基因页：CD46
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| 基因ID | 4179 |
| 象征 | CD46 |
| 同义词 | AHUS2 | MCP | MIC10 | TLX | TRA2.10 |
| 描述 | CD46分子 |
| 参考 | MIM:120920|HGNC：HGNC：6953|ENSEMBL：ENSG00000117335|HPRD:00406|Vega:OTTHUMG00000036397 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q32 |
| Sherlock P值 | 0.373 |
| 胎儿β | 0.622 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 海马 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2107425 | Chr11 | 2021074 | CD46 | 4179 | 0.17 | 反式 | ||
| RS57061241 | 1 | 208164366 | CD46 | ENSG00000117335.14 | 1.28156E-6 | 0.02 | 238964 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS585942 | 1 | 208170545 | CD46 | ENSG00000117335.14 | 2.93467E-6 | 0.02 | 245143 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
补充说明:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
补充说明:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| BRD4 | 0.89 | 0.89 |
| SF3A1 | 0.88 | 0.89 |
| Smarcc2 | 0.88 | 0.89 |
| crkrs | 0.88 | 0.91 |
| Arih1 | 0.88 | 0.91 |
| polr1a | 0.87 | 0.91 |
| SLC12A6 | 0.87 | 0.89 |
| ZC3H18 | 0.87 | 0.88 |
| C16orf72 | 0.87 | 0.88 |
| WDR26 | 0.86 | 0.89 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.73 | -0.82 |
| MT-CO2 | -0.71 | -0.82 |
| higd1b | -0.70 | -0.81 |
| FXYD1 | -0.70 | -0.79 |
| mt-cyb | -0.68 | -0.78 |
| AF347015.33 | -0.68 | -0.76 |
| ifi27 | -0.67 | -0.77 |
| AF347015.27 | -0.66 | -0.78 |
| TLCD1 | -0.66 | -0.76 |
| AF347015.8 | -0.66 | -0.79 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| C3 | Armd9 |ASP |CPAMD1 | 补体组件3 | - | HPRD，Biogrid | 1717583 |
| C4B | C4A |C4A13 |C4A91 |C4B1 |C4B12 |C4B2 |C4B3 |C4B5 |C4F |ch | CO4 | CPAMD3 | FLJ60561 | MGC164979 | 补体组件4B（Childo Blood Group） | - | HPRD，Biogrid | 1717583 |
| CD151 | GP27 |MER2 |PETA-3 |raph |sfa1 |TSPAN24 | CD151分子（Raph Blood群） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10741407 |
| CD46 | MCP |MGC26544 |MIC10 |TLX |Tra2.10 | CD46分子，补体调节蛋白 | - | HPRD | 10357804 |
| CD81 | S5.7 |TAPA1 |TSPAN28 | CD81分子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10741407 |
| CD82 | 4F9 | C33 | GR15 | IA4 | KAI1 | R2 | SAR2 | ST6 | TSPAN27 | CD82分子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10741407 |
| CD9 | 5H9 |BA2 |BTCC-1 |DARAP-27 |Gig2 |MIC3 |MRP-1 |p24 |TSPAN29 | CD9分子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10741407 |
| DLG4 | FLJ97752 |FLJ98574 |PSD95 |SAP90 | 圆盘，大型同源物4（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 11714708 |
| itga2 | br |CD49B |GPIA |VLA-2 |vlaa2 | integrin, alpha 2 (CD49B, alpha 2 subunit of VLA-2 receptor) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10741407 |
| ITGB1 | CD29 |fnrb |GPIIA |MDF2 |MSK12 |vla-beta |vlab | 整合素，β1（纤连蛋白受体，β多肽，抗原CD29包括MDF2，MSK12） | - | HPRD，Biogrid | 10741407 |
| llgl1 | DLG4 |Hugl |Hugl-1 |hugl1 |llgl | 致命的巨型幼虫同源物1（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 11714708 |
| MSN | - | Moesin | - | HPRD | 7884872 | 12082081 |
| MSN | - | Moesin | - | HPRD，Biogrid | 7884872 |
| src | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | V-SRC肉瘤（Schmidt-Ruppin A-2）病毒癌基因同源物（Avian） | - | HPRD，Biogrid | 10657632 |
| TSPAN4 | nag-2 |nag2 |四翼|TM4SF7 |TSPAN-4 | 四翼烷蛋白4 | - | HPRD | 10741407 |
| 是的1 | HST441 |p61-yes |是|c-yes | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒癌基因同源1 | - | HPRD，Biogrid | 11901164 |