Gene Page:MAPT

概括?
GeneID 4137
象征 MAPT
Synonyms DDPAC|FTDP-17|MAPTL|MSTD|MTBT1|MTBT2|PPND|PPP1R103|TAU
Description 微管相关蛋白tau
Reference MIM:157140|HGNC:HGNC:6893|ENSEMBL：ENSG00000186868|HPRD：01142|Vega:OTTHUMG00000168833
基因类型 protein-coding
Map location 17q21.1
Sherlock P值 0.004
Fetal beta -2.487
eGene Cerebellar Hemisphere
小脑
皮质
额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别
Meta
Support 结构可塑性
G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP
CompositeSet
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
简历：Phewas Phenome-wide association studies (PheWAS) 157 SNPs associated with schizophrenia 1
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击to show details
GO_Annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：8
Network 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 贡献在PPI网络最短路径:3.6916

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：Phewas

SNP ID 染色体 位置 Allele P Function Gene 向上/向下距离
rs242557 17 0 无效的 1.576 MAPT 无效的

@eQTL annotation

SNP ID 染色体 位置 eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
RS12947718 chr17 43493100 MAPT 4137 0 cis
rs17631303 chr17 43516401 MAPT 4137 0 cis
rs3946526 chr17 43541655 MAPT 4137 1.764E-4 cis
rs2696425 chr17 43666905 MAPT 4137 8.37E-4 cis
rs418891 chr17 43693537 MAPT 4137 0 cis
RS413778 chr17 43716884 MAPT 4137 0 cis
rs453997 chr17 43727060 MAPT 4137 5.899E-4 cis
rs422112 chr17 43728136 MAPT 4137 0 cis
rs241033 chr17 43733982 MAPT 4137 5.899E-4 cis
rs241032 chr17 43734144 MAPT 4137 0 cis
rs241031 chr17 43734303 MAPT 4137 5.899E-4 cis
rs17760733 chr17 43746275 MAPT 4137 0.01 cis
rs17687571 chr17 43750009 MAPT 4137 0 cis
RS17687667 chr17 43754098 MAPT 4137 6.42E-4 cis
rs17688002 chr17 43762593 MAPT 4137 5.899E-4 cis
RS17688068 chr17 43763934 MAPT 4137 0.02 cis
RS17688391 chr17 43772108 MAPT 4137 9.156E-4 cis
rs17688434 chr17 43772539 MAPT 4137 0 cis
RS12150610 chr17 43775478 MAPT 4137 0 cis
RS12150547 chr17 43775545 MAPT 4137 5.899E-4 cis
RS17762165 chr17 43778601 MAPT 4137 8.734E-4 cis
rs17688922 chr17 43779350 MAPT 4137 0 cis
rs17688944 chr17 43779418 MAPT 4137 5.878E-4 cis
RS1526128 chr17 43779623 MAPT 4137 7.6E-4 cis
RS1526129 chr17 43779656 MAPT 4137 0 cis
RS1724425 chr17 43781746 MAPT 4137 0.01 cis
rs17563501 chr17 43801694 MAPT 4137 7.043E-4 cis
rs2902662 chr17 43806924 MAPT 4137 0 cis
rs17563787 chr17 43813251 MAPT 4137 5.878E-4 cis
RS17563827 chr17 43818221 MAPT 4137 7.176E-4 cis
rs12150672 chr17 43826636 MAPT 4137 0.01 cis
rs17426106 chr17 43828934 MAPT 4137 5.452E-4 cis
rs17426195 chr17 43832366 MAPT 4137 7.513E-4 cis
RS6503447 chr17 43834911 MAPT 4137 0.06 cis
RS4074462 chr17 43855227 MAPT 4137 0 cis
RS17689471 chr17 43892972 MAPT 4137 7.043E-4 cis
RS17762769 chr17 43893402 MAPT 4137 0 cis
rs171440 chr17 43893486 MAPT 4137 0.08 cis
RS8072451 chr17 43893715 MAPT 4137 0 cis
RS4277389 chr17 43895652 MAPT 4137 5.878E-4 cis
RS17689824 chr17 43904396 MAPT 4137 6.987E-4 cis
RS17763086 chr17 43905480 MAPT 4137 0.02 cis
RS17689882 chr17 43906827 MAPT 4137 5.878E-4 cis
rs17769552 chr17 43927289 MAPT 4137 9.779E-4 cis
rs916793 chr17 43954685 MAPT 4137 7.043E-4 cis
rs17649553 chr17 43994647 MAPT 4137 0 cis
rs17649641 chr17 43997371 MAPT 4137 0 cis
rs17564223 chr17 43997519 MAPT 4137 0 cis
rs17649954 chr17 44001660 MAPT 4137 5.441E-4 cis
rs17564619 chr17 44002137 MAPT 4137 9.354E-4 cis
rs17650063 chr17 44002554 MAPT 4137 7.043E-4 cis
RS17564780 chr17 44005412 MAPT 4137 7.043E-4 cis
RS17650381 chr17 44013023 MAPT 4137 0 cis
RS12150111 chr17 44013937 MAPT 4137 7.043E-4 cis
RS2316784 chr17 44021698 MAPT 4137 8.505E-4 cis
rs4327091 chr17 44021716 MAPT 4137 5.878E-4 cis
rs242559 chr17 44025887 MAPT 4137 0 cis
rs17571718 chr17 44032767 MAPT 4137 4.555E-4 cis
rs17571739 chr17 44032914 MAPT 4137 5.878E-4 cis
rs17650872 chr17 44039515 MAPT 4137 7.043E-4 cis
RS17572169 chr17 44045973 MAPT 4137 5.878E-4 cis
RS17651213 chr17 44051923 MAPT 4137 0.01 cis
RS17572361 chr17 44052008 MAPT 4137 0 cis
rs17572851 chr17 44063765 MAPT 4137 0 cis
rs17572893 chr17 44064207 MAPT 4137 5.878E-4 cis
rs17573175 chr17 44071088 MAPT 4137 8.2e-4 cis
rs1078268 chr17 44075900 MAPT 4137 0 cis
RS8070723 chr17 44081063 MAPT 4137 5.878E-4 cis
rs17652449 chr17 44088936 MAPT 4137 0 cis
rs17652502 chr17 44094470 MAPT 4137 7.043E-4 cis
rs17574228 chr17 44104508 MAPT 4137 5.878E-4 cis
RS1076222 chr17 44109768 MAPT 4137 0 cis
RS7350980 chr17 44110270 MAPT 4137 0 cis
rs4597358 chr17 44110669 MAPT 4137 5.878E-4 cis
rs17653162 chr17 44111826 MAPT 4137 3.466E-4 cis
rs17574824 chr17 44115106 MAPT 4137 0 cis
rs12150090 chr17 44115885 MAPT 4137 7.043E-4 cis
rs7221390 chr17 44116949 MAPT 4137 7.043E-4 cis
rs17575556 chr17 44135826 MAPT 4137 8.802E-4 cis
rs17659881 chr17 44157596 MAPT 4137 7.043E-4 cis
rs17660132 chr17 44165802 MAPT 4137 3.611E-4 cis
rs17577094 chr17 44187491 MAPT 4137 0 cis
rs17660907 chr17 44191084 MAPT 4137 0 cis
RS8070942 chr17 44208673 MAPT 4137 5.515E-4 cis
RS2532316 chr17 44213711 MAPT 4137 5.878E-4 cis
rs2696600 chr17 44216225 MAPT 4137 0 cis
rs1406068 chr17 44234525 MAPT 4137 5.878E-4 cis
RS2532292 chr17 44237067 MAPT 4137 7.043E-4 cis
RS2532286 chr17 44241663 MAPT 4137 7.544e-4 cis
RS2532276 chr17 44246623 MAPT 4137 0 cis
RS2532275 chr17 44246996 MAPT 4137 7.043E-4 cis
rs2532259 chr17 44253363 MAPT 4137 7.043E-4 cis
RS2732646 chr17 44254378 MAPT 4137 5.878E-4 cis
RS2732589 chr17 44266021 MAPT 4137 0 cis
rs1918788 chr17 44267616 MAPT 4137 7.043E-4 cis
RS2732596 chr17 44269545 MAPT 4137 0.01 cis
rs2732675 chr17 44280187 MAPT 4137 0 cis
rs2732674 chr17 44280696 MAPT 4137 0.01 cis
rs2668695 chr17 44292125 MAPT 4137 6.7e-4 cis
RS2532332 chr17 44347726 MAPT 4137 0.08 cis
rs2732706 chr17 44351685 MAPT 4137 0 cis
rs2668624 chr17 44352871 MAPT 4137 0.01 cis
rs199436 chr17 44789284 MAPT 4137 0.17 cis
rs142167 chr17 44795233 MAPT 4137 0.12 cis
rs199452 chr17 44801339 MAPT 4137 0.13 cis
rs199449 chr17 44808901 MAPT 4137 0.15 cis
rs199535 chr17 44822661 MAPT 4137 0.04 cis
RS199515 chr17 44856640 MAPT 4137 0.1 cis
RS12947718 chr17 43493100 MAPT 4137 0.17 反式
rs17631303 chr17 43516401 MAPT 4137 0.1 反式
rs3946526 chr17 43541655 MAPT 4137 0.02 反式
rs2696425 chr17 43666905 MAPT 4137 0.06 反式
rs418891 chr17 43693537 MAPT 4137 0.17 反式
RS413778 chr17 43716884 MAPT 4137 0.13 反式
rs453997 chr17 43727060 MAPT 4137 0.05 反式
rs422112 chr17 43728136 MAPT 4137 0.13 反式
rs241033 chr17 43733982 MAPT 4137 0.05 反式
rs241031 chr17 43734303 MAPT 4137 0.05 反式
rs17687571 chr17 43750009 MAPT 4137 0.18 反式
RS17687667 chr17 43754098 MAPT 4137 0.05 反式
rs17688002 chr17 43762593 MAPT 4137 0.05 反式
RS17688391 chr17 43772108 MAPT 4137 0.07 反式
rs17688434 chr17 43772539 MAPT 4137 0.11 反式
RS12150610 chr17 43775478 MAPT 4137 0.1 反式
RS12150547 chr17 43775545 MAPT 4137 0.05 反式
RS17762165 chr17 43778601 MAPT 4137 0.06 反式
rs17688922 chr17 43779350 MAPT 4137 0.07 反式
rs17688944 chr17 43779418 MAPT 4137 0.05 反式
RS1526128 chr17 43779623 MAPT 4137 0.06 反式
RS1526129 chr17 43779656 MAPT 4137 0.08 反式
rs17563501 chr17 43801694 MAPT 4137 0.05 反式
rs2902662 chr17 43806924 MAPT 4137 0.1 反式
rs17563787 chr17 43813251 MAPT 4137 0.05 反式
RS17563827 chr17 43818221 MAPT 4137 0.05 反式
rs17426106 chr17 43828934 MAPT 4137 0.04 反式
rs17426195 chr17 43832366 MAPT 4137 0.06 反式
RS4074462 chr17 43855227 MAPT 4137 0.09 反式
RS17689471 chr17 43892972 MAPT 4137 0.05 反式
RS17762769 chr17 43893402 MAPT 4137 0.1 反式
RS8072451 chr17 43893715 MAPT 4137 0.08 反式
RS4277389 chr17 43895652 MAPT 4137 0.05 反式
RS17689824 chr17 43904396 MAPT 4137 0.05 反式
rs17769552 chr17 43927289 MAPT 4137 0.07 反式
snp_a-2150382 0 MAPT 4137 0.04 反式
rs916793 chr17 43954685 MAPT 4137 0.05 反式
rs17649553 chr17 43994647 MAPT 4137 0.09 反式
rs17649641 chr17 43997371 MAPT 4137 0.17 反式
rs17564223 chr17 43997519 MAPT 4137 0.09 反式
rs17649954 chr17 44001660 MAPT 4137 0.04 反式
rs17564619 chr17 44002137 MAPT 4137 0.07 反式
rs17650063 chr17 44002554 MAPT 4137 0.05 反式
RS17564780 chr17 44005412 MAPT 4137 0.05 反式
RS17650381 chr17 44013023 MAPT 4137 0.11 反式
RS12150111 chr17 44013937 MAPT 4137 0.05 反式
RS2316784 chr17 44021698 MAPT 4137 0.06 反式
rs4327091 chr17 44021716 MAPT 4137 0.05 反式
rs242559 chr17 44025887 MAPT 4137 0.08 反式
rs17571718 chr17 44032767 MAPT 4137 0.04 反式
rs17571739 chr17 44032914 MAPT 4137 0.05 反式
rs17650872 chr17 44039515 MAPT 4137 0.05 反式
RS17572169 chr17 44045973 MAPT 4137 0.05 反式
RS17572361 chr17 44052008 MAPT 4137 0.18 反式
rs17572851 chr17 44063765 MAPT 4137 0.1 反式
rs17572893 chr17 44064207 MAPT 4137 0.05 反式
rs17573175 chr17 44071088 MAPT 4137 0.06 反式
rs1078268 chr17 44075900 MAPT 4137 0.09 反式
RS8070723 chr17 44081063 MAPT 4137 0.05 反式
rs17652449 chr17 44088936 MAPT 4137 0.15 反式
rs17652502 chr17 44094470 MAPT 4137 0.05 反式
rs17574228 chr17 44104508 MAPT 4137 0.05 反式
RS1076222 chr17 44109768 MAPT 4137 0.09 反式
RS7350980 chr17 44110270 MAPT 4137 0.08 反式
rs4597358 chr17 44110669 MAPT 4137 0.05 反式
rs17653162 chr17 44111826 MAPT 4137 0.03 反式
rs17574824 chr17 44115106 MAPT 4137 0.2 反式
rs12150090 chr17 44115885 MAPT 4137 0.05 反式
SNP_A-1855473 0 MAPT 4137 0.05 反式
rs7221390 chr17 44116949 MAPT 4137 0.05 反式
SNP_A-1823652 0 MAPT 4137 0.18 反式
rs17575556 chr17 44135826 MAPT 4137 0.06 反式
rs17659881 chr17 44157596 MAPT 4137 0.05 反式
rs17660132 chr17 44165802 MAPT 4137 0.03 反式
rs17577094 chr17 44187491 MAPT 4137 0.15 反式
rs17660907 chr17 44191084 MAPT 4137 0.07 反式
RS8070942 chr17 44208673 MAPT 4137 0.04 反式
RS2532316 chr17 44213711 MAPT 4137 0.05 反式
rs2696600 chr17 44216225 MAPT 4137 0.13 反式
rs1406068 chr17 44234525 MAPT 4137 0.05 反式
RS2532292 chr17 44237067 MAPT 4137 0.05 反式
RS2532286 chr17 44241663 MAPT 4137 0.06 反式
RS2532276 chr17 44246623 MAPT 4137 0.07 反式
RS2532275 chr17 44246996 MAPT 4137 0.05 反式
rs2532259 chr17 44253363 MAPT 4137 0.05 反式
RS2732646 chr17 44254378 MAPT 4137 0.05 反式
RS2732589 chr17 44266021 MAPT 4137 0.16 反式
rs1918788 chr17 44267616 MAPT 4137 0.05 反式
rs2732675 chr17 44280187 MAPT 4137 0.14 反式
rs2668695 chr17 44292125 MAPT 4137 0.05 反式
rs2732706 chr17 44351685 MAPT 4137 0.11 反式
rs2668622 0 MAPT 4137 0.04 反式

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation 斯皮尔曼的相关性
TNS1 0.83 0.86
TLN1 0.80 0.81
RRBP1 0.79 0.83
SLC20A2 0.78 0.82
GSN 0.77 0.78
angptl2 0.77 0.79
TJP2 0.77 0.82
UNC5B 0.77 0.80
MYLK 0.77 0.79
ERBB3 0.77 0.77
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation 斯皮尔曼的相关性
NR2C2AP -0.53 -0.56
RPL27 -0.52 -0.67
RPL31 -0.52 -0.66
POLB -0.52 -0.58
RPS23 -0.52 -0.66
FRG1 -0.52 -0.61
RPL24 -0.52 -0.68
CYP2R1 -0.52 -0.57
RPS18 -0.52 -0.64
RPL32 -0.51 -0.64

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005200 structural constituent of cytoskeleton 塔斯 2498079
GO:0008034 脂蛋白结合 IPI 7972031
GO:0017124 SH3域结合 IPI 9763511
GO:0008017 微管结合 IDA 1918161
GO:0008017 微管结合 ISS -
GO：0019899 enzyme binding IPI 9736630|12888622
GO：0034187 载脂蛋白ebinding IPI 7566652
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0048699 generation of neurons nas neuron, neurogenesis (GO term level: 7) 8522593
GO:0045773 positive regulation of axon extension IDA axon (GO term level: 15) 1389180
GO:0045773 positive regulation of axon extension ISS axon (GO term level: 15) -
GO：0000226 microtubule cytoskeleton organization IDA 1057175
GO：0000226 microtubule cytoskeleton organization ISS -
GO:0007026 negative regulation of microtubule depolymerization IEA -
GO:0031116 positive regulation of microtubule polymerization IDA 1421571
GO:0031116 positive regulation of microtubule polymerization ISS -
Cellular component GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0042995 cell projection IEA Axon（GO术语级别：4） -
GO：0030426 生长锥 IDA axon, dendrite (GO term level: 5) 8642405
GO：0030426 生长锥 ISS axon, dendrite (GO term level: 5) -
GO：0030424 axon IDA neuron, axon, Neurotransmitter (GO term level: 6) 8642405
GO：0030424 axon ISS neuron, axon, Neurotransmitter (GO term level: 6) -
GO:0005829 细胞质 塔斯 10747907
去：0005856 cytoskeleton IEA -
去：0005875 microtubule associated complex 塔斯 10747907
GO:0005737 cytoplasm IEA -
去：0005886 plasma membrane IDA 8522593
去：0005886 plasma membrane ISS -
GO：0045298 tubulin complex IDA 8642405
GO：0045298 tubulin complex ISS -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b Experimental Source PubMed ID
AATF Che-1 |che1 |ded apoptosis antagonizing transcription factor - HPRD,BioGRID 14697667
APOE ad2 |LPG |MGC1571 |载蛋白 载脂蛋白e Reconstituted Complex BioGRID 8620924
APOE ad2 |LPG |MGC1571 |载蛋白 载脂蛋白e - HPRD 7566652|9147408
CALM1 CALML2 | CAMI | DD132 | PHKD 钙调蛋白1（磷酸化酶激酶，三角洲） - HPRD,BioGRID 2123288
FYN MGC45350 | SLK | SYN Fyn Oncogene与SRC，FGR，是的 - HPRD,BioGRID 11826099
GSK3B - glycogen synthase kinase 3 beta GSK3beta phosphorylates Ftau.This interaction was modelled on a demonstrated interaction between rabbit GSK3beta and human Ftau. 绑定 14636947
MARK4 FLJ90097 | KIAA1860 | MARKL1 | Nbla00650 地图/微管亲和调节激酶4 - HPRD,BioGRID 14594945
OGT FLJ23071 |HRNT1 |MGC22921 |O-GLCNAC O-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) transferase (UDP-N-acetylglucosamine:polypeptide-N-acetylglucosaminyl transferase) - HPRD,BioGRID 8910513|12911634
PIN1 国防部|UBL5 肽基丙基顺式/反式异构酶，NIMA相互作用1 - HPRD,BioGRID 10391244
PSEN1 AD3粉|足总D | PS1 | S182 Presenilin 1 - HPRD,BioGRID 9689133
S100B nef |S100 |S100beta S100 calcium binding protein B - HPRD 11264299
S100B nef |S100 |S100beta S100 calcium binding protein B - HPRD,BioGRID 2833519
SNCA MGC110988 |NACP |park1 |park4 |PD1 synuclein, alpha (non A4 component of amyloid precursor) - HPRD,BioGRID 10464279
SPTB HSpTB1 光谱，β，红细胞 - HPRD,BioGRID 6743699
STXBP1 EIEE4 | MUNC18-1 | UNC18 | hUNC18 | rbSec1 syntaxin binding protein 1 - HPRD,BioGRID 12963086
tubb2a TUBB | TUBB2 | dJ40E16.7 tubulin, beta 2A - HPRD 9922135
USP9Y AZF | AZF1 | AZFA | DFFRY | FLJ33043 | SP3 ubiquitin specific peptidase 9, Y-linked (fat facets-like, Drosophila) - HPRD,BioGRID 1723470
ywhaa - 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白，α多肽 Affinity Capture-Western BioGRID 12176984
ywhab GW128 | HS1 | KCIP-1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, beta polypeptide - HPRD,BioGRID 10840038
ywhaz KCIP-1 |MGC111427 |MGC126532 |MGC138156 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta polypeptide Tau interacts with 14-3-3-zeta. 绑定 12176984
ywhaz KCIP-1 |MGC111427 |MGC126532 |MGC138156 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta polypeptide - HPRD,BioGRID 10840038


V.途径注释

路径名 Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ALZHEIMERS DISEASE 169 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA BIOPEPTIDES PATHWAY 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA P35ALZHEIMERS PATHWAY 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径 66 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID REELIN PATHWAY 29 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID LKB1 PATHWAY 47 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P38伽马三角洲途径 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APOPTOTIC CLEAVAGE OF CELLULAR PROTEINS 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CASPASE MEDIATED CLEAVAGE OF CYTOSKELETAL PROTEINS 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME APOPTOSIS 148 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome凋亡执行阶段 54 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM SYSTOLIC HEART FAILURE DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE RESPONSE TO ANDROGEN UP 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE BREAST CANCER ESR1 UP 112 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ginestier乳腺癌20q13扩增 119 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAMOTO OPN TARGETS CLUSTER 8 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG BREAST CANCER ESR1 UP 36 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SUZ12 TARGETS 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES WITH H3K27ME3 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ASTON MAJOR DEPRESSIVE DISORDER DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对雌二醇的反应 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR UP 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN DN 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL LONG TERM 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21靶向DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAYO CALORIE RESTRICTION MUSCLE UP 95 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克道尔急性肺损伤DN 48 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KONDO PROSTATE CANCER HCP WITH H3K27ME3 97 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION UP 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE METASTASIS AND ALTERNATIVE SPLICING DN 45 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH RESPONSE TO ESTRADIOL 61 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUILLETTE CLL 13Q14 DELETION DN 60 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BRAIN DN 85 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER LUMINAL B UP 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TOYOTA TARGETS OF MIR34B AND MIR34C 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG GLIOBLASTOMA PLASTICITY DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼抵抗DN 69 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN PRE BI TO LARGE PRE BII LYMPHOCYTE UP 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROME INSULIN TARGETS IN MUSCLE UP 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POOLA INVASIVE BREAST CANCER DN 134 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM BIPOLAR DISORDER OLIGODENDROCYTE DENSITY CORR UP 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS CALB1 CORR UP 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK GLIOBLASTOMA PRONEURAL 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1 TARGETS VIA AKT1 UP 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fardin缺氧11 32 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAO BOUND BY SALL4 ISOFORM A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GHANDHI BYSTANDER IRRADIATION DN 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 2ND EGF PULSE ONLY 1725 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 Target position miRNA ID miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-181 4068 4074 M8 hsa-miR-181abrain AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
hsa-miR-181bSZ AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
hsa-miR-181cbrain AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
hsa-miR-181dbrain aacauucauuguugucggggguggguu
mir-214 2039 2045 M8 HSA-MIR-214brain ACAGCAGGCACAGACAGGCAG
mir-219 3175 3181 M8 HSA-MIR-219brain ugauuguccaaacgcaauucu
miR-27 4065 4071 1a HSA-MIR-27Abrain UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
HSA-MIR-27Bbrain UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC
miR-34/449 1187 1193 M8 hsa-miR-34abrain UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
hsa-miR-34c Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449b AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC