基因页面:CTXN1
总结吗?
| GeneID | 404217年 |
| 象征 | CTXN1 |
| 同义词 | CTXN |
| 描述 | cortexin 1 |
| 参考 | MIM: 600135|HGNC: HGNC: 31108|运用:ENSG00000178531|HPRD: 13097|织女:OTTHUMG00000182480 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 19 p13.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.048 |
| 夏洛克假定值 | 0.984 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg10709671 | 19 | 7992115 | TIMM44; CTXN1 | 1.131的军医 | 0.374 | 0.029 | DMG: Wockner_2014 |
| cg04351979 | 19 | 7990281 | CTXN1 | 2.17 e-9 | -0.01 | 1.69 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2456047 | chr15 | 76484829 | CTXN1 | 404217年 | 0.19 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CHARAFE乳腺癌导管和基地 | 380年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SENESE HDAC2目标 | 133年 | 77年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1目标了 | 566年 | 371年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WIERENGA STAT5A目标了 | 217年 | 131年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WIERENGA STAT5A目标GROUP1 | 136年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PASINI SUZ12目标 | 315年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李BMP2目标了 | 745年 | 475年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 杨BCL3目标了 | 364年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |