基因页：MARCKS

概括?
GeneID 4082
Symbol MARCKS
同义词 80K-L|MACS|PKCSL|PRKCSL
描述 myristoylated alanine rich protein kinase C substrate
参考 MIM:177061|HGNC：HGNC：6759|Ensembl:ENSG00000277443|HPRD:07519|Vega：Otthumg00000188327
Gene type protein-coding
地图位置 6Q22.2
Pascal P值 0.37
Fetal beta 1.605
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
Meta
支持 canabinoid
DOPAMINE
INTRACELLULAR SIGNAL TRANSDUCTION
代谢性谷氨酸受体
SEROTONIN
Potential synaptic genes

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.01

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs7835277 chr8 62922905 MARCKS 4082 0.06 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005516 calmodulin binding 塔斯 1560845
GO:0051015 肌动蛋白丝结合 塔斯 1560845
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005813 中心体 IEA -
GO:0005737 细胞质 IEA -
GO:0016020 膜 IEA -
去：0005938 cell cortex IEA -
GO：0015629 actin cytoskeleton 塔斯 1560845
GO：0042585 germinal vesicle IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG FC GAMMA R MEDIATED PHAGOCYTOSIS 97 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CALCINEURIN PATHWAY 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME集成ENERGY METABOLISM 120 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素分泌的反应组调节 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乙酰胆碱对胰岛素分泌的反应组调节 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI TARGETS OF PAX FOXO1 FUSIONS DN 68 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI RHABDOMYOSARCOMA PAX FOXO1 FUSION DN 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LIVE UP 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水抑制 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素DN的反应 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bilban B Cll LPL DN 42 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOEBEKE LYMPHOID STEM CELL DN 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向 112 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION DN 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIDUS METASTASIS UP 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAHTOLA MYCOSIS FUNGOIDES SKIN UP 177 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LANDIS ERBB2 BREAST TUMORS 65 DN 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHANSSON GLIOMAGENESIS BY PDGFB UP 58 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOV MUTATED IN COLON CANCER 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Cisplatin抗性DN 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HERNANDEZ ABERRANT MITOSIS BY DOCETACEL 2NM UP 81 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIRMEIER LMP1 RESPONSE LATE UP 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yanagihara ESX1目标 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEINMANN ADAPTATION TO HYPOXIA UP 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
温曼对缺氧DN的适应 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Simbulan UV响应正常DN 33 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
仅通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRIDMAN SENESCENCE DN 13 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori成熟B淋巴细胞DN 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 UP 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标 108 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OKUMURA INFLAMMATORY RESPONSE LPS 183 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD2 45 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nguyen Notch1靶向DN 86 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING CEREBRAL CORTEX UP 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEN LVAD SUPPORT OF FAILING HEART DN 42 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5 TARGETS UP 203 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV 8 HR DN 53 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takao对UVB辐射DN的响应 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 0HR 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 11 57 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG HYPOXIA NORMAL 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D8 40 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MONNIER POSTRADIATION TUMOR ESCAPE DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T7 98 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标DN 105 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IWANAGA CARCINOGENESIS BY KRAS PTEN DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO NORMAL TISSUE ADJACENT TO LIVER TUMOR UP 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEN HOXA5 TARGETS 9HR DN 41 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVIES MULTIPLE MYELOMA VS MGUS DN 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA D DN 78 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHAUHAN RESPONSE TO METHOXYESTRADIOL DN 102 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION B 53 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 DN 245 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANASSE BCL2 TARGETS DN 74 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN IMMATURE TO MATURE B LYMPHOCYTE DN 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE RECENT THYMIC EMIGRANT 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan V1后期分化基因上升 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOO LIVER CANCER RECURRENCE UP 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA PCA3 DN 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO HEPATOBLASTOMA UP 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇9的时间反应9 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI INDUCED T TO NATURAL KILLER DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS CALB1 CORR UP 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
国外RB1增长目标 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 UP 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS DN 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir30目标 116 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOLLEMAN ASPARAGINASE RESISTANCE ALL DN 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF持续DN 61 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-128 801 807 1A HSA-MIR-128A UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
HSA-MIR-128B UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
mir-138 783 789 1A hsa-miR-138脑 Agcugguuguguugaauc
mir-142-3p 555 562 1A,m8 HSA-MIR-142-3P uguaguuuccuacuuuaugga
mir-143 191 197 1A hsa-miR-143脑 ugagaugaagcacuguagcuca
mir-144 961 967 m8 hsa-miR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-181 1124 1130 1A hsa-miR-181a脑 aacauucaacgcugucggugagu
hsa-miR-181bSZ aacauucauugcugucggggg
hsa-miR-181c脑 aacauucaaccugucggugagu
hsa-miR-181d脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-182 455 462 1A,m8 hsa-miR-182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
MiR-200BC/429 293 300 1A,m8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
miR-205 373 380 1A,m8 HSA-MIR-205 uccuucauucccggagucug
miR-218 839 845 m8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-23 1210 1217 1A,m8 hsa-miR-23a脑 aucacauugccagggauucc
hsa-miR-23b脑 aucacauugccagggauuacc
mir-27 801 807 m8 hsa-miR-27a脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
hsa-miR-27b脑 uucacaguggcuaaguucugc
miR-299-5p 655 661 1A HSA-MIR-299-5P UGGUUUACCGUCCCACAUACAU
miR-30-5p 548 554 1A hsa-miR-30a-5p uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
miR-323 1210 1216 1A HSA-MIR-323脑 GCACAUUACACGGUCGACCUCU
mir-370 785 791 m8 hsa-miR-370脑 gccugggggguggaaccugg
mir-381 811 817 1A hsa-miR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
hsa-miR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
miR-421 540 546 1A HSA-MIR-421 GGCCUCAUUAAAUGUUUGUUG
mir-491 178 185 1A,m8 hsa-miR-491脑 aguggggaacccuuccaugga
mir-495 44 50 m8 hsa-miR-495脑 AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU
hsa-miR-495脑 AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU
mir-499 638 644 m8 hsa-miR-499 uuaagacuugcagugauguuaa