基因页：MBP

概括?
基因 4155
象征 MBP
同义词 -
描述 髓磷脂碱性蛋白质
参考 MIM：159430|HGNC：HGNC：6925|Ensembl：ENSG00000197971|HPRD：01158|Vega:OTTHUMG00000132874
Gene type protein-coding
地图位置 18q23
Pascal P值 0.076
DMG 2（＃研究）
eGene Cerebellum
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞粘附和透射信号传导
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_clathrin
g2cdb.human_pocklingtonh1
g2cdb.human_synaptosom
G2CDB.HUMANNRC
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Jaffe_2016 Genome-wide DNA methylation analysis 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 4
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 4
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症Co-occurance关键词:schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias 点击to show details
go_annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations 与神经相关关键字的命中：4
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.0328

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
CG23470914 18 74800080 MBP 9.53e-6 0.661 0.013 DMG:Wockner_2014
CG20801056 18 74844767 MBP 3.004e-4 -0.368 0.04 DMG:Wockner_2014
CG15407373 18 74800029 MBP 3.788e-4 0.363 0.043 DMG:Wockner_2014
CG18362936 18 74844011 MBP 6.87E-8 -0.01 1.68e-5 DMG:Jaffe_2016

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance EQTL类型
RS1733504 chr3 71372796 MBP 4155 0.03 trans
RS1290499 chr3 71393339 MBP 4155 0.08 trans
rs6448932 chr4 12595798 MBP 4155 0.17 trans
RS17057381 chr8 27416800 MBP 4155 0.15 trans
RS758167 CHR12 1915558 MBP 4155 0.05 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

分子功能 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0019911 髓鞘的结构成分 IEA -
生物过程 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0007417 中枢神经系统发展 塔斯 Brain (GO term level: 6) 2434243
去：0008366 axon ensheathment 塔斯 neuron, axon (GO term level: 12) 2434243
去：0007268 突触传输 塔斯 neuron, Synap, Neurotransmitter (GO term level: 6) 2434243
GO:0006955 immune response 塔斯 7504278
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO：0043209 髓鞘 IEA 神经元，轴突，少突胶质细胞，神经胶质（GO期限：7） -
GO:0005886 质膜 IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
BMP2K BIKE | DKFZp434K0614 | DKFZp434P0116 | HRIHFB2017 BMP2诱导激酶 - HPRD 11500515
CLK1 clk |clk/sty |样式 CDC样激酶1 - HPRD 8798720
crkrs CRK7 | CRKR | KIAA0904 与CDC2相关的激酶，精氨酸/丝氨酸富含 - HPRD 11683387
CTDSP1 nliif ​​|SCP1 CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1 - HPRD 14743429
DYRK1B MIRK dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 1B - HPRD 10910078
EFHA1 1110008L20RIK |FLJ25016 |FLJ34588 EF手域家庭，成员A1 - HPRD 11124993
HLA-DRA HLA-DRA1 主要的组织相容性复合物，II类，Alpha博士 - HPRD，Biogrid 9782128
MAG GMA | S-MAG | SIGLEC-4A | SIGLEC4A 髓鞘相关的糖蛋白 - HPRD 12237860
MAPK1 ERK | ERK2 | ERT1 | MAPK2 | P42MAPK | PRKM1 | PRKM2 | p38 | p40 | p41 | p41mapk mitogen-activated protein kinase 1 MBP与MAPK1相互作用。这种相互作用是根据未指定物种以及猴子和小鼠MAPK1的MBP之间的相互作用进行建模的。 BIND 9792705
MAPK13 MGC99536 |PRKM13 |SAPK4 |p38delta mitogen-activated protein kinase 13 - HPRD 9207191
MAPK15 ERK7 |ERK8 mitogen-activated protein kinase 15 - HPRD 11875070
MAPKAPK5 PRAK mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 5 - HPRD 9628874
MKNK1 MNK1 MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1 - HPRD 9155018
MMP7 MMP-7 |mpsl1 |泵-1 基质金属肽酶7（子宫素，子宫） - HPRD 8786845
NEK9 DKFZP434D0935 |MGC138306 |MGC16714 |NERCC |NERCC1 |NEK8 NIMA（从不在有丝分裂基因A中） - 相关激酶9 - HPRD 11864968
PLP1 MMPL | PLP | PLP/DM20 | PMD | SPG2 proteolipid protein 1 - HPRD，Biogrid 2467009|6083474
PRKCA AAG6 | MGC129900 | MGC129901 | PKC-alpha | PKCA | PRKACA 蛋白激酶C，α PKC-alpha phosphorylates and interacts with MBP. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between PKC-alpha and MBP, both from unspecified species. BIND 10383403
PRKCD MAY1 | MGC49908 | PKCD | nPKC-delta 蛋白激酶C，三角洲 PKC-delta phosphorylates and interacts with MBP. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between PKC-delta and MBP, both from unspecified species. BIND 10383403
PRKCI DXS1179E | MGC26534 | PKCI | nPKC-iota protein kinase C, iota PKC-lambda phosphorylates and interacts with MBP. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between PKC-lambda and MBP, both from unspecified species. BIND 10383403
PRKCZ PKC-Zeta |PKC2 protein kinase C, zeta PKC-Zeta磷酸化并与MBP相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的PKC-Zeta和MBP之间的相互作用进行建模的。 BIND 10383403
PRMT5 HRMT1L5 | IBP72 | JBP1 | SKB1 | SKB1Hs protein arginine methyltransferase 5 - HPRD，Biogrid 11152681
Rock1 MGC131603 |MGC43611 |P160ROCK |Pro0435 Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 1 Rock1(ROCK) interacts with and phosphorylates MBP. BIND 15797222
Rock2 KIAA0619 Rho-associated, coiled-coil containing protein kinase 2 Rock2(ROCK) interacts with and phosphorylates MBP. BIND 15797222
RP6-213H19.1 MASK | MST4 serine/threonine protein kinase MST4 - HPRD 11641781
SRPK1 SFRSK1 SFRS蛋白激酶1 - HPRD 10390541
STK16 FLJ39635 | KRCT | MPSK | PKL12 | TSF1 丝氨酸/苏氨酸激酶16 - HPRD 10947953
STK39 DCHT | DKFZp686K05124 | PASK | SPAK serine threonine kinase 39 (STE20/SPS1 homolog, yeast) - HPRD，Biogrid 10980603
STK4 DKFZP686A2068 |KRS2 |mst1 |YSK3 serine/threonine kinase 4 - HPRD 7665586
TLK1 KIAA0137 |pku-beta 塔式类似激酶1 - HPRD 10523312
TLK2 MGC44450 | PKU-ALPHA 塔式类似激酶2 - HPRD 10523312
TRPM7 chak |chak1 |FLJ20117 |FLJ25718 |ltrpc7 |trp-plik transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 7 - HPRD，Biogrid 14594813


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 267 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘sox4靶向 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS UP 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES DCC TARGETS DN 121 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC DN 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK DN 39 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER SOX9 TARGETS IN PROSTATE DEVELOPMENT UP 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2 TARGETS DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GUO HEX TARGETS DN 65 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nemeth炎症反应LPS DN 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOREAUX B LYMPHOCYTE MATURATION BY TACI UP 92 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林引用1个目标1 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein少突胶质细胞 74 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marson Foxp3目标刺激了 29 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN MELANOMA COPY NUMBER DN 41 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG GLIOBLASTOMA PLASTICITY UP 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL UP 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 159 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAUCH HEDGEHOG SIGNALING PARACRINE UP 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG CORE SERUM RESPONSE DN 209 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN 238 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU VAV3 PROSTATE CARCINOGENESIS UP 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER NPC HCP WITH H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3 TARGETS DN 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZEMBUTSU SENSITIVITY TO CYCLOPHOSPHAMIDE 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤神经 129 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 UP 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert核心少突胶质细胞分化 40 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RAR BOUND ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 COMPLETE 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RATTENBACHER BOUND BY CELF1 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang EGF间隔DN 214 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-15/16/195/424/497 406 413 1a,m8 hsa-miR-15a脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
hsa-miR-15b脑 uagcagcacaucaugguuaca
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
hsa-miR-497 cagcagcacacuguguuugu
miR-503 407 413 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag