膜	艾达		18029348

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	官方全名b	实验	来源	PubMed ID
Alox12	12-lox \|12s-lox \|log12	蛛网酸12-脂氧合酶	12-lox与层lamin A相互作用。	绑定	10727209
Alox12	12-lox \|12s-lox \|log12	蛛网酸12-脂氧合酶	-	HPRD，Biogrid	10727209
Alox12b	12r-lox	蛛网酸12-脂氧合酶，12R类型	-	HPRD	10727209
EMD	EDMD \|lemd5 \|Sta	Emerin	-	HPRD，Biogrid	10673356\|11173535
Kat5	esa1 \|htatip \|htatip1 \|plip \|提示\|TIP60 \|CPLA2	K（赖氨酸）乙酰转移酶5	两个杂交	Biogrid	16169070
LMNA	cdcd1 \|CDDC \|cmd1a \|CMT2B1 \|emd2 \|fpl \|fpld \|HGPS \|IDC \|LDP1 \| LFP \| LGMD1B \| LMN1 \| LMNC \| PRO1	lamin a/c	Lamin C与Lamin A相互作用。	绑定	7628545
LMNA	cdcd1 \|CDDC \|cmd1a \|CMT2B1 \|emd2 \|fpl \|fpld \|HGPS \|IDC \|LDP1 \| LFP \| LGMD1B \| LMN1 \| LMNC \| PRO1	lamin a/c	Lamin C与椎板C相互作用。	绑定	7628545
LMNA	cdcd1 \|CDDC \|cmd1a \|CMT2B1 \|emd2 \|fpl \|fpld \|HGPS \|IDC \|LDP1 \| LFP \| LGMD1B \| LMN1 \| LMNC \| PRO1	lamin a/c	-	HPRD	11792809
LMNA	cdcd1 \|CDDC \|cmd1a \|CMT2B1 \|emd2 \|fpl \|fpld \|HGPS \|IDC \|LDP1 \| LFP \| LGMD1B \| LMN1 \| LMNC \| PRO1	lamin a/c	Lamin A与自身相互作用以形成同型二聚体。	绑定	7628545
LMNA	cdcd1 \|CDDC \|cmd1a \|CMT2B1 \|emd2 \|fpl \|fpld \|HGPS \|IDC \|LDP1 \| LFP \| LGMD1B \| LMN1 \| LMNC \| PRO1	lamin a/c	预胺A与Lamin A相互作用。	绑定	7628545
LMNA	cdcd1 \|CDDC \|cmd1a \|CMT2B1 \|emd2 \|fpl \|fpld \|HGPS \|IDC \|LDP1 \| LFP \| LGMD1B \| LMN1 \| LMNC \| PRO1	lamin a/c	预胺A与自身相互作用以形成同型二聚体。	绑定	7628545
LMNA	cdcd1 \|CDDC \|cmd1a \|CMT2B1 \|emd2 \|fpl \|fpld \|HGPS \|IDC \|LDP1 \| LFP \| LGMD1B \| LMN1 \| LMNC \| PRO1	lamin a/c	预胺A与lamin C相互作用。	绑定	7628545
LMNB1	ADLD \|LMN \|lmn2 \|lmnb \|MGC111419	Lamin B1	Lamin A与Lamin B1相互作用。	绑定	7628545
LMNB1	ADLD \|LMN \|lmn2 \|lmnb \|MGC111419	Lamin B1	预胺A与lamin b1相互作用。	绑定	7628545
LMNB1	ADLD \|LMN \|lmn2 \|lmnb \|MGC111419	Lamin B1	-	HPRD，Biogrid	11792809
LMNB1	ADLD \|LMN \|lmn2 \|lmnb \|MGC111419	Lamin B1	Lamin C与lamin B1相互作用。	绑定	7628545
纳夫	DKFZP434G0420 \|FLJ10067 \|IOP2	核预胺识别因素	-	HPRD，Biogrid	10514485
prkca	AAG6 \|MGC129900 \|MGC129901 \|PKC-Alpha \|PKCA \|Prkaca	蛋白激酶C，α	-	HPRD，Biogrid	12112001
RB1	OSRC \|RB \|P105-RB \|PRB \|PP110	视网膜细胞瘤1	-	HPRD，Biogrid	8058329\|8278403
RB1	OSRC \|RB \|P105-RB \|PRB \|PP110	视网膜细胞瘤1	RB与层固定C相互作用	绑定	12475961
SREBF1	SREBP-1C \|SREBP1 \|BHLHD1	固醇调节元件结合转录因子1	-	HPRD，Biogrid	11929849
Syne1	8b \|CPG2 \|DKFZP781J13156 \|FLJ30878 \|FLJ41140 \|KIAA0796 \|KIAA1262 \|KIAA1756 \|myne1 \|疤痕8	光谱重复包含核包膜1	-	HPRD，Biogrid	11801724
TMPO	CMD1T \|lap2 \|LEMD4 \|MGC61508 \|Pro0868 \|TP	胸腺激素	-	HPRD，Biogrid	10984438\|12475961
tor1aip1	DKFZP586G011 \|FLJ13142 \|lap1b \|MGC3413	Torsin A相互作用蛋白1	-	HPRD，Biogrid	8324822
URB2	KIAA0133 \|MGC138837 \|MGC138838 \|NPA2	URB2核糖体生物发生2同源物（S. cerevisiae）	Lamin A与LCO1相互作用。	绑定	15265697
URB2	KIAA0133 \|MGC138837 \|MGC138838 \|NPA2	URB2核糖体生物发生2同源物（S. cerevisiae）	-	HPRD	15265697
URB2	KIAA0133 \|MGC138837 \|MGC138838 \|NPA2	URB2核糖体生物发生2同源物（S. cerevisiae）	Lamin C与LCO1相互作用。	绑定	15265697
ZNF239	Hok-2 \|MOK2	锌指蛋白239	-	HPRD，Biogrid	12409453

V.途径注释

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
KEGG肥厚性心肌病HCM	85	65	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG心律失常右心肌病ARVC	76	59	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG扩张心肌病	92	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta caspase途径	23	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta FAS途径	30	22	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Hivnef途径	58	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡塔尔死亡道路	33	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TNFR1途径	29	21	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID caspase途径	52	39	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡的细胞蛋白裂解	40	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome减数分裂	116	81	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞周期	421	253	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖尿病途径	133	91	该途径中的所有SZGR 2.0基因
XBP1对伴侣基因的反应组激活	46	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome展开的蛋白质反应	80	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome染色体维护	122	80	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡	148	94	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Meiotic Synapsis	73	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome凋亡执行阶段	54	37	该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN	663	425	该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病	1382	904	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN	335	193	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer PTHLH靶向DN	73	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标	329	219	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与正常静止	87	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML分割与正常静止	181	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN	781	465	该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡	239	157	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kerley对Cisplatin的反应	44	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1	229	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移DN	261	155	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN	428	306	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标	230	156	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因	648	385	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN APC目标	77	55	该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯（Fernandez）由迈克（Myc）约束	182	116	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans	882	572	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1本地化的Alcalay AML	140	83	该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变	183	111	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤	412	249	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移DN	81	58	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iglesias E2F目标	151	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟	92	58	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时DN	86	62	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向	56	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN	298	200	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mahajan对IL1A DN的反应	76	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病	1691年	1088	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 8小时DN	53	40	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen PDGF目标	19	9	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向	100	72	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN	128	93	该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组	132	93	该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN	409	268	该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射2G后的生存率不佳	171	96	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上	863	514	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头	126	92	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK精子细胞	72	55	该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应	342	220	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应	346	192	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向	395	249	该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络	1210	725	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 UP	113	70	该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束	1103	714	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应17	181	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m	216	124	该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手	307	182	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标增长	243	155	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合	567	365	该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向	295	155	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向DN	242	146	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向	682	433	该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D	882	506	该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A	182	108	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应	166	97	该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族	目标位置			mirna id	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	mirna id	mirna seq
mir-124.1	284	291	1A，M8	HSA-MIR-124A	UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506	284	290	1a	HSA-MIR-506	uaaggcacccuucugugaguaga
mir-124/506	284	290	1a	HSA-MIR-124^脑	UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-129-5p	196	203	1A，M8	HSA-MIR-129^脑	cuuuuugcgguggggcuugc
mir-129-5p	196	203	1A，M8	HSA-MIR-129-5P	cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-205	180	186	1a	HSA-MIR-205	uccuucauucccggagucug
mir-450	196	202	1a	HSA-MIR-450	uuuuugcgauguuccuaaua
mir-9	293	300	1A，M8	HSA-MIR-9^SZ	ucuuuguuaucuagcuguauga
mir-9	293	300	1A，M8	HSA-MIR-9^SZ	ucuuuguuaucuagcuguauga

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击这里查看与SZ相关的miRNA列表。
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击这里查看与大脑相关的miRNA列表。

基因页：LMNA

第一节遗传学和表观遗传学注释

EQTL注释

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

时间变化的基因表达（brainspan）

大脑区域的顶级共表达基因

第三节。基因本体论注释

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

V.途径注释

第六节。microRNA注释