概括
基因 4141
象征 火星
同义词 cmt2u | ilfs2 | illd | metrs | mrs | mtrns | spg70
描述 甲二烯基-TRNA合成酶
参考 MIM:156560|HGNC:HGNC:6898|ENSEMBL:ENSG00000166986|HPRD:08864|Vega:Otthumg00000169996
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12q13.3
Pascal P值 0.125
Sherlock P值 0.193
胎儿β 0.017
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0044

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 火星 4141 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC022100.1 0.83 0.82
GLTP 0.83 0.83
ITPKB 0.82 0.83
PRR5L 0.82 0.75
WIPF1 0.82 0.82
GPRC5B 0.81 0.80
ttyh2 0.81 0.82
KIAA1755 0.81 0.71
TJP2 0.81 0.83
LDB3 0.81 0.76
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
polb -0.47 -0.63
NR2C2AP -0.46 -0.61
STMN1 -0.46 -0.55
Med19 -0.44 -0.56
FRG1 -0.44 -0.62
ALKBH2 -0.42 -0.59
ING4 -0.42 -0.54
Commd3 -0.42 -0.58
STMN2 -0.42 -0.49
RPL24 -0.42 -0.66

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000049 tRNA结合 IEA -
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17353931
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004825 蛋氨酸-TRNA连接酶活性 IEA -
去:0004825 蛋氨酸-TRNA连接酶活性 塔斯 8921912
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006431 蛋白质基-TRNA氨基酰化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005886 质膜 艾达 18029348

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
BRF2 Brfu |FLJ11052 |TFIIIB50 BRF2,RNA聚合酶III转录起始因子的亚基,BRF1样 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
达斯 DKFZP781B11202 |MGC111579 天冬氨酸-TRNA合成酶 - HPRD 1651330|9878398
EPRS dkfzp313b047 |耳朵|gluprors |pars |Pig32 |QARS |QPRS 谷氨酰基 - 丙酰基-TRNA合成酶 - HPRD 1651330|9878398
GIPC1 C19orf3 |GIPC |glut1cbp |HS.6454 |IIP-1 |MGC15889 |MGC3774 |nip |RGS19IP1 |semcap | SYNECTIIN | SYNECTIN | TIP-2 GIPC PDZ域含有家族,成员1 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
IARS FLJ20736 |IARS1 |ILRS |Pro0785 异戊酸-TRNA合成酶 - HPRD 1651330|9878398
伊尔克 DKFZP686F1765 |P59 整联蛋白连接激酶 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
kars kars2 |KIAA0070 |KRS 赖氨酸-TRNA合成酶 - HPRD 1651330
拉斯 FLJ10595 |FLJ21788 |HSPC192 |KIAA1352 |lars1 |Leurs |Leus |LRS |Pig44 |rntls | hr025Cl leucyl-tRNA合成酶 - HPRD 1651330|9878398
黑手党 FLJ32205 |MGC71717 |nfe2u |P18 V-MAF Musculoaponeurototot纤维肉瘤癌基因同源物K(Avian) - HPRD 9878398
MAPK14 CSBP1 |CSBP2 |CSPB1 |Exip |mxi2 |PRKM14 |PRKM15 |RK |SAPK2A |p38 | p38ALPHA 有丝分裂原激活的蛋白激酶14 - HPRD 9878398
MCC DKFZP762O1615 |FLJ38893 |FLJ46755 |MCC1 结直肠癌突变 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
prkab1 Ampk |汉普克|MGC17785 蛋白激酶,AMP激活,β1非催化亚基 亲和力捕获ms Biogrid 17353931
QARS Glnrs |Pro2195 谷氨酰胺基-TRNA合成酶 - HPRD 1651330
Argrs |dalrd1 |MGC8641 精氨酸-TRNA合成酶 - HPRD 1651330|9878398
SCYE1 AIMP1 |EMAP-2 |EMAP-II |EMAP2 |emapii |P43 小诱导细胞因子亚家族E,成员1(内皮单核细胞激活) - HPRD 9878398


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG Selenoamino酸代谢 26 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg氨基酰基tRNA生物合成 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胞质tRNA氨基酰化 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome tRNA氨基酰化 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村癌症微环境DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sotiriou乳腺癌1级vs 3 151 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水抑制 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson对砷的回应 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭亮氨酸剥夺 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期DN 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁尼trabectedin抗性DN 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
磷酸氨基酸剥夺 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化DN沉默 105 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
podar对Apaphostin的反应 147 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takeer吉西他滨抗性DN 122 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shaffer IRF4在活化的树突状细胞中的目标 65 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应11 103 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
因宗乳腺干细胞向上 146 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因