基因页:熏鲑鱼
概括?
基因 | 4015 |
象征 | 熏鲑鱼 |
同义词 | - |
描述 | 赖氨酸氧化酶 |
参考 | MIM:153455|HGNC:HGNC:6664|Ensembl:ENSG00000113083|HPRD:01087|Vega:Otthumg00000128914 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5q23.2 |
Pascal P值 | 0.789 |
胎儿β | 0.562 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG11960393 | 5 | 121414172 | 熏鲑鱼 | 2.672E-4 | 1.096 | 0.038 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MGA | 0.95 | 0.96 |
KDM5A | 0.95 | 0.96 |
BTBD7 | 0.95 | 0.95 |
CHD9 | 0.94 | 0.95 |
ZKSCAN1 | 0.93 | 0.93 |
USP24 | 0.93 | 0.95 |
ZNF192 | 0.93 | 0.95 |
SMG1 | 0.93 | 0.95 |
TAF1 | 0.93 | 0.95 |
baz1b | 0.93 | 0.94 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ifi27 | -0.65 | -0.78 |
AF347015.31 | -0.64 | -0.77 |
MT-CO2 | -0.63 | -0.77 |
FXYD1 | -0.63 | -0.76 |
higd1b | -0.62 | -0.78 |
CXCL14 | -0.61 | -0.75 |
myl3 | -0.61 | -0.75 |
C5orf53 | -0.61 | -0.65 |
AF347015.27 | -0.60 | -0.72 |
增强 | -0.60 | -0.77 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房小叶癌与导管正常 | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN | 74 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌先进与早期 | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 | 182 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹间皮瘤生存最差与最好的 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN | 232 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC2靶向DN | 133 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标8小时DN | 129 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
埃尔维奇缺氧 | 171 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DMOG的Elvidge缺氧 | 130 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Elvidge Hif1a靶向DN | 91 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Elvidge HIF2A靶向 | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Elvidge HIF1A和HIF2A靶向DN | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化cdc25 | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karakas TGFB1信号传导 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 | 229 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LE EGR2目标DN | 108 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
量缺氧 | 98 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen malignat纤维组织细胞瘤 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克道尔急性肺损伤 | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成8 | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时DN | 91 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
汉·詹克(Han Jnk)唱歌 | 35 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 UP | 49 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
URS脂肪细胞分化DN | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
转移DN期间的clasper淋巴管 | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞 | 156 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe TGFB1靶向 | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Thum mir21靶向心脏病 | 17 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冬季缺氧metagene | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
cro骨基质刺激 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
woo肝癌复发 | 105 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇0的时间反应0 | 76 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村脂肪形成早期DN | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村脂肪形成晚期DN | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手DN | 116 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转换签名 | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi缺氧 | 140 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Steger脂肪形成DN | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
anastassiou癌症间充质过渡特征 | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |