基因页面:MAP1A

总结吗?
GeneID 4130年
象征 MAP1A
同义词 MAP1L | MTAP1A
描述 微管相关蛋白1
参考 MIM: 600178|HGNC: HGNC: 6835|运用:ENSG00000166963|HPRD: 02549|织女:OTTHUMG00000059756
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 15 q15.3
帕斯卡假定值 3.367的军医
胎儿β -3.219
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 结构可塑性
G2Cdb.human_mGluR5
G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP
CompositeSet
达内尔FMRP目标
潜在的突触基因

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 点击显示详细信息
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.7246

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs4634107 chr3 186341392 MAP1A 4130年 0.1 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
BCAS1 0.96 0.97
MOBP 0.93 0.94
KIF1C 0.91 0.89
PAQR6 0.90 0.93
SEPT4 0.89 0.90
TP53INP2 0.87 0.86
FOXO4 0.86 0.81
PLEKHB1 0.85 0.93
ZFP57 0.85 0.87
DAAM2 0.82 0.87
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
PARP6 -0.67 -0.78
GSTA4 -0.67 -0.81
PPP3CC -0.66 -0.79
SUPV3L1 -0.66 -0.78
DUSP12 -0.66 -0.79
UBE2E3 -0.66 -0.77
MED19 -0.66 -0.78
STMN1 -0.65 -0.80
MLLT11 -0.65 -0.78
CDC42 -0.65 -0.78

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 12812986
去:0005198 结构分子活动 NAS 8812494
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005874 微管 国际能源机构 - - - - - -
去:0005875 微管相关的复杂 助教 8812494

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
多德鼻咽癌起来 1821年 933年 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群1 DN 378年 231年 所有SZGR 2.0基因通路
CONCANNON EPOXOMICIN了细胞凋亡 239年 157年 所有SZGR 2.0基因通路
他甲状腺癌PAX8 PPARG 44 29日 所有SZGR 2.0基因通路
OUELLET培养卵巢癌浸润性对LMP DN 35 20. 所有SZGR 2.0基因通路
林格伦膀胱癌集群2 b 392年 251年 所有SZGR 2.0基因通路
PETRETTO血压上升 12 8 所有SZGR 2.0基因通路
沈SMARCA2 DN的目标 357年 212年 所有SZGR 2.0基因通路
罗斯AML PML RARA融合 77年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃早期造血祖 532年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃晚期造血祖 544年 307年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
SESTO应对紫外线C2 54 39 所有SZGR 2.0基因通路
击倒老化肌肉了 244年 165年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染14小时血巨细胞病毒DN 298年 200年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒18 hr DN 178年 121年 所有SZGR 2.0基因通路
近端树突LEIN本地化 37 26 所有SZGR 2.0基因通路
VALK AML FLT3 ITD 40 22 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒30分钟DN 150年 99年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒4 hr DN 254年 158年 所有SZGR 2.0基因通路
国外RB1目标融合性的 567年 365年 所有SZGR 2.0基因通路
WIERENGA STAT5A目标了 217年 131年 所有SZGR 2.0基因通路
WIERENGA STAT5A目标GROUP1 136年 76年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应早期晚了 317年 190年 所有SZGR 2.0基因通路
GOBERT少突细胞分化DN 1080年 713年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-1/206 927年 934年 1、m8 hsa-miR-1 UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA
hsa - mir - 206深圳 UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
hsa - mir - 613 AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC
mir - 181 582年 588年 m8 hsa - mir - 181 a大脑 AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 b深圳 AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
hsa - mir - 181 c大脑 AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 d大脑 AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU
mir - 199 962年 968年 m8 hsa - mir - 199 a CCCAGUGUUCAGACUACCUGUUC
hsa - mir - 199 b CCCAGUGUUUAGACUAUCUGUUC
mir - 218 699年 705年 1 hsa - mir - 218大脑 UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU
miR-26 600年 606年 1 hsa-miR-26a大脑 UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
hsa-miR-26b深圳 UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
miR-34/449 876年 882年 m8 hsa-miR-34a大脑 UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
hsa-miR-34c AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC
hsa - mir - 449 UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU
hsa - mir - 449 b AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC
miR-34b 877年 883年 m8 hsa-miR-34b UAGGCAGUGUCAUUAGCUGAUUG
mir - 377 912年 918年 m8 hsa - mir - 377 AUCACACAAAGGCAACUUUUGU
mir - 409 - 3 - p 926年 932年 m8 hsa - mir - 409 - 3 - p CGAAUGUUGCUCGGUGAACCCCU
mir - 491 1308年 1314年 m8 hsa - mir - 491大脑 AGUGGGGAACCCUUCCAUGAGGA
miR-9 193年 199年 m8 hsa-miR-9深圳 UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA