概括?
基因ID 4067
象征 LYN
同义词 jtk8 | p53lyn | p56lyn
描述 Lyn原始癌基因,SRC家族酪氨酸激酶
参考 MIM:165120|HGNC:HGNC:6735|HPRD:01301|
基因类型 protein-coding
地图位置 8Q13
Pascal P值 0.101
Sherlock P值 0.514
Fetal beta -0.612
DMG 1(#研究)
eGene 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0321

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 P (dis) beta(dis) FDR (dis) Study
cg16073549 8 56896784 LYN 2.43E-4 0.261 0.037 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS10823579 chr10 72348508 LYN 4067 0.1 反式
RS10743139 chr11 10425326 LYN 4067 0.19 反式
RS11216720 chr11 117909100 LYN 4067 0.07 反式
rs12223165 chr11 117910016 LYN 4067 0.07 反式
RS11216730 chr11 117918701 LYN 4067 0.03 反式
RS16955618 chr15 29937543 LYN 4067 1.074E-4 反式

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GRID1 0.83 0.84
TAOK2 0.78 0.78
SPTBN4 0.78 0.83
KIAA0664 0.77 0.81
ZBTB4 0.76 0.86
C18orf1 0.76 0.81
AC135592.2 0.76 0.78
PCDH1 0.76 0.80
rundc1 0.76 0.75
AP006216.1 0.75 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf54 -0.56 -0.51
AF347015.21 -0.55 -0.46
clec2b -0.52 -0.47
Sycp3 -0.52 -0.52
GNG11 -0.52 -0.50
C1orf61 -0.52 -0.49
SAT1 -0.51 -0.49
AF347015.31 -0.50 -0.43
LGALS3 -0.50 -0.46
VAMP5 -0.50 -0.43

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0004716 受体信号蛋白酪氨酸激酶活性 塔斯 10748115
GO:0005515 protein binding IPI 7859737|8753773|9020138
GO:0005515 protein binding ISS -
GO:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004715 非膜跨度蛋白酪氨酸激酶活性 IEA -
GO:0016740 反式ferase activity IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 塔斯 3561390
去:0007165 signal transduction 塔斯 7650013
去:0008284 细胞增殖的阳性调节 ISS -
GO:0009725 对激素刺激的反应 ISS -
GO:0042531 positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein ISS -
去:0030218 红细胞分化 ISS -
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005794 高尔基体 艾达 18029348
去:0005634 ISS -
GO:0005737 细胞质 ISS -
去:0005886 质膜 经验 10858437
去:0005886 质膜 艾达 18029348
GO:0045121 膜筏 艾达 11313396

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b Experimental 资源 PubMed ID
银行1 BANK | FLJ20706 | FLJ34204 B细胞支架蛋白质脚踝蛋白重复1 - HPRD,Biogrid 11782428
BCAR1 CAS | CAS1 | CASS1 | CRKAS | P130Cas 乳腺癌抗雌激素抵抗1 - HPRD,Biogrid 9581808
BTK AGMX1 | AT | ATK | BPK | IMD1 | MGC126261 | MGC126262 | PSCTK1 | XLA 布鲁顿阿氨基葡萄糖酸酪氨酸激酶 - HPRD,Biogrid 8058772
CBL C-CBL |CBL2 |RNF55 Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence Affinity Capture-Western BioGRID 12244174
CBL C-CBL |CBL2 |RNF55 Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence - HPRD 12149655
CBLC CBL-3 |CBL-SL |RNF57 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列C - HPRD,Biogrid 10362357
CD19 B4 |MGC12802 CD19分子 - HPRD 7568175|7589101
CD22 FLJ22814 |MGC130020 |SIGLEC-2 |SIGLEC2 CD22分子 - HPRD 8647200
CD22 FLJ22814 |MGC130020 |SIGLEC-2 |SIGLEC2 CD22分子 Affinity Capture-Western
Biochemical Activity
BioGRID 10228003|10748054
CD24 CD24A | FLJ22950 | FLJ43543 | MGC75043 CD24分子 - HPRD,Biogrid 8753773
CD36 CHDS7 |脂肪|gp3b |GP4 |GPIV |帕西夫|Scarb3 CD36分子(血小板传播受体) - HPRD,Biogrid 1715582
CD72 CD72B |Lyb2 CD72分子 Biochemical Activity BioGRID 9590210
CDC2 CDC28A | CDK1 | DKFZp686L20222 | MGC111195 细胞分裂周期2,G1至S和G2至M - HPRD,Biogrid 8051175|8910336
CDK2 p33(CDK2) 细胞周期蛋白依赖性激酶2 - HPRD,Biogrid 8806683|10432313
CDK4 CMM3 | MGC14458 | PSK-J3 细胞周期蛋白依赖性激酶4 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
CSF1R C-FMS |CD115 |CSFR |fim2 |FMS 菌落刺激因子1受体 - HPRD,Biogrid 7636265
CSF2RB CD131 | CDw131 | IL3RB | IL5RB colony stimulating factor 2 receptor, beta, low-affinity (granulocyte-macrophage) - HPRD 7636265|9973406
CSF2RB CD131 | CDw131 | IL3RB | IL5RB colony stimulating factor 2 receptor, beta, low-affinity (granulocyte-macrophage) 体内
蛋白质肽
BioGRID 7636265|9973406
CSF3R CD114 |GCSFR 菌落刺激因子3受体(粒细胞) - HPRD,Biogrid 8197119
CSNK2B CK2B |CK2N |CSK2B |g5a |MGC138222 |MGC138224 casein kinase 2, beta polypeptide 两个杂交 BioGRID 14667819
CTLA4 CD152 | CELIAC3 | CTLA-4 | GSE | IDDM12 细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4 - HPRD,Biogrid 9712716
DLG4 FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 圆盘,大型同源物4(果蝇) - HPRD 9892651
DOK1 MGC117395 | MGC138860 | P62DOK 对接蛋白1,62KDA(酪氨酸激酶1的下游) Biochemical Activity
Reconstituted Complex
BioGRID 11071635|11825908
DOK3 dokl |FLJ22570 |FLJ39939 对接蛋白3 - HPRD 10733577
epor MGC138358 红细胞生成素受体 - HPRD,Biogrid 9573010
EVL RNB6 Enah/Vasp-like - HPRD,Biogrid 10945997
FCAR CD89 Iga的FC片段,受体 - HPRD,Biogrid 9427690
fcer1g fcrg IgE的FC片段,高亲和力I,受体;伽马多肽 - HPRD,Biogrid 11388899
FCGR2A CD32 |CD32A |CDW32 |FCG2 |FCGR2 |FCGR2A1 |FCGR |IGFR2 |MGC23887 |MGC30032 IgG,低亲和力IIA,受体的FC片段(CD32) Affinity Capture-Western BioGRID 9268059
FOLR1 FBP |folr |fr-alpha |mov18 叶酸受体1(成人) - HPRD 10633085
GAB2 KIAA0571 GRB2相关的结合蛋白2 - HPRD,Biogrid 11971018
GAB3 - GRB2相关的结合蛋白3 - HPRD,Biogrid 11739737
galnac4s-6st BRAG | DKFZp781H1369 | KIAA0598 | MGC34346 | RP11-47G11.1 B细胞抹布相关蛋白 - HPRD 10749872
GP6 GPIV |GPVI |MGC138168 glycoprotein VI (platelet) - HPRD,Biogrid 11943772
GRIA3 glur-c |glur-k3 |glur3 |glurc |MRX94 谷氨酸受体,ionotrophic, AMPA 3 - HPRD 9892356
HCLS1 cttnl |HS1 造血细胞特异性LYN底物1 - HPRD,Biogrid 7682714
IL7R CD127 |CDW127 |IL-7R-Alpha |IL7RA |伊拉 白介素7受体 - HPRD 7515933
inpp5d MGC104855 | MGC142140 | MGC142142 | SHIP | SHIP1 | SIP-145 | hp51CN 肌醇聚磷酸5-磷酸酶,145KDA Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
BioGRID 12882960
JAK2 JTK10 Janus激酶2(蛋白酪氨酸激酶) - HPRD,Biogrid 9573010
成套工具 c-kit |CD117 |PBT |scfr v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog C-kit与p53lyn相互作用。 绑定 9341198
成套工具 c-kit |CD117 |PBT |scfr v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog - HPRD,Biogrid 9341198
成套工具 c-kit |CD117 |PBT |scfr v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog c-Kit interacts with p56Lyn. 绑定 9341198
LCP2 SLP-76 | SLP76 淋巴细胞胞质蛋白2(含有76KDA的白细胞蛋白的SH2结构域) - HPRD,Biogrid 10026222
LYN FLJ26625 |JTK8 V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 Lyn自磷酸化。这种相互作用是在使用未指定物种的lyn的相互作用上建模的。 绑定 12588871
MAPK3 ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 mitogen-activated protein kinase 3 - HPRD,Biogrid 11131153
妈妈 卡拉|CD10 |DKFZP686O16152 |MGC126681 |MGC126707 |NEP 膜金属内肽酶 - HPRD,Biogrid 8943850
MS4A2 APY |atopy |fcer1b |fceri |伊格尔|伊格|igher |MS4A1 跨膜四域,亚家族A,成员2(IgE的FC片段,高亲和力I,受体;β多肽) - HPRD 7528770|7612892
MUC1 CD227 | EMA | H23AG | MAM6 | PEM | PEMT | PUM mucin 1, cell surface associated Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
BioGRID 12750561
nedd9 CAS-L | CAS2 | CASL | CASS2 | HEF1 | dJ49G10.2 | dJ761I2.1 神经前体细胞表达,发育下调9 - HPRD,Biogrid 9020138
NMT1 NMT N- myristoyltransferase 1 - HPRD,Biogrid 11594778
NPHS1 CNF |nphn 肾脏病1,先天性,芬兰类型(肾素) - HPRD 12846735
PAG1 CBP | FLJ37858 | MGC138364 | PAG 与糖磷脂微域1相关的磷蛋白1 - HPRD,Biogrid 10790433
PDE4A DPDE2 | PDE4 | PDE46 phosphodiesterase 4A, cAMP-specific (phosphodiesterase E2 dunce homolog, Drosophila) - HPRD,Biogrid 10206997
pde4d dpde3 |HSPDE4D |PDE4DN2 |strk1 磷酸二酯酶4D,营地特异性(磷酸二酯酶E3 Dunce同源物,果蝇) PDE4D4与Lyn SH3域相互作用。 绑定 10571082
PECAM1 CD31 |PECAM-1 血小板/内皮细胞粘附分子 - HPRD,Biogrid 10858437
PIK3CG pi3cg |PI3K |pi3kgamma |PIK3 磷酸肌醇3-激酶,催化,伽马多肽 - HPRD,Biogrid 10318860
PLCG1 PLC-II | PLC1 | PLC148 | PLCgamma1 磷脂酶C,伽马1 - HPRD 10586033
PLCG2 - 磷脂酶C,伽马2(磷脂酰肌醇特异性) Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
BioGRID 8395016|10981967
PPP1R15A GADD34 蛋白质磷酸酶1,调节(抑制剂)亚基15A - HPRD,Biogrid 11517336
PPP1R8 ARD-1 | ARD1 | NIPP-1 | NIPP1 | PRO2047 protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 8 - HPRD,Biogrid 11104670
PRAM1 MGC39864 |婴儿车-1 PML-RARA调节的适配器分子1 - HPRD,Biogrid 11301322
prkcq MGC126514 | MGC141919 | PRKCT | nPKC-theta protein kinase C, theta - HPRD 11358993
prkdc DNA-PKcs | DNAPK | DNPK1 | HYRC | HYRC1 | XRCC7 | p350 蛋白激酶,DNA激活,催化多肽 - HPRD,Biogrid 9748231
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 Affinity Capture-Western BioGRID 9169439
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 - HPRD 11389892
ptk2b Cadtk |cakb |fadk2 |fak2 |frnk |PKB |PTK |pyk2 |筏 PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β - HPRD,Biogrid 11311138
PTPN6 HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体6型 - HPRD,Biogrid 10574931
PTPRC B220 | CD45 | CD45R | GP180 | LCA | LY5 | T200 protein tyrosine phosphatase, receptor type, C Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
BioGRID 7516335
RGS16 A28-RGS14 |A28-RGS14P |RGS-R regulator of G-protein signaling 16 Lyn磷酸化RGS16。这种相互作用是基于未指定物种与人RSG16的LYN之间的相互作用建模的。 绑定 12588871
RPL10 DKFZP686J1851 |DXS648 |DXS648E |FLJ23544 |FLJ27072 |十一月|QM 核糖体蛋白L10 Reconstituted Complex BioGRID 12138090
RPS6KB1 PS6K | S6K | S6K1 | STK14A | p70(S6K)-alpha | p70-S6K | p70-alpha ribosomal protein S6 kinase, 70kDa, polypeptide 1 Biochemical Activity BioGRID 16640565
RPS6KB2 KLS |p70-beta |p70-beta-1 |p70-beta-2 |s6k-beta2 |S6K2 |SRK |STK14B |P70(S6K)-Beta |P70S6KB ribosomal protein S6 kinase, 70kDa, polypeptide 2 Biochemical Activity BioGRID 16640565
SH2B2 APS SH2B适配器蛋白2 - HPRD 10872802
SHC1 FLJ26504 |SHC |SHCA SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 1 - HPRD,Biogrid 7650013
SKAP1 SCAP1 | SKAP55 SRC激酶相关的磷蛋白1 - HPRD,Biogrid 9195899
SKAP2 MGC10411 |MGC33304 |prap |RA70 |SAPS |scap2 |skap-hom |SKAP55R SRC激酶相关的磷蛋白2 - HPRD,Biogrid 9837776
SRC ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (avian) 蛋白质肽 BioGRID 9169421
Syk dkfzp313n1010 |FLJ25043 |FLJ37489 spleen tyrosine kinase - HPRD,Biogrid 7831290
tec MGC126760 |MGC126762 |PSCTK4 TEC蛋白酪氨酸激酶 Affinity Capture-Western BioGRID 11071635
trat1 HSPC062 | TCRIM | TRIM T细胞受体相关的跨膜适配器1 Reconstituted Complex BioGRID 10790433
TRPV4 OTRPC4 |TRP12 |VR-OAC |VRL-2 |VRL2 |Vroac 瞬态受体电势阳离子通道,亚家族V,成员4 - HPRD,Biogrid 12538589
tyk2 JTK1 tyrosine kinase 2 - HPRD,Biogrid 9633884
UBB FLJ25987 |MGC8385 泛素b Lyn与泛素相互作用。 绑定 11046148
UNC119 HRG4 UNC-119同源物(秀丽隐杆线虫) - HPRD,Biogrid 12496276


V.途径注释

路径名 Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG CHEMOKINE SIGNALING PATHWAY 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG B细胞受体信号通路 75 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FC EPSILON RI SIGNALING PATHWAY 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 97 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG长期抑郁症 70 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
幽门螺杆菌感染中的KEGG上皮细胞信号传导 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta BCR途径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Epha4途径 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta FCER1途径 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Ptdins途径 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA B CELL RECEPTOR COMPLEXES 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B淋巴细胞中的SIG PIP3信号传导 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG BCR信号通路 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST B细胞抗原受体 40 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FCER1途径 62 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID BCR 5 Pathway 65 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径 66 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID GMCSF途径 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Glypican 1 Pathway 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PTP1B途径 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID p38 alpha beta途径 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TXA2 Pathway 57 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL5 PATHWAY 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3KCI途径 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AMB2中性粒细胞途径 41 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Epha FWDPathway 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB PATHWAY 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL8 CXCR2途径 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID套件途径 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPO途径 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL8 CXCR1途径 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPHRINB REV PATHWAY 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PIDα突触核蛋白途径 33 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY SCF KIT 78 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组生长激素受体信号传导 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
套件信号的反应组调节 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ANTIGEN ACTIVATES B CELL RECEPTOR LEADING TO GENERATION OF SECOND MESSENGERS 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL 91 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组血小板粘附于暴露的胶原蛋白 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PECAM1相互作用 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPVI MEDIATED ACTIVATION CASCADE 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome CD28 CO刺激 32 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME COSTIMULATION BY THE CD28 FAMILY 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome CTLA4抑制信号传导 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ILS的Reactome信号传导 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF SIGNALING BY CBL 18 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL 3 5和GM CSF信号传导 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放射疗法反应性DN 92 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水抑制 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 8HR UP 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELYS THYROID CANCER UP 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BARRIER CANCER RELAPSE TUMOR SAMPLE UP 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王·巴雷特(Wang Barretts)食道 51 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schramm Inhba目标DN 24 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIRMEIER LMP1 RESPONSE LATE UP 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王对贝克索烯DN的响应 29 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇8 36 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI PRE BI LYMPHOCYTE DN 77 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori未成熟B淋巴细胞向上 53 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER PBL KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR DN 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Golub所有vs AML DN 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DORSAM HOXA9 TARGETS DN 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园HSC标记 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR UP 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染18小时 178 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HNE和TBH的Weigel氧化应激 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂响应和XPC向上 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tracey对IFNA2 DN的抗性 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Finetti乳腺癌绿色 16 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tsuda肺泡软零件肉瘤 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼的抵抗 81 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindstedt树突状细胞成熟B 53 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
炎症反应和胆固醇 58 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS BOUND BY PML RARA FUSION 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-330 444 450 M8 HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-378 139 145 1a hsa-miR-378 cuccugacuccaggucugugu