概括
基因 402
象征 arl2
同义词 ARFL2
描述 ADP核糖基化因子,例如GTPase 2
参考 MIM:601175|HGNC:HGNC:693|ENSEMBL:ENSG00000213465|HPRD:11869|Vega:Otthumg00000165728
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q13
Sherlock P值 0.293
胎儿β -1.201
DMG 2(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21965516 11 64781475 arl2 1.184E-4 -0.373 0.029 DMG:Wockner_2014
CG19017420 11 64781299 arl2 -0.019 0.91 DMG:Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
tubgcp3 0.91 0.90
PHF8 0.89 0.90
GPATCH8 0.88 0.89
FKBP15 0.88 0.87
NUP98 0.88 0.89
SUPT6H 0.88 0.89
ube4b 0.88 0.88
git2 0.88 0.89
Arih2 0.88 0.88
add1 0.87 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.73 -0.79
MT-CO2 -0.71 -0.74
AF347015.31 -0.71 -0.74
ifi27 -0.71 -0.72
higd1b -0.70 -0.73
FXYD1 -0.70 -0.72
C1orf54 -0.69 -0.79
VAMP5 -0.68 -0.71
CXCL14 -0.66 -0.69
myl3 -0.65 -0.67

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
arl2bp BART1 ADP-核糖基化因子样2结合蛋白 - HPRD,Biogrid 11809823
PDE6D pded 磷酸二酯酶6D,CGMP特异性,杆,三角洲 - HPRD,Biogrid 11980706
PPP2CA pp2ac |pp2ca |RP-C 蛋白质磷酸酶2(以前为2A),催化亚基,α同工型 共纯化 Biogrid 12912990
PPP2CB pp2cb 蛋白质磷酸酶2(以前为2A),催化亚基,β同工型 共纯化 Biogrid 12912990
ppp2r1b MGC26454 |PR65B 蛋白质磷酸酶2(以前为2A),调节亚基A,β同工型 - HPRD 12912990
PPP2R2B B55-beta |FLJ95686 |MGC24888 |pp2a-b55beta |pp2a-pr55b |pp2ab-beta |pp2apr55-beta |pr2ab-beta |pr2ab55-beta |pr2apr55-beta | PR52B | PR55-BETA | SCA12 蛋白质磷酸酶2(以前为2A),调节亚基B,β同工型 - HPRD 12912990
PPP2R2C B55-gamma |Imypno |IMYPNO1 |MGC33570 |Pr52 |PR55G 蛋白质磷酸酶2(以前为2A),调节亚基B,γ同工型 - HPRD,Biogrid 12912990
PPP2R5D B56D |MGC2134 |MGC8949 蛋白质磷酸酶2,调节亚基B',三角洲同工型 共纯化 Biogrid 12912990
SLC25A4 AAC1 |蚂蚁|Ant1 |PEO2 |PEO3 |T1 溶质载体家族25(线粒体载体;腺嘌呤核苷酸转运剂),成员4 - HPRD 11809823
tbcd KIAA0988 微管蛋白折叠辅因子D - HPRD,Biogrid 10831612|12912990
UNC119 HRG4 UNC-119同源物(秀丽隐杆线虫) HRG4与ARL2相互作用。 绑定 12527357
UNC119 HRG4 UNC-119同源物(秀丽隐杆线虫) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
两个杂交
Biogrid 12527357


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子 142 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低DN 165 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌 146 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin的反应 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mir15a和mir16 1的Bonci目标 91 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因