基因页面:世纪挑战集团
总结吗?
| GeneID | 4163年 |
| 象征 | 世纪挑战集团 |
| 同义词 | MCC1 |
| 描述 | 突变在结肠直肠癌 |
| 参考 | MIM: 159350|HGNC: HGNC: 6935|运用:ENSG00000171444|HPRD: 01157|织女:OTTHUMG00000128804 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 5温度系数 |
| 帕斯卡假定值 | 0.18 |
| 胎儿β | -0.981 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:12.7012 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CMTM3 | 0.77 | 0.73 |
| SMO | 0.75 | 0.60 |
| ERBB2 | 0.73 | 0.56 |
| CENPM | 0.72 | 0.62 |
| NME4 | 0.72 | 0.68 |
| MFAP2 | 0.72 | 0.70 |
| CPXM1 | 0.72 | 0.70 |
| EPHB4 | 0.72 | 0.64 |
| TGIF2 | 0.72 | 0.56 |
| CHST14 | 0.71 | 0.56 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| HTATIP2 | -0.45 | -0.57 |
| CHN1 | -0.45 | -0.58 |
| TESK2 | -0.44 | -0.56 |
| HABP4 | -0.44 | -0.61 |
| MAP7 | -0.44 | -0.61 |
| SEPT8 | -0.44 | -0.56 |
| OSBPL1A | -0.43 | -0.59 |
| CBX7 | -0.43 | -0.59 |
| CPEB1 | -0.43 | -0.58 |
| SNAP25 | -0.43 | -0.62 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004872 | 受体的活动 | 助教 | 1848370 | |
| 去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 14743216|17353931 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 1848370 | |
| 去:0045786 | 负调控细胞周期 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CBR1 | CBR | hCBR1 | 羰基还原酶1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| CCNA1 | - - - - - - | 细胞周期蛋白A1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| 中国卫星发射测控系统部 | CHC | CHC17 | CLH-17 | CLTCL2 | Hc | KIAA0034 | 网格蛋白重链(Hc) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| CSNK1D | HCKID | 酪蛋白激酶1,三角洲 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| CSNK1E | HCKIE | MGC10398 | 酪蛋白激酶1,ε | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| DFFA | DFF-45 | DFF1 | ICAD | DNA分裂因素,45 kda,α多肽 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| EIF3A | EIF3 | EIF3S10 | KIAA0139 | P167 | TIF32 | eIF3-p170 | eIF3-theta | p180 | p185 | 真核翻译起始因子3,亚基 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| epr | 耳朵DKFZp313B047 | | GLUPRORS | |帕尔斯PIG32 | qar | qpr | glutamyl-prolyl-tRNA合成酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| EZR | CVIL | CVL | DKFZp762H157 | FLJ26216 | MGC1584 | VIL2 | ezrin | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| FAM40A | FLJ14743 | KIAA1761 | MGC148091 | rp4 - 773 n10.1 | 家庭使用序列相似性40岁的成员 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| HPRT1 | HGPRT |产生HPRT | 次黄嘌呤phosphoribosyltransferase 1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| iar | FLJ20736 | IARS1 |劳工关系| PRO0785 | isoleucyl-tRNA合成酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| KRT18 | CYK18 | K18 | 角蛋白18 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| LTA4H | - - - - - - | 白三烯A4水解酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| 火星 | FLJ35667 | METRS | MTRNS | methionyl-tRNA合成酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| MTHFD1 | MTHFC | MTHFD | methylenetetrahydrofolate脱氢酶(是nad +依赖性)1,methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase, formyltetrahydrofolate合成酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| MYH10 | MGC134913 | MGC134914 | NMMHCB | 肌凝蛋白重链10,non-muscle | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| NFKBIB | IKBB | TRIP9 | 核因子k光多肽基因增强剂b细胞抑制剂,β | MCC1与NFKBIB (I-kappa-B-beta)。 | 绑定 | 14743216 |
| PAICS | 现ADE2 | ADE2H1 | | DKFZp781N1372 | MGC1343 | MGC5024 |《国家 | phosphoribosylaminoimidazole羧化酶,phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide合成酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| PDCD10 | CCM3 | MGC1212 | MGC24477 | TFAR15 | 程序性细胞死亡10 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| pfa | FGAMS | FGARAT | KIAA0361 |潺潺流水 | phosphoribosylformylglycinamidine合酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| PFKP | FLJ40226 | PFK-C | PFKF | 磷酸果糖激酶,血小板 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| PPP2R1A | MGC786 | PR65A | 蛋白磷酸酶2(原2 A),调节亚基,α同种型 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| PSMD2 | MGC14274 | P97 | Rpn1 | S2 | TRAP2 | 蛋白酶体(prosome macropain) 26 s亚基,non-ATPase 2 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| PSME3 | Ki | PA28-gamma | PA28G | REG-GAMMA | 蛋白酶体(prosome macropain)激活单元3 (PA28伽马;Ki) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| SNRNP200 | ASCC3L1 | BRR2 | HELIC2 | u5 - 200 kd | 小核200 kda核糖核蛋白(U5) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| STK24 | MST-3 | MST3 | MST3B | STE20 | STK3 | 丝氨酸/苏氨酸激酶24 (STE20同族体、酵母) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| STRN | MGC125642 | SG2NA | striatin,钙调蛋白结合蛋白 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| STRN3 | SG2NA | striatin,钙调蛋白结合蛋白3 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| STRN4 | 寻FLJ35594 | | zinedin | striatin,钙调蛋白结合蛋白4 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| 水手 | MGC9344 | ThrRS | threonyl-tRNA合成酶 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| TPM3 | FLJ41118 | MGC14582 | MGC3261 | MGC72094 | NEM1 |好吧/ SW-cl。5 | TM-5 | TM3 | TM30 | TM30nm | TPMsk3 |载重汽车| hscp30 | 原肌球蛋白3 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| VCP | IBMPFD | MGC131997 | MGC148092 | MGC8560 | TERA | p97 | valosin-containing蛋白质 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| VDAC1 | MGC111064 |孔蛋白| PORIN-31-HL | 压敏电阻器阴离子通道1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| VHL | HRCA1 | RCA1 | VHL1 | 冯Hippel-Lindau肿瘤抑制 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| VPS35 | DKFZp434E1211 | DKFZp434P1672 | FLJ10752 | FLJ13588 | FLJ20388 | MEM3 | 空泡的蛋白分类35同族体(酵母) | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 压抑的徐HGF目标AKT1 DN | 95年 | 58 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日MYC放大目标 | 201年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH OCT4目标 | 290年 | 172年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王SMARCE1目标了 | 280年 | 183年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 | 393年 | 244年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MCCOLLUM GELDANAMYCIN抵抗了 | 10 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN小脑标记 | 85年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN CADWELL ATG16L1目标 | 70年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CROONQUIST国家管制当局方面与基质的刺激 | 41 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 蒋介石肝癌子类CTNNB1 DN | 170年 | 105年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 詹多发性骨髓瘤CD2 DN | 46 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党由MYC DN | 253年 | 192年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHANDRAN转移DN | 306年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒4 hr DN | 254年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| STAMBOLSKY应对维生素D3 | 84年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 经典VERHAAK胶质母细胞瘤 | 162年 | 122年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RATTENBACHER受CELF1 | 467年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |