基因页：lsamp
概括？
| 基因 | 4045 |
| 象征 | lsamp |
| 同义词 | iglon3 |灯 |
| 描述 | 边缘系统相关的膜蛋白 |
| 参考 | MIM：603241|HGNC：HGNC：6705|ENSEMBL：ENSG00000185565|HPRD：09128|Vega：Otthumg00000159308 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q13.31 |
| Pascal P值 | 0.209 |
| Sherlock P值 | 2.212E-6 |
| 胎儿β | -1.051 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 细胞粘附和透射信号传导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.04359 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.04047 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6733654 | CHR2 | 1963270 | lsamp | 4045 | 0.09 | 反式 | ||
| RS1155107 | CHR3 | 26843376 | lsamp | 4045 | 0.18 | 反式 | ||
| RS17029291 | CHR3 | 32402138 | lsamp | 4045 | 0.11 | 反式 | ||
| RS6813178 | CHR4 | 71575238 | lsamp | 4045 | 0.17 | 反式 | ||
| RS6834662 | CHR4 | 71605100 | lsamp | 4045 | 0.05 | 反式 | ||
| RS16870339 | CHR5 | 2705169 | lsamp | 4045 | 0.19 | 反式 | ||
| RS235427 | CHR8 | 133815575 | lsamp | 4045 | 0.11 | 反式 | ||
| RS235428 | CHR8 | 133815725 | lsamp | 4045 | 0.17 | 反式 | ||
| RS16904746 | CHR8 | 133844507 | lsamp | 4045 | 0.1 | 反式 | ||
| RS4607971 | Chr10 | 19407890 | lsamp | 4045 | 0.09 | 反式 | ||
| RS1700369 | CHR12 | 127842232 | lsamp | 4045 | 0.18 | 反式 | ||
| RS2239335 | CHR16 | 22897794 | lsamp | 4045 | 0.18 | 反式 | ||
| RS6098023 | CHR20 | 53113740 | lsamp | 4045 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CA14 | 0.64 | 0.58 |
| DUSP10 | 0.62 | 0.56 |
| GLTP | 0.60 | 0.60 |
| C18orf56 | 0.60 | 0.48 |
| WIPF1 | 0.60 | 0.57 |
| jam3 | 0.59 | 0.38 |
| cdc42ep1 | 0.59 | 0.57 |
| lass2 | 0.59 | 0.54 |
| HSPA2 | 0.59 | 0.60 |
| CREB5 | 0.58 | 0.43 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| fblim1 | -0.31 | -0.31 |
| 我的C | -0.31 | -0.27 |
| TMC2 | -0.30 | -0.32 |
| LEMD1 | -0.29 | -0.37 |
| ZNF599 | -0.29 | -0.30 |
| KRT19 | -0.29 | -0.35 |
| AKR1C2 | -0.28 | -0.26 |
| Dact1 | -0.28 | -0.26 |
| Trim67 | -0.28 | -0.25 |
| DAB1 | -0.28 | -0.25 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突（GO期限：5） | 8666243 |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0031225 | 锚定在膜上 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼头颈癌 | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 海勒被甲基化DN沉默 | 105 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |