基因页面:ARRB2
总结吗?
GeneID | 409年 |
象征 | ARRB2 |
同义词 | ARB2 | ARR2 | BARR2 |
描述 | arrestin,β2 |
参考 | MIM: 107941|HGNC: HGNC: 712|运用:ENSG00000141480|HPRD: 00147|织女:OTTHUMG00000090759 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 17 p13 |
帕斯卡假定值 | 0.271 |
夏洛克假定值 | 0.065 |
胎儿β | -0.516 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
认为:Guipponi_2014 | 全外显子组测序分析 | 49认为被确定通过比较外显子组53个人零星SCZ和未受感染的父母 | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ARRB2 | G | 一个 | NM_001257331 | p.P161P | 同义的 | NA | NA | 精神分裂症 | 认为:Guipponi_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ARRB2_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ADAM23 | 0.91 | 0.89 |
ATP2A2 | 0.91 | 0.91 |
AAK1 | 0.90 | 0.87 |
MAP7D2 | 0.90 | 0.87 |
KCNC2 | 0.88 | 0.74 |
PPM1H | 0.88 | 0.83 |
KCND3 | 0.88 | 0.87 |
ANKRD34C | 0.88 | 0.59 |
CDS1 | 0.88 | 0.85 |
PAQR9 | 0.87 | 0.84 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RAB13 | -0.40 | -0.53 |
EFEMP2 | -0.40 | -0.41 |
RAB34 | -0.39 | -0.49 |
RPL35 | -0.38 | -0.43 |
BCL7C | -0.38 | -0.44 |
GTF3C6 | -0.38 | -0.33 |
NME4 | -0.37 | -0.46 |
C1orf61 | -0.37 | -0.52 |
AC006276.2 | -0.37 | -0.35 |
RPL31 | -0.36 | -0.37 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17353931|17620599 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0001932 | 调节蛋白质磷酸化氨基酸 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007179 | 转化生长因子β受体信号通路 | 艾达 | 12958365 | |
去:0008277 | g蛋白耦合调节受体蛋白信号通路 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007600 | 感官知觉 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0031623 | 受体内化 | 艾达 | 12958365 | |
去:0050896 | 刺激反应 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005886 | 等离子体膜 | 助教 | 9346876 | |
去:0031410 | 胞质囊泡 | 艾达 | 12958365 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AGTR1 | 银2 | AGTR1A | AGTR1B | AT1 | AT1B | AT1R | AT2R1 | AT2R1A | AT2R1B | HAT1R | 血管紧张素ⅱ受体1型 | - - - - - - | HPRD | 11279203 |
AP1B1 | ADTB1 | AP105A | BAM22 | CLAPB2 | adaptor-related蛋白复合物1,β1亚基 | - - - - - - | HPRD | 10097102|12070169 |
AP2B1 | ADTB2 | AP105B | AP2-BETA | CLAPB1 | DKFZp781K0743 | adaptor-related蛋白复合物2,β1亚基 | 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 10097102|12070169 |
AP3B1 | ADTB3 | ADTB3A | HPS | HPS2 | PE | adaptor-related蛋白复合物3β1亚基 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
ARF6 | DKFZp564M0264 | ADP-ribosylation因子6 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11533043|11867621 |
ARRB1 | ARB1 | ARR1 | arrestin,β1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
AVPR2 | ADHR | DI1 | DIR | DIR3 | MGC126533 | MGC138386 | NDI | V2R | 精氨酸加压素受体2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12473660 |
BOP1 | KIAA0124 | 的增殖1块 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
中国卫星发射测控系统部 | CHC | CHC17 | CLH-17 | CLTCL2 | Hc | KIAA0034 | 网格蛋白重链(Hc) | - - - - - - | HPRD | 10097102 |
CYTH2 | 阿诺| CTS18 | CTS18.1 | PSCD2 | PSCD2L | SEC7L | Sec7p-L | Sec7p-like | cytohesin 2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11533043 |
DDX27 | DKFZp667N057 | FLJ12917 | FLJ20596 | FLJ22238 | HSPC259 | MGC1018 | MGC163147 | PP3241 | RHLP | Rrp3p | dJ686N3.1 | 死(Asp-Glu-Ala-Asp)框多肽27 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
FBL | FIB | FLRN | RNU3IP1 | fibrillarin | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
KPNA3 | IPOA4 | SRP1gamma | SRP4 | hSRP1 | karyopherinα3 (importinα4) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
KPNA4 | IPOA3 | MGC12217 | MGC26703 | QIP1 | SRP3 | karyopherin alpha 4 (importinα3) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
LHCGR | FLJ41504 | LCGR | LGR2 | LH / CG-R | LH / CGR | LHR | LHRHR | LSH-R | 促黄体激素/ choriogonadotropin受体 | 重新组成复杂 | BioGRID | 11867621 |
MAP2K4 | JNKK | JNKK1 | MAPKK4 | MEK4 | MKK4 | PRKMK4 | SEK1 | SERK1 | 增殖蛋白激酶激酶4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11090355 |
MAP3K5 | ASK1 | MAPKKK5 | MEKK5 | 增殖蛋白激酶激酶激酶5 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 11090355 |
MAP3K5 | ASK1 | MAPKKK5 | MEKK5 | 增殖蛋白激酶激酶激酶5 | - - - - - - | HPRD | 11356842 |
MAPK10 | FLJ12099 | FLJ33785 | JNK3 | JNK3A | MGC50974 | PRKM10 | p493F12 | p54bSAPK | 增殖蛋白激酶10 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11090355|11356842 |
MAPK10 | FLJ12099 | FLJ33785 | JNK3 | JNK3A | MGC50974 | PRKM10 | p493F12 | p54bSAPK | 增殖蛋白激酶10 | - - - - - - | HPRD | 11090355 |
MAPK3 | ERK1 | HS44KDAP | HUMKER1A | MGC20180 | P44ERK1 | P44MAPK | PRKM3 | 增殖蛋白激酶3 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12473660 |
MDM2 | HDMX | MGC71221 | hdm2 | Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12488444|12538596 |
MDM2 | HDMX | MGC71221 | hdm2 | Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) | - - - - - - | HPRD | 11588219|12488444 |12538596 | 12538596|12538596 |
MED8 | ARC32 | MGC17544 | MGC19641 | 中介复杂的亚基8 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
MRPL43 | MGC17989 | MGC48892 | bMRP36a | 线粒体核糖体蛋白承办 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
MRPL44 | FLJ12701 | FLJ13990 | FLJ37688 | L44MT | MRP-L44 | 线粒体核糖体蛋白L44 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
NFKBIA | IKBA | MAD-3 | NFKBI | 核因子k光多肽基因增强剂b细胞抑制剂,α | 的氨基酸Beta-Arr2与I-kappa-B-alpha的羧基端防止I-kappa-B-alpha磷酸化和退化。 | 绑定 | 15125834 |
NOLC1 | KIAA0035 | NOPP130 | NOPP140 | NS5ATP13 | P130 | 核仁的和coiled-body磷蛋白质1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
nt | nmn能否- 125 | NN | NT | | NTS1 NT / N | 神经降压素 | - - - - - - | HPRD | 12473660 |
NTSR1 | NTR | 神经降压素受体1(高亲和力) | - - - - - - | HPRD | 11279203 |
OPRD1 | OPRD | 阿片受体,δ1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11259507 |
OXTR | OT-R | 催产素受体 | - - - - - - | HPRD | 11279203 |
PDE4D | DPDE3 | HSPDE4D | PDE4DN2 | STRK1 | 磷酸二酯酶4 d, cAMP-specific(磷酸二酯酶E3傻瓜同族体,果蝇) | PDE4D5与Beta-Arrestin 2。 | 绑定 | 14500724 |
PES1 | PES | pescadillo同族体1,包含BRCT域(斑马鱼) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
PTAFR | PAFR | platelet-activating因子受体 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11729201 |
PTAFR | PAFR | platelet-activating因子受体 | - - - - - - | HPRD | 9037196 |
RAB5C | MGC117217 | MGC138857 | RAB5CL | RABL | RAB5C, RAS致癌基因家族成员 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
RALGDS | FLJ20922 | RGF | RalGEF | 、鸟嘌呤核苷酸分解刺激器 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12105416 |
RPL7L1 | MGC62004 | dJ475N16.4 | 核糖体蛋白L7-like 1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
SLC9A5 | NHE5 | 溶质载体家庭9(/钠氢交换器),成员5 | Beta-Arr2与NHE5交互。 | 绑定 | 15699339 |
SMARCC2 | BAF170 | CRACC2 | Rsc8 | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚c,成员2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
SMO | Gx | SMOH | 平和同族体(果蝇) | Beta-arr2与Smo。之间的交互是仿照了交互Beta-arr2和Smo都从一个未指明的物种。 | 绑定 | 15618519 |
STC2 | STC-2 | STCRP | stanniocalcin 2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
TCOF1 | MFD1 |蜜糖 | 天生Collins-Franceschetti综合征1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
韦 | MGC125964 | MGC125965 | thyrotropin-releasing激素 | - - - - - - | HPRD | 12473660 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG MAPK信号通路 | 267年 | 205年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG趋化因子信号通路 | 190年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG内吞作用 | 183年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG嗅觉传导 | 389年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID WNT不在经典里的通路 | 32 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID NFKAPPAB典型途径 | 17 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID ARF6通路 | 35 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID TXA2PATHWAY | 57 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID趋化因子受体CXCR4通路 | 102年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID ALK1通路 | 26 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID NEPHRIN NEPH1通路 | 31日 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID IL8 CXCR2通路 | 34 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID刺猬2通道 | 22 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID刺猬GLI通路 | 48 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID IL8 CXCR1通路 | 28 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID TGFBR通路 | 55 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
细胞核REACTOME激活NOTCH1传送信号 | 27 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由NOTCH1 REACTOME信号 | 70年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME凝血酶通过蛋白酶激活受体PARS信号 | 32 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME信号通过切口 | 103年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME止血 | 466年 | 331年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME血小板激活信号和聚合 | 208年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PRAMOONJAGO SOX4目标 | 51 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
刘CMYB目标了 | 165年 | 106年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯NTN1 DN的目标 | 158年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王CLIM2目标了 | 269年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHOW RASSF1目标了 | 27 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林格伦膀胱癌集群1 DN | 378年 | 231年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
林格伦膀胱癌集群3 | 329年 | 196年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过ERCC3滑落紫外线反应 | 309年 | 199年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
佩特洛娃内皮淋巴和血液 | 131年 | 87年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染血巨细胞病毒12小时 | 111年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
低音部毛细胞白血病DN | 80年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
奥巴马回应DARAPLADIB | 29日 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
陈代谢症侯群网络 | 1210年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金所有障碍持续时间CORR DN | 146年 | 90年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HOLLEMAN天冬酰胺酶抗B DN | 15 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HOLLEMAN天冬酰胺酶抵抗所有的DN | 25 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 365 | 192年 | 199年 | 1、m8 | hsa - mir - 365 | UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU |