基因页:arl3
概括?
基因 | 403 |
象征 | arl3 |
同义词 | arfl3 |
描述 | ADP核糖基化因子,例如GTPase 3 |
参考 | MIM:604695|HGNC:HGNC:694|ENSEMBL:ENSG00000138175|HPRD:05260|Vega:Otthumg0000000018965 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q23.3 |
Pascal P值 | 1.862E-6 |
Sherlock P值 | 0.103 |
胎儿β | 0.678 |
主持人 | 小脑 伏隔核基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7907645 | Chr10 | 104423800 | TG | 5.819e-11 | 基因间 | trim8,arl3 | dist = 5724; dist = 9684 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ARL3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TBRG1 | 0.86 | 0.82 |
IQWD1 | 0.86 | 0.84 |
MAPK10 | 0.86 | 0.87 |
MAPK9 | 0.86 | 0.85 |
PPP2R2C | 0.85 | 0.86 |
REEP5 | 0.85 | 0.86 |
FBXO9 | 0.85 | 0.84 |
AGBL4 | 0.85 | 0.83 |
htr5a | 0.85 | 0.84 |
NDRG3 | 0.84 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.43 | -0.50 |
Rab13 | -0.41 | -0.46 |
NME4 | -0.39 | -0.48 |
RPL28 | -0.38 | -0.45 |
RPL18 | -0.38 | -0.42 |
RPL35 | -0.37 | -0.39 |
RPS16P1 | -0.37 | -0.43 |
rps19p3 | -0.37 | -0.44 |
税务1bp3 | -0.37 | -0.32 |
FAM181B | -0.37 | -0.38 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 | 177 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冷吉非替尼抵抗 | 85 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DORSAM HOXA9靶向 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ouyang前列腺癌进展DN | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |