基因页:LRP6
概括?
基因 | 4040 |
象征 | LRP6 |
同义词 | ADCAD2 | STHAG7 |
描述 | LDL受体相关蛋白6 |
参考 | MIM:603507|HGNC:HGNC:6698|Ensembl:ENSG00000070018|HPRD:04617|Vega:Otthumg00000168540 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12p13.2 |
Pascal P值 | 0.074 |
胎儿β | 0.847 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7972594 | CHR12 | 11724913 | LRP6 | 4040 | 0.13 | 顺式 | ||
RS10491979 | CHR12 | 11727969 | LRP6 | 4040 | 0.13 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LRP6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CD302 | 0.93 | 0.95 |
add3 | 0.80 | 0.78 |
kat2b | 0.77 | 0.75 |
DTNA | 0.76 | 0.77 |
NT5E | 0.75 | 0.82 |
GPC5 | 0.75 | 0.80 |
SLC9A9 | 0.75 | 0.75 |
TLR3 | 0.74 | 0.78 |
CTSO | 0.74 | 0.75 |
TLR4 | 0.74 | 0.77 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF821 | -0.62 | -0.66 |
mpp3 | -0.60 | -0.62 |
KIAA1949 | -0.59 | -0.55 |
DBN1 | -0.59 | -0.60 |
ZNF311 | -0.59 | -0.61 |
Gmip | -0.58 | -0.59 |
ZBTB12 | -0.58 | -0.59 |
PODXL2 | -0.58 | -0.63 |
C19orf57 | -0.58 | -0.57 |
CSNK1E | -0.58 | -0.58 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg wnt信号通路 | 151 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wnt信令 | 89 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Beta catenin deg途径 | 18 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PS1途径 | 46 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid wnt信号通路 | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid wnt典型途径 | 20 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
korkola胚胎癌 | 41 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
korkola蛋黄囊肿瘤 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Korkola Seminoma UP | 44 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素DN的反应 | 241 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Laiho结直肠癌锯齿状DN | 86 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
渡边溃疡性结肠炎与癌症 | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN | 84 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
叶转移性肝癌 | 27 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chuang氧化应激反应向上 | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 | 109 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未经注释 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇1的时间反应1 | 68 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roessler肝癌转移 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |