基因页:man2a1
Summary?
基因ID | 4124 |
象征 | man2a1 |
同义词 | aman ii | golim7 | mana2 | manii |
描述 | 甘露糖苷酶Alpha 2A成员1 |
参考 | MIM:154582|HGNC:HGNC:6824|HPRD:01110| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q21.3 |
Pascal P值 | 2.164E-7 |
Sherlock P值 | 0.055 |
胎儿β | -0.073 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
基因数据urces
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4388249 | CHR5 | 109036066 | TC | 1.025E-7 | 内含子 | man2a1 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23249942 | 5 | 109027037 | man2a1 | 1.54E-8 | -0.015 | 5.81E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6829546 | CHR4 | 12587664 | man2a1 | 4124 | 0.01 | 反式 | ||
RS6448932 | CHR4 | 12595798 | man2a1 | 4124 | 0.01 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MAN2A1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA1191 | 0.92 | 0.91 |
dedd | 0.91 | 0.90 |
PSMD3 | 0.91 | 0.89 |
eftud2 | 0.90 | 0.90 |
Rab35 | 0.90 | 0.89 |
mkrn1 | 0.90 | 0.89 |
C7orf70 | 0.89 | 0.90 |
RQCD1 | 0.89 | 0.90 |
GNB1 | 0.89 | 0.89 |
PRCC | 0.89 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.81 | -0.83 |
AF347015.8 | -0.77 | -0.83 |
AF347015.33 | -0.77 | -0.81 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.81 |
FXYD1 | -0.76 | -0.83 |
AF347015.27 | -0.76 | -0.81 |
mt-cyb | -0.75 | -0.81 |
AF347015.21 | -0.75 | -0.83 |
AF347015.26 | -0.74 | -0.82 |
AF347015.2 | -0.72 | -0.80 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg n glycan生物合成 | 46 | 31 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Reactome天冬酰胺N连接的糖基化 | 81 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Reactome运输到高尔基体和随后的修改 | 33 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Reactome N Golgi内侧Golgi中的Glycan触角伸长 | 18 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
刘sox4靶向 | 137 | 94 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Chiaradonna肿瘤转化KRAS CDC25 DN | 51 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
chiaradonna肿瘤转化cdc25 | 120 | 73 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Markey RB1慢性洛夫 | 115 | 78 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲2FC DN | 21 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
mantovani病毒GPCR信号传导DN | 49 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 | 382 | 224 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 | 121 | 71 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿斯顿主要抑郁症DN | 160 | 110 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
UEDA中央时钟 | 88 | 62 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 | 182 | 119 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
周TNF信号4小时 | 54 | 36 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伯顿成生成3 | 101 | 64 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
汉·詹克(Han Jnk)唱歌 | 35 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Zamora NOS2靶向DN | 96 | 71 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 | 102 | 65 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Shaffer IRF4多发性骨髓瘤计划 | 36 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 101 | 76 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
浆细胞与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 67 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
boudoukha由IGF2BP2绑定 | 111 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |