基因页:火星
概括?
基因 | 4141 |
象征 | 火星 |
同义词 | cmt2u | ilfs2 | illd | metrs | mrs | mtrns | spg70 |
描述 | 甲二烯基-TRNA合成酶 |
参考 | MIM:156560|HGNC:HGNC:6898|ENSEMBL:ENSG00000166986|HPRD:08864|Vega:Otthumg00000169996 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12q13.3 |
Pascal P值 | 0.125 |
Sherlock P值 | 0.193 |
胎儿β | 0.017 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | 火星 | 4141 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MARS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC022100.1 | 0.83 | 0.82 |
GLTP | 0.83 | 0.83 |
ITPKB | 0.82 | 0.83 |
PRR5L | 0.82 | 0.75 |
WIPF1 | 0.82 | 0.82 |
GPRC5B | 0.81 | 0.80 |
ttyh2 | 0.81 | 0.82 |
KIAA1755 | 0.81 | 0.71 |
TJP2 | 0.81 | 0.83 |
LDB3 | 0.81 | 0.76 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
polb | -0.47 | -0.63 |
NR2C2AP | -0.46 | -0.61 |
STMN1 | -0.46 | -0.55 |
Med19 | -0.44 | -0.56 |
FRG1 | -0.44 | -0.62 |
ALKBH2 | -0.42 | -0.59 |
ING4 | -0.42 | -0.54 |
Commd3 | -0.42 | -0.58 |
STMN2 | -0.42 | -0.49 |
RPL24 | -0.42 | -0.66 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000049 | tRNA结合 | IEA | - | |
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004825 | 蛋氨酸-TRNA连接酶活性 | IEA | - | |
去:0004825 | 蛋氨酸-TRNA连接酶活性 | 塔斯 | 8921912 | |
GO:0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006431 | 蛋白质基-TRNA氨基酰化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 18029348 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BRF2 | Brfu |FLJ11052 |TFIIIB50 | BRF2,RNA聚合酶III转录起始因子的亚基,BRF1样 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
达斯 | DKFZP781B11202 |MGC111579 | 天冬氨酸-TRNA合成酶 | - | HPRD | 1651330|9878398 |
EPRS | dkfzp313b047 |耳朵|gluprors |pars |Pig32 |QARS |QPRS | 谷氨酰基 - 丙酰基-TRNA合成酶 | - | HPRD | 1651330|9878398 |
GIPC1 | C19orf3 |GIPC |glut1cbp |HS.6454 |IIP-1 |MGC15889 |MGC3774 |nip |RGS19IP1 |semcap | SYNECTIIN | SYNECTIN | TIP-2 | GIPC PDZ域含有家族,成员1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
IARS | FLJ20736 |IARS1 |ILRS |Pro0785 | 异戊酸-TRNA合成酶 | - | HPRD | 1651330|9878398 |
伊尔克 | DKFZP686F1765 |P59 | 整联蛋白连接激酶 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
kars | kars2 |KIAA0070 |KRS | 赖氨酸-TRNA合成酶 | - | HPRD | 1651330 |
拉斯 | FLJ10595 |FLJ21788 |HSPC192 |KIAA1352 |lars1 |Leurs |Leus |LRS |Pig44 |rntls | hr025Cl | leucyl-tRNA合成酶 | - | HPRD | 1651330|9878398 |
黑手党 | FLJ32205 |MGC71717 |nfe2u |P18 | V-MAF Musculoaponeurototot纤维肉瘤癌基因同源物K(Avian) | - | HPRD | 9878398 |
MAPK14 | CSBP1 |CSBP2 |CSPB1 |Exip |mxi2 |PRKM14 |PRKM15 |RK |SAPK2A |p38 | p38ALPHA | 有丝分裂原激活的蛋白激酶14 | - | HPRD | 9878398 |
MCC | DKFZP762O1615 |FLJ38893 |FLJ46755 |MCC1 | 结直肠癌突变 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
prkab1 | Ampk |汉普克|MGC17785 | 蛋白激酶,AMP激活,β1非催化亚基 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 17353931 |
QARS | Glnrs |Pro2195 | 谷氨酰胺基-TRNA合成酶 | - | HPRD | 1651330 |
抢 | Argrs |dalrd1 |MGC8641 | 精氨酸-TRNA合成酶 | - | HPRD | 1651330|9878398 |
SCYE1 | AIMP1 |EMAP-2 |EMAP-II |EMAP2 |emapii |P43 | 小诱导细胞因子亚家族E,成员1(内皮单核细胞激活) | - | HPRD | 9878398 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG Selenoamino酸代谢 | 26 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg氨基酰基tRNA生物合成 | 41 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胞质tRNA氨基酰化 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome tRNA氨基酰化 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村癌症微环境DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sotiriou乳腺癌1级vs 3 | 151 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Puiffe入侵被腹水抑制 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向 | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 | 117 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard粉碎和燃烧突变体 | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭亮氨酸剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期DN | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁尼trabectedin抗性DN | 49 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
磷酸氨基酸剥夺 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化DN沉默 | 105 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
podar对Apaphostin的反应 | 147 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Takeer吉西他滨抗性DN | 122 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 81 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shaffer IRF4在活化的树突状细胞中的目标 | 65 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应11 | 103 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
因宗乳腺干细胞向上 | 146 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |