基因页:Linc00242
概括?
基因 | 401288 |
象征 | Linc00242 |
同义词 | c6orf122 | ncrna00242 | dj266l20.5 |
描述 | 长基因间非蛋白质编码RNA 242 |
参考 | HGNC:HGNC:21249|ENSEMBL:ENSG00000229214|HPRD:16657| |
基因类型 | ncRNA |
地图位置 | 6Q27 |
Pascal P值 | 0.565 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG26526596 | 6 | 170190117 | Linc00242 | 9.42e-8 | -0.013 | 2.13e-5 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LINC00242_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
figueroa aml甲基化簇1 DN | 48 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇2 DN | 9 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇3 dn | 42 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇6 dn | 38 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |