概括
基因 4015
象征 熏鲑鱼
同义词 -
描述 赖氨酸氧化酶
参考 MIM:153455|HGNC:HGNC:6664|Ensembl:ENSG00000113083|HPRD:01087|Vega:Otthumg00000128914
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5q23.2
Pascal P值 0.789
胎儿β 0.562
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG11960393 5 121414172 熏鲑鱼 2.672E-4 1.096 0.038 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MGA 0.95 0.96
KDM5A 0.95 0.96
BTBD7 0.95 0.95
CHD9 0.94 0.95
ZKSCAN1 0.93 0.93
USP24 0.93 0.95
ZNF192 0.93 0.95
SMG1 0.93 0.95
TAF1 0.93 0.95
baz1b 0.93 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ifi27 -0.65 -0.78
AF347015.31 -0.64 -0.77
MT-CO2 -0.63 -0.77
FXYD1 -0.63 -0.76
higd1b -0.62 -0.78
CXCL14 -0.61 -0.75
myl3 -0.61 -0.75
C5orf53 -0.61 -0.65
AF347015.27 -0.60 -0.72
增强 -0.60 -0.77

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与导管正常 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN 74 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 182 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹间皮瘤生存最差与最好的 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向DN 133 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标8小时DN 129 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG的Elvidge缺氧 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge Hif1a靶向​​DN 91 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge HIF2A靶向 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge HIF1A和HIF2A靶向DN 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karakas TGFB1信号传导 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 229 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
量缺氧 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen malignat纤维组织细胞瘤 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克道尔急性肺损伤 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时DN 91 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
汉·詹克(Han Jnk)唱歌 35 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 UP 49 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
URS脂肪细胞分化DN 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
转移DN期间的clasper淋巴管 36 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 88 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Thum mir21靶向心脏病 17 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
cro骨基质刺激 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
woo肝癌复发 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇0的时间反应0 76 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村脂肪形成早期DN 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村脂肪形成晚期DN 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 216 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转换签名 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi缺氧 140 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Steger脂肪形成DN 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
anastassiou癌症间充质过渡特征 64 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM监管机构 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因