基因页:arl2
概括?
基因 | 402 |
象征 | arl2 |
同义词 | ARFL2 |
描述 | ADP核糖基化因子,例如GTPase 2 |
参考 | MIM:601175|HGNC:HGNC:693|ENSEMBL:ENSG00000213465|HPRD:11869|Vega:Otthumg00000165728 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q13 |
Sherlock P值 | 0.293 |
胎儿β | -1.201 |
DMG | 2(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21965516 | 11 | 64781475 | arl2 | 1.184E-4 | -0.373 | 0.029 | DMG:Wockner_2014 |
CG19017420 | 11 | 64781299 | arl2 | -0.019 | 0.91 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ARL2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tubgcp3 | 0.91 | 0.90 |
PHF8 | 0.89 | 0.90 |
GPATCH8 | 0.88 | 0.89 |
FKBP15 | 0.88 | 0.87 |
NUP98 | 0.88 | 0.89 |
SUPT6H | 0.88 | 0.89 |
ube4b | 0.88 | 0.88 |
git2 | 0.88 | 0.89 |
Arih2 | 0.88 | 0.88 |
add1 | 0.87 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.73 | -0.79 |
MT-CO2 | -0.71 | -0.74 |
AF347015.31 | -0.71 | -0.74 |
ifi27 | -0.71 | -0.72 |
higd1b | -0.70 | -0.73 |
FXYD1 | -0.70 | -0.72 |
C1orf54 | -0.69 | -0.79 |
VAMP5 | -0.68 | -0.71 |
CXCL14 | -0.66 | -0.69 |
myl3 | -0.65 | -0.67 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
arl2bp | BART1 | ADP-核糖基化因子样2结合蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 11809823 |
PDE6D | pded | 磷酸二酯酶6D,CGMP特异性,杆,三角洲 | - | HPRD,Biogrid | 11980706 |
PPP2CA | pp2ac |pp2ca |RP-C | 蛋白质磷酸酶2(以前为2A),催化亚基,α同工型 | 共纯化 | Biogrid | 12912990 |
PPP2CB | pp2cb | 蛋白质磷酸酶2(以前为2A),催化亚基,β同工型 | 共纯化 | Biogrid | 12912990 |
ppp2r1b | MGC26454 |PR65B | 蛋白质磷酸酶2(以前为2A),调节亚基A,β同工型 | - | HPRD | 12912990 |
PPP2R2B | B55-beta |FLJ95686 |MGC24888 |pp2a-b55beta |pp2a-pr55b |pp2ab-beta |pp2apr55-beta |pr2ab-beta |pr2ab55-beta |pr2apr55-beta | PR52B | PR55-BETA | SCA12 | 蛋白质磷酸酶2(以前为2A),调节亚基B,β同工型 | - | HPRD | 12912990 |
PPP2R2C | B55-gamma |Imypno |IMYPNO1 |MGC33570 |Pr52 |PR55G | 蛋白质磷酸酶2(以前为2A),调节亚基B,γ同工型 | - | HPRD,Biogrid | 12912990 |
PPP2R5D | B56D |MGC2134 |MGC8949 | 蛋白质磷酸酶2,调节亚基B',三角洲同工型 | 共纯化 | Biogrid | 12912990 |
SLC25A4 | AAC1 |蚂蚁|Ant1 |PEO2 |PEO3 |T1 | 溶质载体家族25(线粒体载体;腺嘌呤核苷酸转运剂),成员4 | - | HPRD | 11809823 |
tbcd | KIAA0988 | 微管蛋白折叠辅因子D | - | HPRD,Biogrid | 10831612|12912990 |
UNC119 | HRG4 | UNC-119同源物(秀丽隐杆线虫) | HRG4与ARL2相互作用。 | 绑定 | 12527357 |
UNC119 | HRG4 | UNC-119同源物(秀丽隐杆线虫) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12527357 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche皮肤肿瘤启动子 | 142 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌 | 146 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1定位DN的Alcalay AML | 184 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin的反应 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mir15a和mir16 1的Bonci目标 | 91 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞 | 43 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |