基因页面:SERTM1
总结吗?
| GeneID | 400120年 |
| 象征 | SERTM1 |
| 同义词 | C13orf36 |
| 描述 | 丝氨酸丰富和跨膜域包含1 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 33792|运用:ENSG00000180440|HPRD: 14219|织女:OTTHUMG00000016735 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 13 q13.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.905 |
| 胎儿β | -2.475 |
| eGene | 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs12428026 | chr13 | 30107962 | C13orf36 | 400120年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs3011605 | chr13 | 30111727 | C13orf36 | 400120年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs2989594 | chr13 | 30111749 | C13orf36 | 400120年 | 0.02 | 反式 | ||
| rs476506 | chr13 | 30138035 | C13orf36 | 400120年 | 0.04 | 反式 | ||
| rs1877463 | chr13 | 30147595 | C13orf36 | 400120年 | 0.07 | 反式 | ||
| rs280933 | chr13 | 30154545 | C13orf36 | 400120年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs280936 | chr13 | 30156316 | C13orf36 | 400120年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs166828 | chr13 | 30157038 | C13orf36 | 400120年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs9602618 | 13 | 36838074 | SERTM1 | ENSG00000180440.3 | 2.20289 e - | 0.01 | -409975年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 罗德里格斯甲状腺未分化癌DN | 537年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |