概括?
基因 4175
Symbol MCM6
同义词 MCG40308 | MIS5 | P105MCM
描述 微型鲜体维护复杂组件6
参考 MIM:601806|HGNC:HGNC:6949|Ensembl:ENSG00000076003|HPRD:03485|Vega:OTTHUMG00000131739
基因type protein-coding
地图位置 2q21
Pascal P值 0.845
Fetal beta 1.244
DMG 1(#研究)
eGene 尾状基底神经节
Cerebellum
Nucleus accumbens basal ganglia
梭子基底神经节
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 Genome-wide DNA methylation analysis The authors investigated the methylation profiles of DNA in peripheral blood cells from 18 patients with first-episode schizophrenia (FESZ) and from 15 normal controls. 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.023
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02395

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta(dis) FDR (dis) Study
CG12124516 2 136634144 MCM6 -0.025 0.34 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS12478970 2 136486524 MCM6 ENSG00000076003.4 9.86784E-6 0.05 147472 gtex_brain_putamen_basal

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
是的 0.94 0.93
Rab10 0.93 0.93
ABCE1 0.93 0.92
ACTR3 0.93 0.93
PLAA 0.91 0.90
cdc5l 0.91 0.91
LRRC40 0.91 0.92
COPB1 0.91 0.91
TWF1 0.91 0.91
MATR3 0.91 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.74 -0.78
AF347015.33 -0.70 -0.77
AF347015.31 -0.70 -0.76
MT-CYB -0.70 -0.76
ifi27 -0.69 -0.76
FXYD1 -0.69 -0.77
AF347015.8 -0.69 -0.76
higd1b -0.68 -0.76
AC018755.7 -0.68 -0.74
AF347015.27 -0.68 -0.74

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
GO:0003677 DNA结合 IEA -
GO:0003678 DNA helicase activity IEA -
GO:0003697 单链DNA结合 IEA -
GO:0005524 ATP结合 NAS 9286856
GO:0042802 相同的蛋白质结合 新闻学会 15232106
生物过程 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0006355 regulation of transcription, DNA-dependent IEA -
去:0006350 transcription IEA -
去:0006270 DNA复制启动 IEA -
去:0006268 DNA unwinding during replication IEA -
去:0006260 DNA replication 经验 12791985
去:0006260 DNA replication NAS 9286856
去:0007049 细胞周期 IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005634 NAS 9286856
GO:0005654 nucleoplasm 经验 10436018|10846177|11095689
|11931757|12045100
|15226314|15707391

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ALS2CR11 FLJ25351 |FLJ40332 amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) chromosome region, candidate 11 两个杂交 BioGRID 16189514
CDC45L cdc45 |cdc45l2 |PORC-PI-1 CDC45 cell division cycle 45-like (S. cerevisiae) 两个杂交 BioGRID 12614612
CDT1 dup |RIS2 染色质许可和DNA复制因子1 - HPRD 12192004
CRLS1 C20ORF155 |Cls1 |GCD10 |DJ967N21.6 Cardiolipin合酶1 - HPRD 12771218
IL1F5 FIL1 |FIL1(Delta)|file1d |IL1HY1 |IL1L1 |IL1RP3 |MGC29840 interleukin 1 family, member 5 (delta) 两个杂交 BioGRID 16189514
ING5 FLJ23842 |p28ing5 inhibitor of growth family, member 5 两个杂交 BioGRID 16189514
MCM10 CNA43 | DNA43 | MGC126776 | PRO2249 微型鲜石维护复杂组件10 in vitro
体内
两个杂交
BioGRID 11095689|16189514
MCM10 CNA43 | DNA43 | MGC126776 | PRO2249 微型鲜石维护复杂组件10 - HPRD 11095689|15232106
MCM2 BM28 |ccnl1 |CDCL1 |D3S3194 |KIAA0030 |MGC10606 |米托蛋白|CDC19 微型鲜体维护复杂组件2 MCM2与MCM6相互作用。 BIND 15236977
MCM2 BM28 |ccnl1 |CDCL1 |D3S3194 |KIAA0030 |MGC10606 |米托蛋白|CDC19 微型鲜体维护复杂组件2 Mcm2 interacts with Mcm6. BIND 15236977
MCM2 BM28 |ccnl1 |CDCL1 |D3S3194 |KIAA0030 |MGC10606 |米托蛋白|CDC19 微型鲜体维护复杂组件2 - HPRD,Biogrid 12694531
MCM4 CDC21 | CDC54 | MGC33310 | P1-CDC21 | hCdc21 微型鲜体维护复杂组件4 MCM4 interacts with MCM6. BIND 15236977
MCM4 CDC21 | CDC54 | MGC33310 | P1-CDC21 | hCdc21 微型鲜体维护复杂组件4 MCM4与MCM6相互作用。 BIND 15236977
MCM4 CDC21 | CDC54 | MGC33310 | P1-CDC21 | hCdc21 微型鲜体维护复杂组件4 Reconstituted Complex
两个杂交
BioGRID 12614612|12694531
MCM5 cdc46 |MGC5315 |P1-CDC46 微型鲜体维护复杂组件5 Affinity Capture-Western BioGRID 11248027
MCM6 MCG40308 | Mis5 | P105MCM 微型鲜体维护复杂组件6 - HPRD,Biogrid 12694531
MCM6 MCG40308 | Mis5 | P105MCM 微型鲜体维护复杂组件6 Mcm6 interacts with itself. BIND 15236977
MCM7 CDABP0042 |cdc47 |MCM2 |P1.1-MCM3 |P1CDC47 |p85mcm |PNAS-146 微型鲜体维护复杂组件7 - HPRD 8798650|10567526
|10748114|12207017
MCM7 CDABP0042 |cdc47 |MCM2 |P1.1-MCM3 |P1CDC47 |p85mcm |PNAS-146 微型鲜体维护复杂组件7 Affinity Capture-Western
体内
Reconstituted Complex
两个杂交
BioGRID 8798650|9099751
|10748114|12207017
|12614612|12694531
MCM7 CDABP0042 |cdc47 |MCM2 |P1.1-MCM3 |P1CDC47 |p85mcm |PNAS-146 微型鲜体维护复杂组件7 - HPRD 8798650|10567526
|10748114|12207017 | 12694531
MCM8 C20orf154 | MGC119522 | MGC119523 | MGC12866 | MGC4816 | REC | dJ967N21.5 微型鲜石维护复杂组件8 Affinity Capture-Western BioGRID 12771218
MLLT3 AF9 |FLJ2035 |Yeats3 髓样/淋巴样或混合细胞白血病(果蝇Trithorax同源物);易位到3 两个杂交 BioGRID 16189514
ORC1L HSORC1 |ORC1 |PARC1 起源识别综合体,亚基1状(酵母) 两个杂交 BioGRID 12614612
ORC2L ORC2 origin recognition complex, subunit 2-like (yeast) 两个杂交 BioGRID 12614612
ORC4L ORC4 |ORC4P origin recognition complex, subunit 4-like (yeast) 两个杂交 BioGRID 12614612
PSMA1 HC2 |MGC14542 |MGC14575 |MGC14751 |MGC1667 |MGC21459 |MGC22853 |MGC23915 |nu |PROS30 蛋白酶体(Prosome,宏观)亚基,Alpha型,1 两个杂交 BioGRID 16189514
RPA1 HSSB | REPA1 | RF-A | RP-A | RPA70 replication protein A1, 70kDa 两个杂交 BioGRID 12614612
SCNM1 MGC3180 sodium channel modifier 1 两个杂交 BioGRID 16189514


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KeGG DNA复制 36 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CELL CYCLE 128 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MCM PATHWAY 18 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME交流TIVATION OF THE PRE REPLICATIVE COMPLEX 31 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ORC1 REMOVAL FROM CHROMATIN 67 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞周期有丝分裂 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE CHECKPOINTS 124 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME M G1 TRANSITION 81 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G1 S过渡 112 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DNA的反应组合成 92 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC M M G1 PHASES 172 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ASSEMBLY OF THE PRE REPLICATIVE COMPLEX 65 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DNA REPLICATION 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME交流TIVATION OF ATR IN RESPONSE TO REPLICATION STRESS 38 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome放松DNA 11 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G2 M检查点 45 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome s阶段 109 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA链伸长 30 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SOTIRIOU BREAST CANCER GRADE 1 VS 3 UP 151 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SLEBOS HEAD AND NECK CANCER WITH HPV UP 84 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC3 TARGETS DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham正常静止与正常分裂DN 87 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU ANGIOGENESIS DN 37 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Eguchi细胞周期RB1目标 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATTIOLI MGUS VS PCL 116 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEINHOLD OVARIAN CANCER LOW GRADE DN 20 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM3 70 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA XPRSS INT NETWORK 168 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA CENTERED NETWORK 117 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
考夫曼黑色素瘤复发 61 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCIAN CELL CYCLE TARGETS OF TP53 AND TP73 DN 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAFFAREL RESPONSE TO THC DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH CYCLING GENES 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEORGES CELL CYCLE MIR192 TARGETS 62 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEORGES TARGETS OF MIR192 AND MIR215 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
唱机转移基质DN 54 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori前BI淋巴细胞向上 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori大型BII淋巴细胞向上 86 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI IMMATURE B LYMPHOCYTE DN 90 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和Sufu的Lee目标 53 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
考夫曼DNA复制基因 147 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC UP 54 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HBV感染的Wieland 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移DN 121 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F绑定的REN 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Dena Up 60 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER PBL KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK UP 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANSOM APC TARGETS UP 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AFFAR YY1 TARGETS DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova Prox1靶向 28 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZAMORA NOS2 TARGETS UP 69 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHODES UNDIFFERENTIATED CANCER 69 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IE86 CMV蛋白的歌曲目标 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KALMA E2F1 TARGETS 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期16小时 40 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T7 98 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY E2F4 UNSTIMULATED 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEIN ESRRA TARGETS RESPONSIVE TO ESTROGEN DN 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION UP 180 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG GLIOBLASTOMA PLASTICITY UP 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE WNT3A TARGETS UP 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB DN 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUELLER PLURINET 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对Serm或Fulvestrant DN的响应 50 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC靶向DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Cycling基因 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANTVEER BREAST CANCER ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iritani mad1靶向DN 47 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G23 UP 52 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRCA1的Pujana乳腺癌突变 56 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein ESR1目标 85 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINNEPENNINCKX MELANOMA METASTASIS UP 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
游动乳腺癌预后不良 55 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE LITERATURE 44 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU APOPTOSIS BY CDKN1A VIA TP53 55 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE G1 S 147 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向低血清 100 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
国外RB1增长目标 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG RESPONSE TO GSK3 INHIBITOR SB216763 DN 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1 TARGETS DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 COMPLETE 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
艾布拉姆森与艾尔互动 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU CELL CYCLE GENES IN IR RESPONSE 6HR 85 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG EGF INTERVAL UP 105 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因