基因页：MCF2
概括？
| 基因 | 4168 |
| 象征 | MCF2 |
| 同义词 | arhgef21 | dbl |
| 描述 | MCF.2细胞系导出转换序列 |
| 参考 | MIM：311030|HGNC：HGNC：6940|Ensembl：ENSG00000101977|HPRD：02406|Vega：Otthumg0000000022537 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | XQ27 |
| 胎儿β | -1.637 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17148160 | CHR4 | 70974564 | MCF2 | 4168 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CEP97 | 0.92 | 0.93 |
| UGCGL1 | 0.91 | 0.92 |
| KIAA0947 | 0.91 | 0.92 |
| MGA | 0.91 | 0.93 |
| RPS6KB1 | 0.91 | 0.92 |
| ARID4B | 0.91 | 0.92 |
| ZKSCAN1 | 0.91 | 0.92 |
| Znf37a | 0.91 | 0.92 |
| npat | 0.91 | 0.92 |
| PCM1 | 0.90 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.68 | -0.77 |
| MT-CO2 | -0.67 | -0.77 |
| FXYD1 | -0.67 | -0.75 |
| ifi27 | -0.66 | -0.75 |
| AF347015.21 | -0.66 | -0.79 |
| higd1b | -0.66 | -0.76 |
| AF347015.27 | -0.65 | -0.72 |
| mt-cyb | -0.64 | -0.72 |
| AF347015.8 | -0.64 | -0.74 |
| AF347015.33 | -0.64 | -0.70 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| pid rhoa reg途径 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CDC42 REG途径 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Rac1 Reg Pathway | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rho GTPases的Reactome信号传导 | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Nrage通过JNK发出死亡的信号 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞死亡信号通过Nrage NRIF和NADE传导 | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 | 81 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha1213信号传导事件 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yanagihara ESX1目标 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hedenfalk乳腺癌bracx | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YIH对砷C3的反应 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |