总结吗?
GeneID 409年
象征 ARRB2
同义词 ARB2 | ARR2 | BARR2
描述 arrestin,β2
参考 MIM: 107941|HGNC: HGNC: 712|运用:ENSG00000141480|HPRD: 00147|织女:OTTHUMG00000090759
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 17 p13
帕斯卡假定值 0.271
夏洛克假定值 0.065
胎儿β -0.516

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
认为:Guipponi_2014 全外显子组测序分析 49认为被确定通过比较外显子组53个人零星SCZ和未受感染的父母
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
ARRB2 G 一个 NM_001257331 p.P161P 同义的 NA NA 精神分裂症 认为:Guipponi_2014


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
ADAM23 0.91 0.89
ATP2A2 0.91 0.91
AAK1 0.90 0.87
MAP7D2 0.90 0.87
KCNC2 0.88 0.74
PPM1H 0.88 0.83
KCND3 0.88 0.87
ANKRD34C 0.88 0.59
CDS1 0.88 0.85
PAQR9 0.87 0.84
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
RAB13 -0.40 -0.53
EFEMP2 -0.40 -0.41
RAB34 -0.39 -0.49
RPL35 -0.38 -0.43
BCL7C -0.38 -0.44
GTF3C6 -0.38 -0.33
NME4 -0.37 -0.46
C1orf61 -0.37 -0.52
AC006276.2 -0.37 -0.35
RPL31 -0.36 -0.37

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 17353931|17620599
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0001932 调节蛋白质磷酸化氨基酸 国际能源机构 - - - - - -
去:0007165 信号转导 国际能源机构 - - - - - -
去:0007179 转化生长因子β受体信号通路 艾达 12958365
去:0008277 g蛋白耦合调节受体蛋白信号通路 国际能源机构 - - - - - -
去:0007600 感官知觉 国际能源机构 - - - - - -
去:0031623 受体内化 艾达 12958365
去:0050896 刺激反应 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005622 细胞内的 国际能源机构 - - - - - -
去:0005634 国际能源机构 - - - - - -
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -
去:0005886 等离子体膜 助教 9346876
去:0031410 胞质囊泡 艾达 12958365

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
AGTR1 银2 | AGTR1A | AGTR1B | AT1 | AT1B | AT1R | AT2R1 | AT2R1A | AT2R1B | HAT1R 血管紧张素ⅱ受体1型 - - - - - - HPRD 11279203
AP1B1 ADTB1 | AP105A | BAM22 | CLAPB2 adaptor-related蛋白复合物1,β1亚基 - - - - - - HPRD 10097102|12070169
AP2B1 ADTB2 | AP105B | AP2-BETA | CLAPB1 | DKFZp781K0743 adaptor-related蛋白复合物2,β1亚基 重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 10097102|12070169
AP3B1 ADTB3 | ADTB3A | HPS | HPS2 | PE adaptor-related蛋白复合物3β1亚基 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
ARF6 DKFZp564M0264 ADP-ribosylation因子6 - - - - - - HPRD, BioGRID 11533043|11867621
ARRB1 ARB1 | ARR1 arrestin,β1 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
AVPR2 ADHR | DI1 | DIR | DIR3 | MGC126533 | MGC138386 | NDI | V2R 精氨酸加压素受体2 - - - - - - HPRD, BioGRID 12473660
BOP1 KIAA0124 的增殖1块 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
中国卫星发射测控系统部 CHC | CHC17 | CLH-17 | CLTCL2 | Hc | KIAA0034 网格蛋白重链(Hc) - - - - - - HPRD 10097102
CYTH2 阿诺| CTS18 | CTS18.1 | PSCD2 | PSCD2L | SEC7L | Sec7p-L | Sec7p-like cytohesin 2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11533043
DDX27 DKFZp667N057 | FLJ12917 | FLJ20596 | FLJ22238 | HSPC259 | MGC1018 | MGC163147 | PP3241 | RHLP | Rrp3p | dJ686N3.1 死(Asp-Glu-Ala-Asp)框多肽27 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
FBL FIB | FLRN | RNU3IP1 fibrillarin 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
KPNA3 IPOA4 | SRP1gamma | SRP4 | hSRP1 karyopherinα3 (importinα4) 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
KPNA4 IPOA3 | MGC12217 | MGC26703 | QIP1 | SRP3 karyopherin alpha 4 (importinα3) 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
LHCGR FLJ41504 | LCGR | LGR2 | LH / CG-R | LH / CGR | LHR | LHRHR | LSH-R 促黄体激素/ choriogonadotropin受体 重新组成复杂 BioGRID 11867621
MAP2K4 JNKK | JNKK1 | MAPKK4 | MEK4 | MKK4 | PRKMK4 | SEK1 | SERK1 增殖蛋白激酶激酶4 - - - - - - HPRD, BioGRID 11090355
MAP3K5 ASK1 | MAPKKK5 | MEKK5 增殖蛋白激酶激酶激酶5 亲和力Capture-Western BioGRID 11090355
MAP3K5 ASK1 | MAPKKK5 | MEKK5 增殖蛋白激酶激酶激酶5 - - - - - - HPRD 11356842
MAPK10 FLJ12099 | FLJ33785 | JNK3 | JNK3A | MGC50974 | PRKM10 | p493F12 | p54bSAPK 增殖蛋白激酶10 - - - - - - HPRD, BioGRID 11090355|11356842
MAPK10 FLJ12099 | FLJ33785 | JNK3 | JNK3A | MGC50974 | PRKM10 | p493F12 | p54bSAPK 增殖蛋白激酶10 - - - - - - HPRD 11090355
MAPK3 ERK1 | HS44KDAP | HUMKER1A | MGC20180 | P44ERK1 | P44MAPK | PRKM3 增殖蛋白激酶3 亲和力Capture-Western BioGRID 12473660
MDM2 HDMX | MGC71221 | hdm2 Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) - - - - - - HPRD, BioGRID 12488444|12538596
MDM2 HDMX | MGC71221 | hdm2 Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) - - - - - - HPRD 11588219|12488444
|12538596 | 12538596|12538596
MED8 ARC32 | MGC17544 | MGC19641 中介复杂的亚基8 2台混合动力 BioGRID 16169070
MRPL43 MGC17989 | MGC48892 | bMRP36a 线粒体核糖体蛋白承办 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
MRPL44 FLJ12701 | FLJ13990 | FLJ37688 | L44MT | MRP-L44 线粒体核糖体蛋白L44 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
NFKBIA IKBA | MAD-3 | NFKBI 核因子k光多肽基因增强剂b细胞抑制剂,α 的氨基酸Beta-Arr2与I-kappa-B-alpha的羧基端防止I-kappa-B-alpha磷酸化和退化。 绑定 15125834
NOLC1 KIAA0035 | NOPP130 | NOPP140 | NS5ATP13 | P130 核仁的和coiled-body磷蛋白质1 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
nt nmn能否- 125 | NN | NT | | NTS1 NT / N 神经降压素 - - - - - - HPRD 12473660
NTSR1 NTR 神经降压素受体1(高亲和力) - - - - - - HPRD 11279203
OPRD1 OPRD 阿片受体,δ1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11259507
OXTR OT-R 催产素受体 - - - - - - HPRD 11279203
PDE4D DPDE3 | HSPDE4D | PDE4DN2 | STRK1 磷酸二酯酶4 d, cAMP-specific(磷酸二酯酶E3傻瓜同族体,果蝇) PDE4D5与Beta-Arrestin 2。 绑定 14500724
PES1 PES pescadillo同族体1,包含BRCT域(斑马鱼) 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
PTAFR PAFR platelet-activating因子受体 - - - - - - HPRD, BioGRID 11729201
PTAFR PAFR platelet-activating因子受体 - - - - - - HPRD 9037196
RAB5C MGC117217 | MGC138857 | RAB5CL | RABL RAB5C, RAS致癌基因家族成员 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
RALGDS FLJ20922 | RGF | RalGEF 、鸟嘌呤核苷酸分解刺激器 - - - - - - HPRD, BioGRID 12105416
RPL7L1 MGC62004 | dJ475N16.4 核糖体蛋白L7-like 1 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
SLC9A5 NHE5 溶质载体家庭9(/钠氢交换器),成员5 Beta-Arr2与NHE5交互。 绑定 15699339
SMARCC2 BAF170 | CRACC2 | Rsc8 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚c,成员2 2台混合动力 BioGRID 16169070
SMO Gx | SMOH 平和同族体(果蝇) Beta-arr2与Smo。之间的交互是仿照了交互Beta-arr2和Smo都从一个未指明的物种。 绑定 15618519
STC2 STC-2 | STCRP stanniocalcin 2 2台混合动力 BioGRID 16169070
TCOF1 MFD1 |蜜糖 天生Collins-Franceschetti综合征1 亲和力Capture-MS BioGRID 17353931
MGC125964 | MGC125965 thyrotropin-releasing激素 - - - - - - HPRD 12473660


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG MAPK信号通路 267年 205年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG趋化因子信号通路 190年 128年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG内吞作用 183年 132年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG嗅觉传导 389年 85年 所有SZGR 2.0基因通路
PID WNT不在经典里的通路 32 26 所有SZGR 2.0基因通路
PID NFKAPPAB典型途径 17 15 所有SZGR 2.0基因通路
PID ARF6通路 35 27 所有SZGR 2.0基因通路
PID TXA2PATHWAY 57 43 所有SZGR 2.0基因通路
PID趋化因子受体CXCR4通路 102年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
PID ALK1通路 26 21 所有SZGR 2.0基因通路
PID NEPHRIN NEPH1通路 31日 24 所有SZGR 2.0基因通路
PID IL8 CXCR2通路 34 26 所有SZGR 2.0基因通路
PID刺猬2通道 22 17 所有SZGR 2.0基因通路
PID刺猬GLI通路 48 35 所有SZGR 2.0基因通路
PID IL8 CXCR1通路 28 19 所有SZGR 2.0基因通路
PID TGFBR通路 55 38 所有SZGR 2.0基因通路
细胞核REACTOME激活NOTCH1传送信号 27 18 所有SZGR 2.0基因通路
由NOTCH1 REACTOME信号 70年 46 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME凝血酶通过蛋白酶激活受体PARS信号 32 20. 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过切口 103年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME止血 466年 331年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME血小板激活信号和聚合 208年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PRAMOONJAGO SOX4目标 51 35 所有SZGR 2.0基因通路
刘CMYB目标了 165年 106年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯NTN1 DN的目标 158年 102年 所有SZGR 2.0基因通路
王CLIM2目标了 269年 146年 所有SZGR 2.0基因通路
CHOW RASSF1目标了 27 17 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群1 DN 378年 231年 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群3 329年 196年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
通过ERCC3滑落紫外线反应 309年 199年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH MYC最大目标 775年 494年 所有SZGR 2.0基因通路
佩特洛娃内皮淋巴和血液 131年 87年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒12小时 111年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
低音部毛细胞白血病DN 80年 66年 所有SZGR 2.0基因通路
奥巴马回应DARAPLADIB 29日 20. 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305年 895年 所有SZGR 2.0基因通路
陈代谢症侯群网络 1210年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
党受MYC 1103年 714年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍少突细胞数量。柯尔 756年 494年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍持续时间CORR DN 146年 90年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路
HOLLEMAN天冬酰胺酶抗B DN 15 10 所有SZGR 2.0基因通路
HOLLEMAN天冬酰胺酶抵抗所有的DN 25 14 所有SZGR 2.0基因通路
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 1839年 928年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 365 192年 199年 1、m8 hsa - mir - 365 UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU