基因页：matn1
概括？
| 基因 | 4146 |
| 象征 | matn1 |
| 同义词 | CMP | CRTM |
| 描述 | 基质蛋白1，软骨基质蛋白 |
| 参考 | MIM：115437|HGNC：HGNC：6907|ENSEMBL：ENSG00000162510|HPRD：00276|Vega：Otthumg00000003705 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 135 |
| Pascal P值 | 0.01 |
| 胎儿β | -0.356 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG13203239 | 1 | 31192158 | matn1 | 1.8e-10 | -0.028 | 5.29e-7 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG01809819 | 1 | 31192165 | matn1 | 2.12E-8 | -0.013 | 7.22E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MCM5 | 0.97 | 0.86 |
| 永恒 | 0.97 | 0.90 |
| FAM83D | 0.97 | 0.75 |
| DTL | 0.97 | 0.87 |
| ORC1L | 0.97 | 0.81 |
| FAM64A | 0.96 | 0.78 |
| UHRF1 | 0.96 | 0.82 |
| kif2c | 0.96 | 0.83 |
| CDK2 | 0.96 | 0.63 |
| CDC45L | 0.96 | 0.76 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.46 | -0.77 |
| HLA-F | -0.45 | -0.77 |
| pth1r | -0.44 | -0.71 |
| FBXO2 | -0.44 | -0.61 |
| AIFM3 | -0.44 | -0.74 |
| AF347015.27 | -0.43 | -0.88 |
| AF347015.31 | -0.43 | -0.88 |
| AF347015.33 | -0.43 | -0.88 |
| S100B | -0.43 | -0.81 |
| MT-CO2 | -0.43 | -0.90 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Shipp DLBCL治愈与致命DN | 45 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 2 | 50 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老肌肉DN | 123 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| fontaine乳头状甲状腺癌DN | 80 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K27ME3 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Holleman泼尼松龙抗性B全部DN | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Holleman泼尼松龙抗性所有DN | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM糖蛋白 | 196 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |