概括
基因 4046
象征 LSP1
同义词 wp34 | pp52
描述 淋巴细胞特异性蛋白1
参考 MIM:153432|HGNC:HGNC:6707|Ensembl:ENSG00000130592|HPRD:01083|Vega:Otthumg0000000012252
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.5
Pascal P值 0.115
胎儿β -0.64
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG05409391 11 1886783 LSP1 4.41E-6 0.746 0.01 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
srgn 0.76 0.78
gimap5 0.74 0.76
ifitm1 0.74 0.80
CFB 0.74 0.71
IGFBP7 0.73 0.76
B2M 0.73 0.69
ifitm2 0.72 0.78
ifi27 0.71 0.70
PSMB8 0.71 0.69
HLA-B 0.70 0.67
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CCDC49 -0.64 -0.69
cdc2l2 -0.63 -0.66
GGNBP2 -0.62 -0.65
Trim26 -0.62 -0.67
NCL -0.62 -0.69
RRP1 -0.62 -0.61
UTP3 -0.62 -0.63
GPATCH1 -0.61 -0.67
ZNF830 -0.61 -0.66
我知道 -0.61 -0.68

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID P38 MK2途径 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质标记DN 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN 260 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向DN 133 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Castellano NRAS靶向 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 108 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林青春期乳腺 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori前BI淋巴细胞DN 77 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando Lyl1邻居 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园HSC标记 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 77 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 102 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园APL发病机理DN 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园维甲酸的反应和PML RARA FUSION 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 128 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移DN 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Worschech肿瘤逃避和耐受性DN 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Glis2靶向 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7靶向1个 194 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix RAR目标DN 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang击倒第二个EGF脉冲 293 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因