基因页：arnt
概括？
| 基因 | 405 |
| 象征 | arnt |
| 同义词 | hif-1-beta | hif-1beta | hif1-beta | hif1b | hif1beta |探戈| bhlhe2 |
| 描述 | 芳基烃受体核转运剂 |
| 参考 | MIM：126110|HGNC：HGNC：700|ENSEMBL：ENSG00000143437|HPRD：00524|Vega：Otthumg00000035011 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q21 |
| Sherlock P值 | 0.87 |
| 胎儿β | -0.586 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑 皮质 |
| 支持 | G2CDB.HUMANNRC G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AL117209.1 | 0.86 | 0.85 |
| magi2 | 0.85 | 0.85 |
| tatdn2 | 0.85 | 0.83 |
| inpp4a | 0.84 | 0.86 |
| BRPF3 | 0.84 | 0.85 |
| MAPRE2 | 0.84 | 0.84 |
| atcay | 0.84 | 0.86 |
| MSMP | 0.84 | 0.85 |
| DNAJC5 | 0.84 | 0.86 |
| RGP1 | 0.84 | 0.86 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.68 | -0.62 |
| GNG11 | -0.65 | -0.63 |
| higd1b | -0.64 | -0.61 |
| AF347015.31 | -0.63 | -0.59 |
| MT-CO2 | -0.63 | -0.58 |
| C1orf54 | -0.62 | -0.67 |
| AL138743.2 | -0.62 | -0.64 |
| AP002478.3 | -0.60 | -0.59 |
| IL32 | -0.59 | -0.53 |
| 鼻孔 | -0.59 | -0.54 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0004871 | 信号传感器活性 | IEA | - | |
| 去：0003700 | 转录因子活性 | IEA | - | |
| 去：0003705 | RNA聚合酶II转录因子活性，增强子结合 | 艾达 | 7539918|8756616 | |
| 去：0003713 | 转录共激活因子活性 | IEA | - | |
| 去：0003713 | 转录共激活因子活性 | 塔斯 | 1317062 | |
| GO：0017162 | 芳基烃受体结合 | IPI | 9079689 | |
| GO：0046982 | 蛋白质异二聚化活性 | IEA | - | |
| GO：0046982 | 蛋白质异二聚化活性 | IPI | 9079689 | |
| GO：0043565 | 序列特异性DNA结合 | 艾达 | 7539918|8756616 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001666 | 对缺氧的反应 | 艾达 | 8756616 | |
| 去：0001892 | 胚胎胎盘开发 | IEA | - | |
| 去：0001938 | 内皮细胞增殖的阳性调节 | 我知道了 | 8756616 | |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| GO：0010575 | 阳性调节血管内皮生长因子产生 | 艾达 | 8756616 | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| GO：0043193 | 基因特异性转录的阳性调节 | 艾达 | 8089148 | |
| 去：0030949 | 血管内皮生长因子受体信号通路的正调控 | 我知道了 | 8756616 | |
| GO：0042789 | RNA聚合酶II启动子的mRNA转录 | 我知道了 | 7539918 | |
| GO：0045648 | 红细胞分化的阳性调节 | 我知道了 | 1448077 | |
| GO：0045941 | 转录的正调节 | IEA | - | |
| GO：0045944 | RNA聚合酶II启动子的转录阳性调节 | IEA | - | |
| GO：0046886 | 激素生物合成过程的阳性调节 | 艾达 | 1448077 | |
| GO：0045821 | 糖酵解的阳性调节 | 我知道了 | 8089148 | |
| 去：0043619 | 响应氧化应激的RNA聚合酶II启动子的转录调节 | 艾达 | 8089148 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | 塔斯 | 1317062 | |
| 去：0005667 | 转录因子复合物 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 啊 | - | 芳基烃受体 | - | HPRD | 7488247|7628454 |8384309|11768231 |12024042 |
| 啊 | - | 芳基烃受体 | ARNT与AHR互动。 | 绑定 | 9704006 |
| 啊 | - | 芳基烃受体 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 7488247|7628454 |8384309|9887096 |
| 啊 | 啊|ahhr |KIAA1234 |MGC167813 |MGC176630 | 芳基氢化碳受体阻遏物 | - | HPRD，Biogrid | 9887096 |
| AIP | ara9 |FKBP16 |fkbp37 |smtphn |XAP2 | 芳基烃受体相互作用蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 9111057 |
| arnt | hif-1beta |HIF1B |hif1beta |探戈|bhlhe2 | 芳基烃受体核转运剂 | ARNT与自身的另一个副本相互作用，尽管薄弱，以形成同二聚体。 | 绑定 | 9704006 |
| EPAS1 | ecyt4 |hif2a |HLF |mop2 |PASD2 | 内皮PAS域蛋白1 | HLF与ARNT相互作用。这种相互作用是在小鼠HLF和人ARNT之间证明的相互作用上建模的。 | 绑定 | 9113979 |
| EPAS1 | ecyt4 |hif2a |HLF |mop2 |PASD2 | 内皮PAS域蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 9079689 |
| EPAS1 | ecyt4 |hif2a |HLF |mop2 |PASD2 | 内皮PAS域蛋白1 | ARNT与HLF相互作用。这种相互作用是在人类ARNT和小鼠HLF之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 9704006 |
| GTF2F1 | BTF4 |Rap74 |TF2F1 |tfiif | 通用转录因子IIF，多肽1，74KDA | 重构的复合物 | Biogrid | 8794892 |
| GTF2F2 | BTF4 |Rap30 |TF2F2 |tfiif | 通用转录因子IIF，多肽2，30KDA | - | HPRD，Biogrid | 8794892 |
| hif1a | HIF-1Alpha |HIF1 |hif1-alpha |mop1 |PASD8 | 低氧诱导因子1，α亚基（基本螺旋 - 环螺旋转录因子） | - | HPRD，Biogrid | 9079689 |
| hif1a | HIF-1Alpha |HIF1 |hif1-alpha |mop1 |PASD8 | 低氧诱导因子1，α亚基（基本螺旋 - 环螺旋转录因子） | HIF-1Alpha与HIF-1Beta相互作用 | 绑定 | 8663540 |
| hif1a | HIF-1Alpha |HIF1 |hif1-alpha |mop1 |PASD8 | 低氧诱导因子1，α亚基（基本螺旋 - 环螺旋转录因子） | HIF-1Alpha亚型1与HIF-1BETA亚型3相互作用3 | 绑定 | 8663540 |
| hif1a | HIF-1Alpha |HIF1 |hif1-alpha |mop1 |PASD8 | 低氧诱导因子1，α亚基（基本螺旋 - 环螺旋转录因子） | ARNT与HIF1-Alpha相互作用。 | 绑定 | 9704006 |
| hif1a | HIF-1Alpha |HIF1 |hif1-alpha |mop1 |PASD8 | 低氧诱导因子1，α亚基（基本螺旋 - 环螺旋转录因子） | HIF-1Alpha亚型2与HIF-1BETA亚型1相互作用1 | 绑定 | 8663540 |
| hif1a | HIF-1Alpha |HIF1 |hif1-alpha |mop1 |PASD8 | 低氧诱导因子1，α亚基（基本螺旋 - 环螺旋转录因子） | HIF-1Alpha亚型2与HIF-1BETA同工型相互作用3 | 绑定 | 8663540 |
| HSP90AA1 | FLJ31884 |HSP86 |HSP89A |HSP90A |HSP90N |HSPC1 |HSPCA |HSPCAL1 |HSPCAL4 |HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 | 热休克蛋白90KDAα（胞质），A类成员1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11013261 |
| NCOA1 | F-SRC-1 |kat13a |MGC129719 |MGC129720 |NCOA-1 |RIP160 |SRC-1 |src1 |Bhlhe42 | 核受体共激活因子1 | - | HPRD | 10594042 |
| NCOA2 | grip1 |kat13c |MGC138808 |NCOA-2 |tif2 | 核受体共激活因子2 | - | HPRD，Biogrid | 12024042 |
| NPAS1 | mop5 |Pasd5 |Bhlhe11 | 神经元PAS结构蛋白1 | NPAS1与ARNT相互作用 | 绑定 | 15635607 |
| NPAS4 | le-pas |nxf |PASD10 | 神经元PAS结构蛋白4 | - | HPRD，Biogrid | 14701734 |
| PML | myl |pp8675 |RNF71 |TRIM19 | Promyelocytic白血病 | - | HPRD，Biogrid | 12354770 |
| ptges3 | p23 |tebp |cpges | 前列腺素E合酶3（胞质） | - | HPRD | 11879970 |
| ptges3 | p23 |tebp |cpges | 前列腺素E合酶3（胞质） | 重构的复合物 | Biogrid | 11259606 |
| RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9712901 |
| SIM1 | BHLHE14 | 一心一意的同源物1（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 9020169 |
| SIM2 | MGC119447 |SIM |BHLHE15 | 一心一意的同源物2（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 9020169|9271372 |11782478 |
| SP1 | - | SP1转录因子 | 重构的复合物 | Biogrid | 10471301 |
| src | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | V-SRC肉瘤（Schmidt-Ruppin A-2）病毒癌基因同源物（Avian） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12024042 |
| 塔兹 | BTHS |CMD3A |efe |efe2 |FLJ27390 |G4.5 |lvncx |taz1 |XAP-2 | 塔法奇 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12065584 |
| XPO1 | CRM1 |DKFZP686B1823 | Exportin 1（CRM1同源物，酵母） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12065584 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG肾细胞癌 | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Eponfkb途径 | 11 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta HIF途径 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta VEGF途径 | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID HIF2Pathway | 34 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID HIF1A途径 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID HIF1 TFPathway | 66 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid his hey pathway | 48 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组对缺氧HIF的低氧诱导因子HIF调节 | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Doane对雄激素DN的反应 | 241 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ginestier乳腺癌Znf217扩增 | 78 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ginestier乳腺癌20q13扩增 | 119 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wamunyokoli卵巢癌LMP DN | 199 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Streicher LSM1靶向 | 44 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| myllykangas放大热点17 | 25 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| myllykangas放大热点24 | 14 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bystroem与IL5 DN相关 | 64 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA受伽马辐射损伤 | 81 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林黑色素瘤复制号码 | 73 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌亚类未经注释 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-10 | 1273 | 1279 | M8 | HSA-MIR-10A | uacccuguagauccgaauuugug |
| HSA-MIR-10B | uacccuguagaaccgaauuugu | ||||
| mir-103/107 | 953 | 960 | 1A，M8 | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
| HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
| mir-129-5p | 1869年 | 1875年 | M8 | HSA-MIR-129脑 | cuuuuugcgguggggcuugc |
| HSA-MIR-129-5P | cuuuuugcgguggggcuugcu | ||||
| mir-135 | 1298 | 1304 | 1a | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| mir-153 | 608 | 614 | 1a | HSA-MIR-153 | Uugcauagucacaaaaguga |
| mir-221/222 | 1883年 | 1890年 | 1A，M8 | HSA-MIR-221脑 | agcuacauugucugugggggguc |
| HSA-MIR-222脑 | agcuacaucuggcuacugggucuc | ||||
| mir-29 | 857 | 863 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
| HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
| HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
| mir-376c | 1585年 | 1591年 | M8 | HSA-MIR-376C | aacauagaggaaauuccacg |
| mir-448 | 608 | 614 | 1a | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
| mir-450 | 1869年 | 1875年 | 1a | HSA-MIR-450 | uuuuugcgauguuccuaaua |
| mir-504 | 1274 | 1281 | 1A，M8 | HSA-MIR-504 | agacccugucugcacucuau |
| mir-9 | 709 | 715 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |