基因页:MC4R
概括?
基因 | 4160 |
象征 | MC4R |
同义词 | - |
描述 | 黑色皮质素4受体 |
参考 | MIM:155541|HGNC:HGNC:6932|ENSEMBL:ENSG00000166603|HPRD:01116|Vega:Otthumg00000132766 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q22 |
Pascal P值 | 0.471 |
胎儿β | -0.616 |
主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MC4R_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
grin1 | 0.90 | 0.91 |
NDRG4 | 0.90 | 0.87 |
SYNGR1 | 0.89 | 0.88 |
clstn3 | 0.89 | 0.88 |
PPFIA4 | 0.88 | 0.88 |
KCNJ9 | 0.87 | 0.81 |
ptprn | 0.87 | 0.88 |
PCNXL2 | 0.87 | 0.86 |
GPR61 | 0.87 | 0.87 |
ABCG4 | 0.87 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Rab13 | -0.43 | -0.52 |
GNG11 | -0.40 | -0.43 |
RPS20 | -0.40 | -0.46 |
AF347015.21 | -0.39 | -0.27 |
myl12a | -0.39 | -0.48 |
Impa2 | -0.39 | -0.43 |
RPL35 | -0.38 | -0.42 |
RPS6 | -0.38 | -0.36 |
C9orf46 | -0.38 | -0.35 |
RPL24 | -0.38 | -0.34 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Syndecan 3途径 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽配体结合受体 | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha的信号事件 | 121 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卫生部对干扰素beta的反应 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hendricks Smarca4靶向DN | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CCND1和CDK4的Molenaar靶标 | 67 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 | 126 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kinney DNMT1甲基化靶标 | 14 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |