概括
基因 4040
象征 LRP6
同义词 ADCAD2 | STHAG7
描述 LDL受体相关蛋白6
参考 MIM:603507|HGNC:HGNC:6698|Ensembl:ENSG00000070018|HPRD:04617|Vega:Otthumg00000168540
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12p13.2
Pascal P值 0.074
胎儿β 0.847
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7972594 CHR12 11724913 LRP6 4040 0.13 顺式
RS10491979 CHR12 11727969 LRP6 4040 0.13 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CD302 0.93 0.95
add3 0.80 0.78
kat2b 0.77 0.75
DTNA 0.76 0.77
NT5E 0.75 0.82
GPC5 0.75 0.80
SLC9A9 0.75 0.75
TLR3 0.74 0.78
CTSO 0.74 0.75
TLR4 0.74 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF821 -0.62 -0.66
mpp3 -0.60 -0.62
KIAA1949 -0.59 -0.55
DBN1 -0.59 -0.60
ZNF311 -0.59 -0.61
Gmip -0.58 -0.59
ZBTB12 -0.58 -0.59
PODXL2 -0.58 -0.63
C19orf57 -0.58 -0.57
CSNK1E -0.58 -0.58

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg wnt信号通路 151 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wnt信令 89 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Beta catenin deg途径 18 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PS1途径 46 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid wnt信号通路 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid wnt典型途径 20 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
korkola胚胎癌 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
korkola蛋黄囊肿瘤 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Korkola Seminoma UP 44 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素DN的反应 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Laiho结直肠癌锯齿状DN 86 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边溃疡性结肠炎与癌症 18 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN 84 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 236 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
叶转移性肝癌 27 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chuang氧化应激反应向上 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由KRAS DN 120 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 109 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未经注释 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇1的时间反应1 68 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因