SZGR2 - Beplay体育中心

概括？

GeneID	408
Symbol	ARRB1
Synonyms	ARB1 \| ARR1
Description	arrestin, beta 1
Reference	MIM:107940\|HGNC:HGNC:711\|ENSEMBL：ENSG00000137486\|HPRD：00146\|Vega：Otthumg00000165444
基因类型	蛋白质编码
Map location	11q13
Pascal p-value	0.045
胎儿β	-0.419
DMG	1(# studies)
Support	COMPOSITESET Darnell FMRP targets

数据源中的基因

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
CV:PGCnp	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG：Wockner_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。	1
PMID：cooccur	High-throughput literature-search	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature	High-throughput literature-search	Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias	点击显示详细信息
Network	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	Contribution to shortest path in PPI network: 0.0119

第一节遗传学和表观遗传学注释

Differentially methylated gene

Probe	染色体	位置	Nearest gene	p（dis）	Beta (dis)	fdr（dis）	学习
CG02449461	11	75061838	ARRB1	1.373E-4	0.271	0.031	DMG：Wockner_2014

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

Top 10 positively co-expressed genes
Gene	Pearson's Correlation	Spearman's Correlation
SLC16A2	0.92	0.93
PTPN9	0.91	0.94
TGFBRAP1	0.91	0.93
PUM1	0.90	0.92
SARM1	0.90	0.92
三人组	0.90	0.93
TBC1D14	0.90	0.94
ZCCHC14	0.90	0.94
ZMYM3	0.90	0.92
FOXJ2	0.90	0.93

Top 10 negatively co-expressed genes
Gene	Pearson's Correlation	Spearman's Correlation
AF347015.31	-0.76	-0.84
MT-CO2	-0.75	-0.85
AF347015.27	-0.72	-0.81
FXYD1	-0.72	-0.80
AF347015.33	-0.72	-0.79
C5orf53	-0.71	-0.74
mt-cyb	-0.71	-0.80
AF347015.8	-0.71	-0.82
S100B	-0.71	-0.78
HIGD1B	-0.70	-0.82

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005515	蛋白质结合	IPI		17353931\|17620599
GO:0004857	enzyme inhibitor activity	TAS		2163110
Biological process	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0007165	信号transduction	TAS		9924018
去：0007600	sensory perception	IEA		-
GO：0050896	response to stimulus	IEA		-
Cellular component	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005834	异三聚体G蛋白复合物	TAS		10823817
去：0005624	membrane fraction	IDA		10823817
去：0005625	soluble fraction	TAS		9924018
去：0005737	细胞质	IDA		10823817
去：0005886	plasma membrane	TAS		9924018

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	官方全名b	实验	资源	PubMed ID
ADRB1	ADRB1R \|b1ar \|beta1ar \|Rhr	肾上腺素能，β-1-受体	-	HPRD,BioGRID	10862778
ADRBK1	bark1 \|beta-ark1 \|FLJ16718 \|grk2	adrenergic, beta, receptor kinase 1	-	HPRD	8885248
AP2B1	ADTB2 \|AP105B \|ap2-beta \|clapb1 \|DKFZP781K0743	与Adaptor相关的蛋白质复合物2，β1亚基	-	HPRD	11777907
AP3B1	adtB3 \| ADTB3A \| HPS \| HPS2 \| PE	与Adaptor相关的蛋白质复合物3，β1亚基	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
ARF6	DKFZp564M0264	ADP-ribosylation factor 6	-	HPRD,BioGRID	11533043\|11867621
ARR3	ARRX	逮捕素3，视网膜（X-arrestin）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
ARRB2	ARB2 \| ARR2 \| BARR2 \| DKFZp686L0365	arrestin, beta 2	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
BOP1	KIAA0124	增殖块1	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
CCL14	CC-1 \| CC-3 \| CKb1 \| HCC-1 \| HCC-3 \| MCIF \| NCC-2 \| NCC2 \| SCYA14 \| SCYL2 \| SY14	chemokine (C-C motif) ligand 14	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
CCR2	CC-CKR-2 \| CCR2A \| CCR2B \| CD192 \| CKR2 \| CKR2A \| CKR2B \| CMKBR2 \| MCP-1-R	chemokine (C-C motif) receptor 2	-	HPRD	9501202
CCR5	CC-CKR-5 \|CCCKR5 \|CD195 \|CKR-5 \|CKR5 \|CMKBR5	趋化因子（C-C基序）受体5	-	HPRD,BioGRID	12065593
CHD1	DKFZp686E2337	chromodomain helicase DNA binding protein 1	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
cltc	CHC \|CHC17 \|CLH-17 \|cltcl2 \|HC \|KIAA0034	网状蛋白，重链（HC）	-	HPRD	9827808
CMBL	FLJ23617	carboxymethylenebutenolidase homolog (Pseudomonas)	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
CSK	MGC117393	c-src tyrosine kinase	-	HPRD,BioGRID	10753943
CSNK2A1	CK2A1 \| CKII	酪蛋白激酶2，α1多肽	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
Cyth2	ARNO \| CTS18 \| CTS18.1 \| PSCD2 \| PSCD2L \| SEC7L \| Sec7p-L \| Sec7p-like	细胞嵌素2	-	HPRD,BioGRID	11533043
DDX27	DKFZp667N057 \| FLJ12917 \| FLJ20596 \| FLJ22238 \| HSPC259 \| MGC1018 \| MGC163147 \| PP3241 \| RHLP \| Rrp3p \| dJ686N3.1	死亡（ASP-GLU-ALA-ASP）盒多肽27	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
DVL1	DVL \|MGC54245	Dish，DSH同源1（果蝇）	-	HPRD,BioGRID	11742073
DVL2	-	Dish，DSH同源2（果蝇）	-	HPRD,BioGRID	11742073
fgr	FLJ43153 \|MGC75096 \|src2 \|C-FGR \|C-SRC2 \|p55c-fgr \|p58c-fgr	Gardner-Rasheed猫科动物病毒（V-FGR）癌基因同源物	-	HPRD	10973280
gnmt	-	glycine N-methyltransferase	两个杂交	Biogrid	16189514
GNRHR	GNRHR1 \| GRHR \| LHRHR \| LRHR	促性腺激素释放激素受体	-	HPRD	11278883
HDGF2	MGC2641	肝瘤生长因子相关蛋白2	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
IL8RB	CD182 \| CDw128b \| CMKAR2 \| CXCR2 \| IL8R2 \| IL8RA	interleukin 8 receptor, beta	-	HPRD,BioGRID	11170396
JAK1	JAK1A \| JAK1B \| JTK3	Janus kinase 1 (a protein tyrosine kinase)	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
KHK	-	ketohexokinase (fructokinase)	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
KPNA3	IPOA4 \|srp1gamma \|srp4 \|HSRP1	karyopherin alpha 3 (importin alpha 4)	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
MAPK10	FLJ12099 \|FLJ33785 \|JNK3 \|jnk3a \|MGC50974 \|prkm10 \|P493F12 \|P54BSAPK	有丝分裂原激活的蛋白激酶10	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	11356842
MDM2	HDMX \| MGC71221 \| hdm2	Mdm2 p53 binding protein homolog (mouse)	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12538596
NFKBIA	IKBA \| MAD-3 \| NFKBI	nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, alpha	Beta-arr1与I-Kappa-B-Alpha相互作用，以防止I-Kappa-B-Alpha的磷酸化和降解。	绑定	15125834
NOLC1	KIAA0035 \|NOPP130 \|NOPP140 \|NS5ATP13 \|P130	nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
NSF	SKD2	N-乙基马来酰亚胺敏感因子	-	HPRD,BioGRID	10196135
OPRD1	OPRD	阿片受体，三角洲1	-	HPRD,BioGRID	11259507
pde4d	DPDE3 \| HSPDE4D \| PDE4DN2 \| STRK1	phosphodiesterase 4D, cAMP-specific (phosphodiesterase E3 dunce homolog, Drosophila)	The amino-terminus of PDE4D5 interacts with Beta-Arrestin 1.	绑定	14500724
pes1	pes	Pescadillo同源物1，包含BRCT域（斑马鱼）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
pth1r	MGC138426 \| MGC138452 \| PTHR \| PTHR1	parathyroid hormone 1 receptor	-	HPRD	12220636
pthlh	hhm \|MGC14611 \|PLP \|PTHR \|PTHRP	甲状旁腺激素样激素	-	HPRD,BioGRID	12220636
RALGDS	FLJ20922 \|RGF \|拉尔奇夫	鸟嘌呤核苷酸解离刺激剂	-	HPRD,BioGRID	12105416
RPL7L1	MGC62004 \| dJ475N16.4	ribosomal protein L7-like 1	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
RTF1	CDG1N \|GTL7 \|KIAA0252	RTF1，PAF1/RNA聚合酶II复合成分，同源物（S. cerevisiae）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SLC9A5	NHE5	solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 5	β-arr1的未指定同工型与NHE5相互作用。	绑定	15699339
TCOF1	MFD1 \| treacle	背叛者Collins-Franceschetti综合征1	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
trhr	MGC141920	甲状腺蛋白释放激素受体	-	HPRD	12393857
ZBTB43	ZBTB22B \|Znf-X \|ZNF297B	锌指和含有43的BTB结构域	两个杂交	Biogrid	16189514
ZRANB2	DKFZP686J1831 \|DKFZP686N09117 \|FLJ41119 \|zis \|zis1 \|zis2 \|ZNF265	锌指，持续2个包含2个	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931

V.途径注释

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
kegg mapk信号通路	267	205	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG趋化因子信号传导途径	190	128	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG内吞作用	183	132	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AGPCR PATHWAY	13	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Barr MAPK途径	12	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA BARRESTIN SRC PATHWAY	15	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Barrestin途径	10	8	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6途径	35	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL8 CXCR2 PATHWAY	34	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR3 PATHWAY	43	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID凝血酶PAR1途径	43	32	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL8 CXCR1 PATHWAY	28	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MEMBRANE TRAFFICKING	129	74	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trans Golgi网络囊泡芽	60	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的Notch1将信号传输到细胞核	27	18	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Notch的Reactome信号传导1	70	46	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组溶酶体囊泡生物发生	23	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GOLGI ASSOCIATED VESICLE BIOGENESIS	53	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME THROMBIN SIGNALLING THROUGH PROTEINASE ACTIVATED RECEPTORS PARS	32	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Notch的Reactome信号传导	103	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS	466	331	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板激活信号传导和聚集	208	138	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARENT MTOR SIGNALING UP	567	375	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤	783	507	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI PAX FOXO1 SIGNATURE IN ARMS UP	59	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
igarashi atf4靶向dn	90	65	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS	332	228	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标	255	177	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni Rhabdomyosarcoma PAX FOXO1融合	64	37	该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病	1382	904	该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础	380	215	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应	184	125	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP靶向	306	188	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BASAKI YBX1 TARGETS DN	384	230	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ODONNELL TFRC TARGETS UP	456	228	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL DN	186	107	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LASTOWSKA NEUROBLASTOMA COPY NUMBER DN	800	473	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEREZ TP53 TARGETS	1174	695	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEREZ TP63 TARGETS	355	243	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53和TP63目标	205	145	该途径中的所有SZGR 2.0基因
EBAUER目标PAX3 FOXO1融合DN	48	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scheidereit IKK相互作用蛋白	58	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YORDY RECIPROCAL REGULATION BY ETS1 AND SP100 UP	25	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向	414	287	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS ELK3靶向	27	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 UP	209	139	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 ONLY DN	44	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOYAMA SEMA3B TARGETS DN	411	249	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应120 HELA	69	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon	158	93	该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增	94	60	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOREAUX MULTIPLE MYELOMA BY TACI UP	412	249	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 DN	830	547	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应	953	554	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应	911	527	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应	1011	592	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5	482	296	该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默	282	183	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性	578	341	该途径中的所有SZGR 2.0基因
QI PLASMACYTOMA UP	259	185	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC目标	153	107	该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN	435	289	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN IMMATURE TO MATURE B LYMPHOCYTE UP	43	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4	196	124	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向	395	249	该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特（Nielsen Gist）	98	66	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS BOUND BY PML RARA FUSION	456	287	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK GLIOBLASTOMA NEURAL	129	85	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS CONFLUENT	567	365	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG RESPONSE TO GSK3 INHIBITOR SB216763 DN	374	217	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3	430	288	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应	898	516	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7	403	240	该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘IL13内存模型	17	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38	337	236	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DURAND STROMA S UP	297	194	该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family	Target position			miRNA ID	mirna seq
miRNA family	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
miR-22	429	436	1A，M8	hsa-miR-22^brain	Aagcugccaguugaagaacugu
mir-379	107	113	1A	HSA-MIR-379^brain	UgguagacuauggaaCGUA
mir-431	380	386	1A	hsa-miR-431	uguugcaggccguauga

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击这里to see the list of SZ related miRNAs.
Brain: miRNAs which are expressed in brain based on miRNA microarray expression studies. Click这里查看与大脑相关的miRNA列表。

Gene Page:ARRB1