基因页面:MDH1
总结吗?
| GeneID | 4190年 |
| 象征 | MDH1 |
| 同义词 | HEL-S-32 | MDH-s | MDHA | MGC: 1375 | MOR2 |
| 描述 | 苹果酸脱氢酶1 |
| 参考 | MIM: 154200|HGNC: HGNC: 6970|运用:ENSG00000014641|HPRD: 01100|织女:OTTHUMG00000129512 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 p13.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.552 |
| 夏洛克假定值 | 0.674 |
| 胎儿β | -1.51 |
| DMG | 2(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | 细胞代谢 CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂症患者,神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg19981301 | 2 | 63820005 | MDH1 | 6.01的军医 | 0.558 | 0.05 | DMG: Wockner_2014 |
| cg15897423 | 2 | 63816096 | MDH1 | 2.28 e-8 | -0.008 | 7.59 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7132043 | chr12 | 80968399 | MDH1 | 4190年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| YEATS2 | 0.93 | 0.92 |
| PIK3C2B | 0.92 | 0.94 |
| PHF12 | 0.92 | 0.92 |
| POGZ | 0.91 | 0.94 |
| UBR4 | 0.91 | 0.92 |
| BRPF1 | 0.91 | 0.92 |
| KIAA0892 | 0.91 | 0.94 |
| PPRC1 | 0.91 | 0.91 |
| ZZEF1 | 0.91 | 0.92 |
| CRAMP1L | 0.91 | 0.92 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.83 |
| MT-CO2 | -0.69 | -0.80 |
| C5orf53 | -0.69 | -0.71 |
| IFI27 | -0.68 | -0.78 |
| AF347015.27 | -0.68 | -0.79 |
| FXYD1 | -0.68 | -0.78 |
| HIGD1B | -0.67 | -0.80 |
| AF347015.21 | -0.67 | -0.86 |
| CXCL14 | -0.66 | -0.78 |
| B2M | -0.66 | -0.72 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005488 | 绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0004470 | 苹果酸脱氢酶活性 | 助教 | 8786100 | |
| 去:0016491 | 氧化还原酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030060 | L-malate脱氢酶活性 | 经验值 | 15565635 | |
| 去:0030060 | L-malate脱氢酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006108 | 苹果酸代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006099 | 三羧酸循环 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006096 | 糖酵解 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0044262 | 细胞碳水化合物代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0055114 | 氧化还原 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005829 | 胞质 | 经验值 | 15565635 | |
| 去:0005829 | 胞质 | 助教 | 8786100 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG柠檬酸周期三羧酸循环 | 32 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG丙酮酸代谢 | 40 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG乙醛酸,DICARBOXYLATE新陈代谢 | 16 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG近端小管重碳酸盐复垦 | 23 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA克雷布斯通路 | 8 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME糖质新生 | 34 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢碳水化合物 | 247年 | 154年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME葡萄糖代谢 | 69年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN | 455年 | 304年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔ATL慢性和急性DN | 18 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 大黄酸糖皮质激素治疗DN | 362年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 角化细胞DN ENK紫外线反应 | 485年 | 334年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| OUELLET卵巢癌浸润性对LMP | 117年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 胡血管生成DN | 37 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| APPIERTO应对FENRETINIDE DN | 51 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SCHLOSSER血清反应 | 712年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHETH肝癌VS TXNIP PAM4损失 | 261年 | 153年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化好与差 | 236年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 肯尼CTNNB1 DN的目标 | 52 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植排斥和好的DN | 546年 | 351年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肝癌E2F1 DN | 64年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 | 555年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MODY海马产后 | 63年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 击倒卡路里限制肌肉DN | 87年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 击倒老化肌肉DN | 123年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃造血作用中间祖 | 149年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHLINGEMANN皮肤致癌TPA DN | 29日 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 《图片报》极品致癌签名 | 261年 | 166年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DURCHDEWALD皮肤致癌作用 | 88年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 检查参与组成分泌腺中肺癌和巨噬细胞 | 77年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAVIN集群T7 FOXP3目标 | 98年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯坦ESRRA目标了 | 388年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张乳腺癌的祖细胞 | 425年 | 253年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马宏升应对17亚美大陆煤层气有限公司DN | 79年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿隆索转移了 | 198年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHAUHAN应对METHOXYESTRADIOL DN | 102年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUTELLA CSF2RB和IL4 | 338年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUTELLA应对HGF | 418年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 | 408年 | 276年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧管家基因 | 389年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滤泡性甲状腺腺瘤方丹DN | 68年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯坦ESRRA目标 | 535年 | 325年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究糖质新生 | 32 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍少突细胞数量。柯尔 | 756年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金所有障碍CALB1 CORR | 548年 | 370年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VERHAAK胶质母细胞瘤神经 | 129年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |