基因页:LYN
概括?
基因ID | 4067 |
象征 | LYN |
同义词 | jtk8 | p53lyn | p56lyn |
描述 | Lyn原始癌基因,SRC家族酪氨酸激酶 |
参考 | MIM:165120|HGNC:HGNC:6735|HPRD:01301| |
基因类型 | protein-coding |
地图位置 | 8Q13 |
Pascal P值 | 0.101 |
Sherlock P值 | 0.514 |
Fetal beta | -0.612 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | Info |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | Genome-wide DNA methylation analysis | This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击to show details |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0321 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | beta(dis) | FDR (dis) | Study |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg16073549 | 8 | 56896784 | LYN | 2.43E-4 | 0.261 | 0.037 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | PVALUE | qvalue | TSS distance | eQTL type |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10823579 | chr10 | 72348508 | LYN | 4067 | 0.1 | 反式 | ||
RS10743139 | chr11 | 10425326 | LYN | 4067 | 0.19 | 反式 | ||
RS11216720 | chr11 | 117909100 | LYN | 4067 | 0.07 | 反式 | ||
rs12223165 | chr11 | 117910016 | LYN | 4067 | 0.07 | 反式 | ||
RS11216730 | chr11 | 117918701 | LYN | 4067 | 0.03 | 反式 | ||
RS16955618 | chr15 | 29937543 | LYN | 4067 | 1.074E-4 | 反式 |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LYN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
Top 10 positively co-expressed genes | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GRID1 | 0.83 | 0.84 |
TAOK2 | 0.78 | 0.78 |
SPTBN4 | 0.78 | 0.83 |
KIAA0664 | 0.77 | 0.81 |
ZBTB4 | 0.76 | 0.86 |
C18orf1 | 0.76 | 0.81 |
AC135592.2 | 0.76 | 0.78 |
PCDH1 | 0.76 | 0.80 |
rundc1 | 0.76 | 0.75 |
AP006216.1 | 0.75 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1orf54 | -0.56 | -0.51 |
AF347015.21 | -0.55 | -0.46 |
clec2b | -0.52 | -0.47 |
Sycp3 | -0.52 | -0.52 |
GNG11 | -0.52 | -0.50 |
C1orf61 | -0.52 | -0.49 |
SAT1 | -0.51 | -0.49 |
AF347015.31 | -0.50 | -0.43 |
LGALS3 | -0.50 | -0.46 |
VAMP5 | -0.50 | -0.43 |
Section III. Gene Ontology annotation
Molecular function | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0004716 | 受体信号蛋白酪氨酸激酶活性 | 塔斯 | 10748115 | |
GO:0005515 | protein binding | IPI | 7859737|8753773|9020138 |
|
GO:0005515 | protein binding | ISS | - | |
GO:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004715 | 非膜跨度蛋白酪氨酸激酶活性 | IEA | - | |
GO:0016740 | 反式ferase activity | IEA | - | |
Biological process | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
GO:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | 塔斯 | 3561390 | |
去:0007165 | signal transduction | 塔斯 | 7650013 | |
去:0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | ISS | - | |
GO:0009725 | 对激素刺激的反应 | ISS | - | |
GO:0042531 | positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein | ISS | - | |
去:0030218 | 红细胞分化 | ISS | - | |
GO:0044419 | 生物之间的种间相互作用 | IEA | - | |
细胞分量 | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
GO:0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005634 | 核 | ISS | - | |
GO:0005737 | 细胞质 | ISS | - | |
去:0005886 | 质膜 | 经验 | 10858437 | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 18029348 | |
GO:0045121 | 膜筏 | 艾达 | 11313396 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
银行1 | BANK | FLJ20706 | FLJ34204 | B细胞支架蛋白质脚踝蛋白重复1 | - | HPRD,Biogrid | 11782428 |
BCAR1 | CAS | CAS1 | CASS1 | CRKAS | P130Cas | 乳腺癌抗雌激素抵抗1 | - | HPRD,Biogrid | 9581808 |
BTK | AGMX1 | AT | ATK | BPK | IMD1 | MGC126261 | MGC126262 | PSCTK1 | XLA | 布鲁顿阿氨基葡萄糖酸酪氨酸激酶 | - | HPRD,Biogrid | 8058772 |
CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence | Affinity Capture-Western | BioGRID | 12244174 |
CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence | - | HPRD | 12149655 |
CBLC | CBL-3 |CBL-SL |RNF57 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列C | - | HPRD,Biogrid | 10362357 |
CD19 | B4 |MGC12802 | CD19分子 | - | HPRD | 7568175|7589101 |
CD22 | FLJ22814 |MGC130020 |SIGLEC-2 |SIGLEC2 | CD22分子 | - | HPRD | 8647200 |
CD22 | FLJ22814 |MGC130020 |SIGLEC-2 |SIGLEC2 | CD22分子 | Affinity Capture-Western Biochemical Activity |
BioGRID | 10228003|10748054 |
CD24 | CD24A | FLJ22950 | FLJ43543 | MGC75043 | CD24分子 | - | HPRD,Biogrid | 8753773 |
CD36 | CHDS7 |脂肪|gp3b |GP4 |GPIV |帕西夫|Scarb3 | CD36分子(血小板传播受体) | - | HPRD,Biogrid | 1715582 |
CD72 | CD72B |Lyb2 | CD72分子 | Biochemical Activity | BioGRID | 9590210 |
CDC2 | CDC28A | CDK1 | DKFZp686L20222 | MGC111195 | 细胞分裂周期2,G1至S和G2至M | - | HPRD,Biogrid | 8051175|8910336 |
CDK2 | p33(CDK2) | 细胞周期蛋白依赖性激酶2 | - | HPRD,Biogrid | 8806683|10432313 |
CDK4 | CMM3 | MGC14458 | PSK-J3 | 细胞周期蛋白依赖性激酶4 | 亲和力捕获ms | BioGRID | 17353931 |
CSF1R | C-FMS |CD115 |CSFR |fim2 |FMS | 菌落刺激因子1受体 | - | HPRD,Biogrid | 7636265 |
CSF2RB | CD131 | CDw131 | IL3RB | IL5RB | colony stimulating factor 2 receptor, beta, low-affinity (granulocyte-macrophage) | - | HPRD | 7636265|9973406 |
CSF2RB | CD131 | CDw131 | IL3RB | IL5RB | colony stimulating factor 2 receptor, beta, low-affinity (granulocyte-macrophage) | 体内 蛋白质肽 |
BioGRID | 7636265|9973406 |
CSF3R | CD114 |GCSFR | 菌落刺激因子3受体(粒细胞) | - | HPRD,Biogrid | 8197119 |
CSNK2B | CK2B |CK2N |CSK2B |g5a |MGC138222 |MGC138224 | casein kinase 2, beta polypeptide | 两个杂交 | BioGRID | 14667819 |
CTLA4 | CD152 | CELIAC3 | CTLA-4 | GSE | IDDM12 | 细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4 | - | HPRD,Biogrid | 9712716 |
DLG4 | FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 | 圆盘,大型同源物4(果蝇) | - | HPRD | 9892651 |
DOK1 | MGC117395 | MGC138860 | P62DOK | 对接蛋白1,62KDA(酪氨酸激酶1的下游) | Biochemical Activity Reconstituted Complex |
BioGRID | 11071635|11825908 |
DOK3 | dokl |FLJ22570 |FLJ39939 | 对接蛋白3 | - | HPRD | 10733577 |
epor | MGC138358 | 红细胞生成素受体 | - | HPRD,Biogrid | 9573010 |
EVL | RNB6 | Enah/Vasp-like | - | HPRD,Biogrid | 10945997 |
FCAR | CD89 | Iga的FC片段,受体 | - | HPRD,Biogrid | 9427690 |
fcer1g | fcrg | IgE的FC片段,高亲和力I,受体;伽马多肽 | - | HPRD,Biogrid | 11388899 |
FCGR2A | CD32 |CD32A |CDW32 |FCG2 |FCGR2 |FCGR2A1 |FCGR |IGFR2 |MGC23887 |MGC30032 | IgG,低亲和力IIA,受体的FC片段(CD32) | Affinity Capture-Western | BioGRID | 9268059 |
FOLR1 | FBP |folr |fr-alpha |mov18 | 叶酸受体1(成人) | - | HPRD | 10633085 |
GAB2 | KIAA0571 | GRB2相关的结合蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 11971018 |
GAB3 | - | GRB2相关的结合蛋白3 | - | HPRD,Biogrid | 11739737 |
galnac4s-6st | BRAG | DKFZp781H1369 | KIAA0598 | MGC34346 | RP11-47G11.1 | B细胞抹布相关蛋白 | - | HPRD | 10749872 |
GP6 | GPIV |GPVI |MGC138168 | glycoprotein VI (platelet) | - | HPRD,Biogrid | 11943772 |
GRIA3 | glur-c |glur-k3 |glur3 |glurc |MRX94 | 谷氨酸受体,ionotrophic, AMPA 3 | - | HPRD | 9892356 |
HCLS1 | cttnl |HS1 | 造血细胞特异性LYN底物1 | - | HPRD,Biogrid | 7682714 |
IL7R | CD127 |CDW127 |IL-7R-Alpha |IL7RA |伊拉 | 白介素7受体 | - | HPRD | 7515933 |
inpp5d | MGC104855 | MGC142140 | MGC142142 | SHIP | SHIP1 | SIP-145 | hp51CN | 肌醇聚磷酸5-磷酸酶,145KDA | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 12882960 |
JAK2 | JTK10 | Janus激酶2(蛋白酪氨酸激酶) | - | HPRD,Biogrid | 9573010 |
成套工具 | c-kit |CD117 |PBT |scfr | v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog | C-kit与p53lyn相互作用。 | 绑定 | 9341198 |
成套工具 | c-kit |CD117 |PBT |scfr | v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog | - | HPRD,Biogrid | 9341198 |
成套工具 | c-kit |CD117 |PBT |scfr | v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog | c-Kit interacts with p56Lyn. | 绑定 | 9341198 |
LCP2 | SLP-76 | SLP76 | 淋巴细胞胞质蛋白2(含有76KDA的白细胞蛋白的SH2结构域) | - | HPRD,Biogrid | 10026222 |
LYN | FLJ26625 |JTK8 | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 | Lyn自磷酸化。这种相互作用是在使用未指定物种的lyn的相互作用上建模的。 | 绑定 | 12588871 |
MAPK3 | ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 | mitogen-activated protein kinase 3 | - | HPRD,Biogrid | 11131153 |
妈妈 | 卡拉|CD10 |DKFZP686O16152 |MGC126681 |MGC126707 |NEP | 膜金属内肽酶 | - | HPRD,Biogrid | 8943850 |
MS4A2 | APY |atopy |fcer1b |fceri |伊格尔|伊格|igher |MS4A1 | 跨膜四域,亚家族A,成员2(IgE的FC片段,高亲和力I,受体;β多肽) | - | HPRD | 7528770|7612892 |
MUC1 | CD227 | EMA | H23AG | MAM6 | PEM | PEMT | PUM | mucin 1, cell surface associated | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 12750561 |
nedd9 | CAS-L | CAS2 | CASL | CASS2 | HEF1 | dJ49G10.2 | dJ761I2.1 | 神经前体细胞表达,发育下调9 | - | HPRD,Biogrid | 9020138 |
NMT1 | NMT | N- myristoyltransferase 1 | - | HPRD,Biogrid | 11594778 |
NPHS1 | CNF |nphn | 肾脏病1,先天性,芬兰类型(肾素) | - | HPRD | 12846735 |
PAG1 | CBP | FLJ37858 | MGC138364 | PAG | 与糖磷脂微域1相关的磷蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 10790433 |
PDE4A | DPDE2 | PDE4 | PDE46 | phosphodiesterase 4A, cAMP-specific (phosphodiesterase E2 dunce homolog, Drosophila) | - | HPRD,Biogrid | 10206997 |
pde4d | dpde3 |HSPDE4D |PDE4DN2 |strk1 | 磷酸二酯酶4D,营地特异性(磷酸二酯酶E3 Dunce同源物,果蝇) | PDE4D4与Lyn SH3域相互作用。 | 绑定 | 10571082 |
PECAM1 | CD31 |PECAM-1 | 血小板/内皮细胞粘附分子 | - | HPRD,Biogrid | 10858437 |
PIK3CG | pi3cg |PI3K |pi3kgamma |PIK3 | 磷酸肌醇3-激酶,催化,伽马多肽 | - | HPRD,Biogrid | 10318860 |
PLCG1 | PLC-II | PLC1 | PLC148 | PLCgamma1 | 磷脂酶C,伽马1 | - | HPRD | 10586033 |
PLCG2 | - | 磷脂酶C,伽马2(磷脂酰肌醇特异性) | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 8395016|10981967 |
PPP1R15A | GADD34 | 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基15A | - | HPRD,Biogrid | 11517336 |
PPP1R8 | ARD-1 | ARD1 | NIPP-1 | NIPP1 | PRO2047 | protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 8 | - | HPRD,Biogrid | 11104670 |
PRAM1 | MGC39864 |婴儿车-1 | PML-RARA调节的适配器分子1 | - | HPRD,Biogrid | 11301322 |
prkcq | MGC126514 | MGC141919 | PRKCT | nPKC-theta | protein kinase C, theta | - | HPRD | 11358993 |
prkdc | DNA-PKcs | DNAPK | DNPK1 | HYRC | HYRC1 | XRCC7 | p350 | 蛋白激酶,DNA激活,催化多肽 | - | HPRD,Biogrid | 9748231 |
PTK2 | Fadk |fak |fak1 |pp125fak | PTK2蛋白酪氨酸激酶2 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 9169439 |
PTK2 | Fadk |fak |fak1 |pp125fak | PTK2蛋白酪氨酸激酶2 | - | HPRD | 11389892 |
ptk2b | Cadtk |cakb |fadk2 |fak2 |frnk |PKB |PTK |pyk2 |筏 | PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β | - | HPRD,Biogrid | 11311138 |
PTPN6 | HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体6型 | - | HPRD,Biogrid | 10574931 |
PTPRC | B220 | CD45 | CD45R | GP180 | LCA | LY5 | T200 | protein tyrosine phosphatase, receptor type, C | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 7516335 |
RGS16 | A28-RGS14 |A28-RGS14P |RGS-R | regulator of G-protein signaling 16 | Lyn磷酸化RGS16。这种相互作用是基于未指定物种与人RSG16的LYN之间的相互作用建模的。 | 绑定 | 12588871 |
RPL10 | DKFZP686J1851 |DXS648 |DXS648E |FLJ23544 |FLJ27072 |十一月|QM | 核糖体蛋白L10 | Reconstituted Complex | BioGRID | 12138090 |
RPS6KB1 | PS6K | S6K | S6K1 | STK14A | p70(S6K)-alpha | p70-S6K | p70-alpha | ribosomal protein S6 kinase, 70kDa, polypeptide 1 | Biochemical Activity | BioGRID | 16640565 |
RPS6KB2 | KLS |p70-beta |p70-beta-1 |p70-beta-2 |s6k-beta2 |S6K2 |SRK |STK14B |P70(S6K)-Beta |P70S6KB | ribosomal protein S6 kinase, 70kDa, polypeptide 2 | Biochemical Activity | BioGRID | 16640565 |
SH2B2 | APS | SH2B适配器蛋白2 | - | HPRD | 10872802 |
SHC1 | FLJ26504 |SHC |SHCA | SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 1 | - | HPRD,Biogrid | 7650013 |
SKAP1 | SCAP1 | SKAP55 | SRC激酶相关的磷蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 9195899 |
SKAP2 | MGC10411 |MGC33304 |prap |RA70 |SAPS |scap2 |skap-hom |SKAP55R | SRC激酶相关的磷蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 9837776 |
SRC | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (avian) | 蛋白质肽 | BioGRID | 9169421 |
Syk | dkfzp313n1010 |FLJ25043 |FLJ37489 | spleen tyrosine kinase | - | HPRD,Biogrid | 7831290 |
tec | MGC126760 |MGC126762 |PSCTK4 | TEC蛋白酪氨酸激酶 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11071635 |
trat1 | HSPC062 | TCRIM | TRIM | T细胞受体相关的跨膜适配器1 | Reconstituted Complex | BioGRID | 10790433 |
TRPV4 | OTRPC4 |TRP12 |VR-OAC |VRL-2 |VRL2 |Vroac | 瞬态受体电势阳离子通道,亚家族V,成员4 | - | HPRD,Biogrid | 12538589 |
tyk2 | JTK1 | tyrosine kinase 2 | - | HPRD,Biogrid | 9633884 |
UBB | FLJ25987 |MGC8385 | 泛素b | Lyn与泛素相互作用。 | 绑定 | 11046148 |
UNC119 | HRG4 | UNC-119同源物(秀丽隐杆线虫) | - | HPRD,Biogrid | 12496276 |
V.途径注释
路径名 | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG B细胞受体信号通路 | 75 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG FC EPSILON RI SIGNALING PATHWAY | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 | 97 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG长期抑郁症 | 70 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
幽门螺杆菌感染中的KEGG上皮细胞信号传导 | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta BCR途径 | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Epha4途径 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta FCER1途径 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Ptdins途径 | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SA B CELL RECEPTOR COMPLEXES | 24 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B淋巴细胞中的SIG PIP3信号传导 | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SIG BCR信号通路 | 46 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST B细胞抗原受体 | 40 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FCER1途径 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID BCR 5 Pathway | 65 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID溶物磷脂途径 | 66 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID GMCSF途径 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Glypican 1 Pathway | 27 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PTP1B途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID p38 alpha beta途径 | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TXA2 Pathway | 57 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CXCR4途径 | 102 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL5 PATHWAY | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PI3KCI途径 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AMB2中性粒细胞途径 | 41 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Epha FWDPathway | 34 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PDGFRB PATHWAY | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL8 CXCR2途径 | 34 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID套件途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID EPO途径 | 34 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL8 CXCR1途径 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID EPHRINB REV PATHWAY | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PIDα突触核蛋白途径 | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNALING BY SCF KIT | 78 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生长激素受体信号传导 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
套件信号的反应组调节 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ANTIGEN ACTIVATES B CELL RECEPTOR LEADING TO GENERATION OF SECOND MESSENGERS | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL | 91 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组血小板粘附于暴露的胶原蛋白 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PECAM1相互作用 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME GPVI MEDIATED ACTIVATION CASCADE | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome CD28 CO刺激 | 32 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME COSTIMULATION BY THE CD28 FAMILY | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome CTLA4抑制信号传导 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ILS的Reactome信号传导 | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME REGULATION OF SIGNALING BY CBL | 18 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome IL 3 5和GM CSF信号传导 | 43 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME HEMOSTASIS | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板激活信号传导和聚集 | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
渡边直肠癌放射疗法反应性DN | 92 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ONKEN UVEAL MELANOMA UP | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Puiffe入侵被腹水抑制 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM WT1 TARGETS 8HR UP | 164 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DELYS THYROID CANCER UP | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BARRIER CANCER RELAPSE TUMOR SAMPLE UP | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王·巴雷特(Wang Barretts)食道 | 51 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schramm Inhba目标DN | 24 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DIRMEIER LMP1 RESPONSE LATE UP | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王对贝克索烯DN的响应 | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA ATM PCC NETWORK | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shin B细胞淋巴瘤簇8 | 36 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张对IKK抑制剂和TNF的反应 | 223 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MORI PRE BI LYMPHOCYTE DN | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori未成熟B淋巴细胞向上 | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLECHNER PBL KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR DN | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Golub所有vs AML DN | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DORSAM HOXA9 TARGETS DN | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
公园HSC标记 | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP | 131 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP | 182 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE HCMV INFECTION 20HR UP | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时 | 178 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HNE和TBH的Weigel氧化应激 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂响应和XPC向上 | 202 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tracey对IFNA2 DN的抗性 | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE | 261 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Finetti乳腺癌绿色 | 16 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 | 126 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tsuda肺泡软零件肉瘤 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄达沙替尼的抵抗 | 81 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindstedt树突状细胞成熟B | 53 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
炎症反应和胆固醇 | 58 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌ESR1 DN | 240 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTENS BOUND BY PML RARA FUSION | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | miRNA seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR start | UTR end | Match method | |||
miR-330 | 444 | 450 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
mir-378 | 139 | 145 | 1a | hsa-miR-378 | cuccugacuccaggucugugu |