基因页面:MECP2

总结吗?
GeneID 4204年
象征 MECP2
同义词 AUTSX3 | MRX16 | MRX79 | MRXS13 | MRXSL | PPMX RS | | RTS | RTT
描述 methyl-CpG结合蛋白2
参考 MIM: 300005|HGNC: HGNC: 6990|运用:ENSG00000169057|HPRD: 02050|织女:OTTHUMG00000024229
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 中Xq28
夏洛克假定值 0.642
这样假定值 0.012
胎儿β 0.437
支持 染色质重塑基因

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
认为:McCarthy_2014 全外显子组测序分析 全外显子组测序的57个三人小组与零星或家族性精神分裂症。
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
MECP2 chrX 153296711 C T NM_001110792 p.R202C 错义SNV C D 精神分裂症 认为:McCarthy_2014


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 助教 9620804
去:0003714 转录辅阻遏物活动 助教 10773092
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 15696166
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000122 负调控RNA聚合酶II启动子的转录 助教 9620804
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0006350 转录 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 核 助教 10773092
去:0005730 核仁 艾达 18029348
去:0005739 线粒体 艾达 18029348

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
刘SOX4 DN的目标 309年 191年 所有SZGR 2.0基因通路
钟阿扎胞苷和TSA DN 70年 38 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯DCC DN的目标 121年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
斯米尔诺夫循环内皮细胞癌症 158年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
DN SENESE HDAC3目标 536年 332年 所有SZGR 2.0基因通路
角化细胞DN ENK紫外线反应 485年 334年 所有SZGR 2.0基因通路
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 1781年 1082年 所有SZGR 2.0基因通路
通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 855年 609年 所有SZGR 2.0基因通路
滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN 483年 336年 所有SZGR 2.0基因通路
NUYTTEN EZH2的目标了 1037年 673年 所有SZGR 2.0基因通路
布伊泰尔特说光动力治疗压力DN 637年 377年 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼转移了 344年 180年 所有SZGR 2.0基因通路
沈SMARCA2目标了 424年 268年 所有SZGR 2.0基因通路
MORI小PRE BII淋巴细胞 86年 57 所有SZGR 2.0基因通路
DAZARD应对紫外线这些DN 318年 220年 所有SZGR 2.0基因通路
BAELDE糖尿病肾病DN 434年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
集群G6 DAZARD紫外线反应 153年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
李老化肌肉了 45 33 所有SZGR 2.0基因通路
阿塞维多甲基化在肝癌DN 940年 425年 所有SZGR 2.0基因通路
BONOME卵巢癌生存非最优减积 510年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
西方肾上腺皮质肿瘤DN 546年 362年 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305年 895年 所有SZGR 2.0基因通路
小野AML1目标了 24 14 所有SZGR 2.0基因通路
小野FOXP3目标了 23 15 所有SZGR 2.0基因通路
GOBERT少突细胞分化DN 1080年 713年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
let-7/98 3444年 3450年 m8 hsa-let-7a大脑 UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU
hsa-let-7b大脑 UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU
hsa-let-7c大脑 UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU
hsa-let-7d大脑 AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
hsa-let-7e大脑 UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU
hsa-let-7f大脑 UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU
hsa - mir - 98大脑 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
hsa-let-7g深圳 UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU
hsa-let-7i大脑 UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU
miR-103/107 276年 282年 1 hsa - mir - 103大脑 AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA
hsa - mir - 107大脑 AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA
hsa - mir - 103大脑 AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA
hsa - mir - 107大脑 AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA
mir - 122 385年 391年 m8 hsa - mir - 122 a UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGU
mir - 124.1 8541年 8547年 m8 hsa - mir - 124 a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
miR-124/506 8541年 8547年 1 hsa - mir - 506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa - mir - 124大脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir - 129 - 5 - p 6286年 6292年 1 hsa - mir - 129大脑 CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC
hsa - mir - 129 - 5 - p CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU
miR-130/301 976年 983年 1、m8 hsa - mir - 130 a大脑 CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU
hsa - mir - 301 CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC
hsa - mir - 130 b大脑 CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU
hsa - mir - 454 - 3 - p UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU
hsa - mir - 130 a大脑 CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU
hsa - mir - 301 CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC
hsa - mir - 130 b大脑 CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU
hsa - mir - 454 - 3 - p UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU
miR-132/212 6887年 6894年 1、m8 hsa - mir - 212深圳 UAACAGUCUCCAGUCACGGCC
hsa - mir - 132大脑 UAACAGUCUACAGCCAUGGUCG
miR-141/200a 5283年 5289年 m8 hsa - mir - 141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
hsa - mir - 200 a UAACACUGUCUGGUAACGAUGU
miR-148/152 8398年 8404年 1 hsa - mir - 148 a UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa - mir - 152大脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
hsa - mir - 148 b UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
mir - 155 6322年 6328年 m8 hsa - mir - 155 UUAAUGCUAAUCGUGAUAGGGG
miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d 242年 248年 m8 hsa-miR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
hsa-miR-20a大脑 UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 106 a AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa - mir - 106 b深圳 UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20b深圳 CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 519 d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
mir - 181 8465年 8472年 1、m8 hsa - mir - 181 a大脑 AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 b深圳 AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
hsa - mir - 181 c大脑 AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
hsa - mir - 181 d大脑 AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU
mir - 182 3681年 3687年 1 hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
miR-19 239年 245年 m8 hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
miR-192/215 3388年 3394年 m8 hsa - mir - 192 CUGACCUAUGAAUUGACAGCC
hsa - mir - 215 AUGACCUAUGAAUUGACAGAC
mir - 194 6889年 6895年 m8 hsa - mir - 194 UGUAACAGCAACUCCAUGUGGA
mir - 196 3443年 3449年 m8 hsa - mir - 196 a UAGGUAGUUUCAUGUUGUUGG
hsa - mir - 196 b UAGGUAGUUUCCUGUUGUUGG
hsa - mir - 196 a UAGGUAGUUUCAUGUUGUUGG
hsa - mir - 196 b UAGGUAGUUUCCUGUUGUUGG
mir - 203.1 8447年 8453年 1 hsa - mir - 203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
miR-204/211 5606年 5612年 1 hsa - mir - 204大脑 UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU
hsa - mir - 211 UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU
mir - 218 197年 203年 m8 hsa - mir - 218大脑 UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU
miR-22 43 49 m8 hsa-miR-22大脑 AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU
miR-26 6765年 6771年 1 hsa-miR-26a大脑 UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
hsa-miR-26b深圳 UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
mir - 299 - 5 - p 8454年 8460年 m8 hsa - mir - 299 - 5 - p UGGUUUACCGUCCCACAUACAU
miR-30-3p 98年 104年 m8 hsa-miR-30a-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC
hsa-miR-30e-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC
hsa-miR-30a-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC
hsa-miR-30e-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC
miR-30-5p 2053年 2060年 1、m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir - 320 3857年 3863年 m8 hsa - mir - 320 AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA
mir - 326 7210年 7216年 1 hsa - mir - 326 CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG
mir - 328 224年 230年 m8 hsa - mir - 328大脑 CUGGCCCUCUCUGCCCUUCCGU
miR-34/449 3911年 3917年 1 hsa-miR-34a大脑 UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU
hsa-miR-34c AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC
hsa - mir - 449 UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU
hsa - mir - 449 b AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC
miR-34b 4496年 4502年 m8 hsa-miR-34b UAGGCAGUGUCAUUAGCUGAUUG
mir - 361 5584年 5591年 1、m8 hsa - mir - 361大脑 UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC
mir - 369 - 3 - p 8525年 8531年 1 hsa - mir - 369 - 3 - p AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU
mir - 374 5502年 5508年 1 hsa - mir - 374 UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG
hsa - mir - 374 UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG
hsa - mir - 374 UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG
mir - 378 2308年 2314年 1 hsa - mir - 378 CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU
hsa - mir - 378 CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU
mir - 410 5476年 5482年 1 hsa - mir - 410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
hsa - mir - 410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
mir - 455 1139年 1145年 1 hsa - mir - 455 UAUGUGCCUUUGGACUACAUCG
mir - 499 2128年 2134年 m8 hsa - mir - 499 UUAAGACUUGCAGUGAUGUUUAA
mir - 504 4507年 4513年 m8 hsa - mir - 504 AGACCCUGGUCUGCACUCUAU
mir - 505 7097年 7103年 m8 hsa - mir - 505 GUCAACACUUGCUGGUUUCCUC
miR-7 929年 935年 1 hsa-miR-7深圳 UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG
米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 2282年 2288年 m8 hsa - mir - 93大脑 AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG
hsa - mir - 302 a UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA
hsa - mir - 302 b UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG
hsa - mir - 302 c UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
hsa - mir - 302 d UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU
hsa - mir - 372 AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU
hsa - mir - 373 GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU
hsa - mir - 520 e AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
hsa - mir - 520 a AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU
hsa - mir - 520 b AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG
hsa - mir - 520 c AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU
hsa - mir - 520 d AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU
mir - 96 3680年 3687年 1、m8 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC