基因页：SMCP
概括？
| 基因 | 4184 |
| 象征 | SMCP |
| 同义词 | HSMCSGEN1 | MCS | MCSP |
| 描述 | 精子线粒体相关的半胱氨酸蛋白 |
| 参考 | MIM：601148|HGNC：HGNC：6962|Ensembl：ENSG00000163206|HPRD：03093|Vega：Otthumg0000000012452 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q21.3 |
| Sherlock P值 | 0.49 |
| 胎儿β | -0.14 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG20951266 | 1 | 152856288 | SMCP | 3.905E-4 | -0.359 | 0.043 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CNNM1 | 0.93 | 0.93 |
| clstn1 | 0.92 | 0.92 |
| LRP11 | 0.92 | 0.93 |
| SLC8A2 | 0.92 | 0.93 |
| SLC6A17 | 0.92 | 0.92 |
| BSN | 0.92 | 0.92 |
| PIP5K1C | 0.91 | 0.93 |
| ankrd34a | 0.91 | 0.91 |
| iqsec2 | 0.91 | 0.87 |
| tspyl1 | 0.91 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DBI | -0.47 | -0.54 |
| GNG11 | -0.45 | -0.52 |
| myl12a | -0.44 | -0.52 |
| Rab13 | -0.42 | -0.52 |
| C1orf54 | -0.42 | -0.49 |
| C1orf61 | -0.42 | -0.51 |
| C8orf59 | -0.42 | -0.40 |
| peci | -0.42 | -0.45 |
| GTF3C6 | -0.41 | -0.36 |
| C21orf57 | -0.41 | -0.40 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007339 | 精子与Zona Pellucida结合 | IEA | - | |
| 去：0007341 | Zona Pellucida的渗透 | ISS | - | |
| 去：0030317 | 精子运动 | ISS | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005737 | 细胞质 | ISS | - | |
| 去：0005739 | 线粒体 | ISS | - | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0031966 | 线粒体膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| su睾丸 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由HPV31 DN永生 | 65 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Maekawa ATF2目标 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |