基因页面:LPA
总结吗?
GeneID | 4018年 |
象征 | LPA |
同义词 | AK38 | APOA | LP |
描述 | 脂蛋白,Lp (a) |
参考 | MIM: 152200|HGNC: HGNC: 6667|运用:ENSG00000198670|HPRD: 01063|织女:OTTHUMG00000015956 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 6 q26 |
帕斯卡假定值 | 0.601 |
胎儿β | 0.111 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,schizotypy,神经,分裂型 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LPA_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PDE1B | 0.87 | 0.88 |
RAP1GAP | 0.86 | 0.84 |
HPCA | 0.84 | 0.79 |
RASD2 | 0.84 | 0.85 |
ADRA2C | 0.84 | 0.69 |
TESC | 0.83 | 0.75 |
AC005512.1 | 0.83 | 0.64 |
LINGO3 | 0.82 | 0.73 |
RGS14 | 0.82 | 0.81 |
KCNAB1 | 0.82 | 0.79 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC132872.1 | -0.35 | -0.46 |
KCNMB3 | -0.33 | -0.36 |
KIAA1949 | -0.32 | -0.26 |
RBMX2 | -0.31 | -0.44 |
ZNF300 | -0.31 | -0.15 |
AC005921.3 | -0.31 | -0.52 |
ZNF311 | -0.31 | -0.22 |
TUBB2B | -0.31 | -0.35 |
AC005768.1 | -0.30 | -0.33 |
SH3BP2 | -0.30 | -0.40 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | serine-type肽链内切酶活性 | 国际能源机构 | 谷氨酸(术语层面:7) | - - - - - - |
去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004866 | 肽链内切酶抑制剂活性 | 助教 | 8047165 | |
去:0008233 | 肽酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0034185 | 载脂蛋白绑定 | 新闻学会 | 9269765 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008015 | 血液循环 | 助教 | 8047165 | |
去:0007596 | 凝血 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | NAS | 8047165 | |
去:0006869 | 脂质运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 经验值 | 9548923 | |
去:0005576 | 细胞外区域 | NAS | 14718574 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
圣GA13通路 | 37 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID AMB2中性粒细胞通路 | 41 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME代谢脂质和脂蛋白 | 478年 | 302年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME脂类消化动员和运输 | 46 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME脂蛋白代谢 | 28 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧肝脏特定基因 | 244年 | 154年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
苏肝 | 55 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李肝癌 | 49 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
营地结肠癌拷贝数DN | 74年 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蒋介石肝癌未经子类 | 85年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
开罗肝母细胞癌DN | 267年 | 160年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA ECM监管机构 | 238年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA MATRISOME相关 | 753年 | 411年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA MATRISOME | 1028年 | 559年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |