Summary
基因ID 4124
象征 man2a1
同义词 aman ii | golim7 | mana2 | manii
描述 甘露糖苷酶Alpha 2A成员1
参考 MIM:154582|HGNC:HGNC:6824|HPRD:01110|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q21.3
Pascal P值 2.164E-7
Sherlock P值 0.055
胎儿β -0.073
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

基因数据urces
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS4388249 CHR5 109036066 TC 1.025E-7 内含子 man2a1

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23249942 5 109027037 man2a1 1.54E-8 -0.015 5.81E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6829546 CHR4 12587664 man2a1 4124 0.01 反式
RS6448932 CHR4 12595798 man2a1 4124 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1191 0.92 0.91
dedd 0.91 0.90
PSMD3 0.91 0.89
eftud2 0.90 0.90
Rab35 0.90 0.89
mkrn1 0.90 0.89
C7orf70 0.89 0.90
RQCD1 0.89 0.90
GNB1 0.89 0.89
PRCC 0.89 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.81 -0.83
AF347015.8 -0.77 -0.83
AF347015.33 -0.77 -0.81
AF347015.31 -0.77 -0.81
FXYD1 -0.76 -0.83
AF347015.27 -0.76 -0.81
mt-cyb -0.75 -0.81
AF347015.21 -0.75 -0.83
AF347015.26 -0.74 -0.82
AF347015.2 -0.72 -0.80

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg n glycan生物合成 46 31 所有SZGR 2.0基因通路
蛋白质的反应组代谢 518 242 所有SZGR 2.0基因通路
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 所有SZGR 2.0基因通路
Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 81 54 所有SZGR 2.0基因通路
Reactome运输到高尔基体和随后的修改 33 24 所有SZGR 2.0基因通路
Reactome N Golgi内侧Golgi中的Glycan触角伸长 18 14 所有SZGR 2.0基因通路
刘sox4靶向 137 94 所有SZGR 2.0基因通路
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 所有SZGR 2.0基因通路
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 所有SZGR 2.0基因通路
奥斯曼膀胱癌 404 246 所有SZGR 2.0基因通路
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 所有SZGR 2.0基因通路
Kim WT1目标12小时DN 209 122 所有SZGR 2.0基因通路
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 所有SZGR 2.0基因通路
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 DN 51 35 所有SZGR 2.0基因通路
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 所有SZGR 2.0基因通路
Markey RB1慢性洛夫 115 78 所有SZGR 2.0基因通路
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 所有SZGR 2.0基因通路
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 所有SZGR 2.0基因通路
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 所有SZGR 2.0基因通路
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲2FC DN 21 13 所有SZGR 2.0基因通路
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 所有SZGR 2.0基因通路
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 所有SZGR 2.0基因通路
mantovani病毒GPCR信号传导DN 49 37 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 121 71 所有SZGR 2.0基因通路
Benporath ES 1 379 235 所有SZGR 2.0基因通路
Benporath Myc Max目标 775 494 所有SZGR 2.0基因通路
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 所有SZGR 2.0基因通路
UEDA中央时钟 88 62 所有SZGR 2.0基因通路
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 所有SZGR 2.0基因通路
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 所有SZGR 2.0基因通路
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 所有SZGR 2.0基因通路
周TNF信号4小时 54 36 所有SZGR 2.0基因通路
伯顿成生成3 101 64 所有SZGR 2.0基因通路
汉·詹克(Han Jnk)唱歌 35 21 所有SZGR 2.0基因通路
Zamora NOS2靶向DN 96 71 所有SZGR 2.0基因通路
Wang Smarce1靶向 280 183 所有SZGR 2.0基因通路
Bonome卵巢癌的生存次优秀 510 309 所有SZGR 2.0基因通路
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 102 65 所有SZGR 2.0基因通路
Shaffer IRF4多发性骨髓瘤计划 36 25 所有SZGR 2.0基因通路
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 101 76 所有SZGR 2.0基因通路
浆细胞与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 67 51 所有SZGR 2.0基因通路
开罗肝脏发展DN 222 141 所有SZGR 2.0基因通路
由MYC约束 1103 714 所有SZGR 2.0基因通路
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 216 130 所有SZGR 2.0基因通路
lu eszh2靶向DN 414 237 所有SZGR 2.0基因通路
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 所有SZGR 2.0基因通路
boudoukha由IGF2BP2绑定 111 59 所有SZGR 2.0基因通路