概括
基因 4008
象征 LMO7
同义词 FBX20 | FBXO20 | LOMP
描述 LIM域7
参考 MIM:604362|HGNC:HGNC:6646|ENSEMBL:ENSG00000136153|HPRD:05078|Vega:Otthumg0000000017093
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q22.2
Pascal P值 0.501
Sherlock P值 0.498
胎儿β -1.21
DMG 2(#研究)
主持人 尾状基底神经节
支持 COMPOSITESET
Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06946543 13 76377366 LMO7 1.499E-4 0.375 0.032 DMG:Wockner_2014
CG08579070 13 76210054 LMO7 8.21E-9 -0.009 3.88e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CCDC28A 0.74 0.75
AK5 0.74 0.79
SYN2 0.73 0.75
tspyl2 0.70 0.74
KLK7 0.70 0.69
MUM1L1 0.70 0.80
ATP6V1H 0.70 0.70
EPDR1 0.69 0.77
anxa7 0.69 0.79
KCTD4 0.69 0.71
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SH3BP2 -0.46 -0.61
Bcl7c -0.45 -0.60
SH2B2 -0.45 -0.59
透明2 -0.44 -0.56
SH2D2A -0.44 -0.54
KIAA1949 -0.43 -0.43
PKN1 -0.43 -0.47
tubb2b -0.43 -0.50
traf4 -0.42 -0.51
SMTN -0.42 -0.53

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg粘附交界处 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冷吉非替尼抵抗DN 230 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性LOF DN 228 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Baris甲状腺癌DN 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节 87 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYCN扩增靶向DN 103 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过HIF1A DN的缺氧总缺氧 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成11 57 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未经注释 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn暂时TGFB1签名 109 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇8的时间反应8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染30分钟DN 150 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时DN 91 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yuan Znf143合作伙伴 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工3的PEDERSEN转移3 20 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO上皮分化模块 69 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma ns 162 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 3类由EGF瞬时诱导 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因