基因页面:MDH2
总结吗?
| GeneID | 4191年 |
| 象征 | MDH2 |
| 同义词 | M-MDH | MDH | MGC: 3559 | MOR1 |
| 描述 | 苹果酸脱氢酶2 |
| 参考 | MIM: 154100|HGNC: HGNC: 6971|运用:ENSG00000146701|HPRD: 01099|织女:OTTHUMG00000023827 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 cen-q22 |
| 帕斯卡假定值 | 0.699 |
| 夏洛克假定值 | 0.972 |
| 胎儿β | -0.276 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_clathrin G2Cdb.human_mitochondria G2Cdb.human_Synaptosome G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7132043 | chr12 | 80968399 | MDH2 | 4191年 | 0.1 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CLIP1 | 0.91 | 0.92 |
| TSC1 | 0.91 | 0.93 |
| ANKRD28 | 0.90 | 0.90 |
| DNAJC13 | 0.90 | 0.91 |
| KIAA0528 | 0.90 | 0.91 |
| C22orf30 | 0.89 | 0.92 |
| USP7 | 0.89 | 0.90 |
| UBR2 | 0.89 | 0.90 |
| RASA1 | 0.89 | 0.89 |
| DOPEY1 | 0.89 | 0.93 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.77 | -0.75 |
| MT-CO2 | -0.75 | -0.74 |
| FXYD1 | -0.75 | -0.72 |
| AF347015.21 | -0.74 | -0.77 |
| HIGD1B | -0.74 | -0.76 |
| ENHO | -0.73 | -0.78 |
| IFI27 | -0.72 | -0.72 |
| AF347015.8 | -0.71 | -0.72 |
| AF347015.33 | -0.71 | -0.68 |
| MT-CYB | -0.71 | -0.69 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG柠檬酸周期三羧酸循环 | 32 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG丙酮酸代谢 | 40 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG乙醛酸,DICARBOXYLATE新陈代谢 | 16 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME丙酮酸代谢和柠檬酸三羧酸循环 | 48 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME柠檬酸循环和呼吸电子传递 | 141年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME糖质新生 | 34 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME柠檬酸循环三羧酸循环 | 26 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢碳水化合物 | 247年 | 154年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME葡萄糖代谢 | 69年 | 42 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 父母MTOR信号了 | 567年 | 375年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1单核细胞融合 | 204年 | 140年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SILIGAN EWS FLI1融合的目标 | 15 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| APPIERTO应对FENRETINIDE DN | 51 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力DN | 637年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN | 517年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伯顿脂肪生成5 | 126年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 杰克逊DNMT1 DN的目标 | 25 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 检查参与组成分泌腺中肺癌和巨噬细胞 | 77年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 检查参与组成分泌腺中肺癌和内皮 | 66年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 检查参与组成分泌腺中肺癌和成纤维细胞 | 132年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CREIGHTON内分泌治疗抵抗4 | 307年 | 185年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯坦ESRRA目标了 | 388年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究人类MITODB 6 2002 | 429年 | 260年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究包括 | 420年 | 269年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究柠檬酸 | 16 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究线粒体 | 447年 | 277年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN YOSHIMURA MAPK8目标 | 366年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 八木AML和发票16易位 | 422年 | 277年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯坦ESRRA目标 | 535年 | 325年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 么时间响应黄体酮集群17 | 181年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 研究糖质新生 | 32 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒4 hr DN | 254年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |