总结吗?
GeneID 4208年
象征 MEF2C
同义词 C5DELq14.3 | DEL5q14.3
描述 肌细胞增强因子2摄氏度
参考 MIM: 600662|HGNC: HGNC: 6996|运用:ENSG00000081189|HPRD: 02809|织女:OTTHUMG00000162634
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 5 q14.3
帕斯卡假定值 0.001
夏洛克假定值 0.398
胎儿β -0.27
DMG 1(#研究)
eGene

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 2
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg19734870 5 87956883 MEF2C 2.32 e-9 -0.013 1.76 e-6 DMG: Jaffe_2016
cg25611476 5 88179989 MEF2C 4.06 e-9 -0.014 2.49 e-6 DMG: Jaffe_2016


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
TRHDE 0.70 0.79
NCAM2 0.68 0.75
GABRB2 0.68 0.74
HOMER1 0.68 0.67
EXPH5 0.67 0.69
RYR2 0.67 0.75
AP000751.3 0.67 0.62
SLC4A10 0.67 0.74
HTR2A 0.67 0.74
CNKSR2 0.67 0.69
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
GSTM2 -0.37 -0.47
AC135586.1 -0.33 -0.42
EFEMP2 -0.33 -0.23
RFXANK -0.32 -0.38
NT5C -0.31 -0.33
BCL7C -0.31 -0.51
RAB13 -0.31 -0.42
FAM181B -0.30 -0.47
PECI -0.29 -0.33
RAB34 -0.29 -0.23

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003700 转录因子的活动 NAS 8575763
去:0003702 RNA聚合酶II转录因子的活动 助教 8455629
去:0043565 sequence-specific DNA结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007399 神经系统发育 助教 神经突(术语层面:5) 8455629
去:0001568 血管的发展 国际能源机构 - - - - - -
去:0001649 成骨细胞分化 国际能源机构 - - - - - -
去:0002062 软骨细胞分化 国际能源机构 - - - - - -
去:0001958 软骨内骨化 国际能源机构 - - - - - -
去:0001974 血管重构 国际能源机构 - - - - - -
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0007517 肌肉发展 助教 8455629
去:0007507 心发展 国际能源机构 - - - - - -
去:0045941 积极的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0045944 积极的监管RNA聚合酶II启动子的转录 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005634 国际能源机构 - - - - - -

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
EP300 KAT3B | p300 E1A结合蛋白p300 表型增强
重新组成复杂
BioGRID 9001254
HDAC4 HA6116 | HD4 | HDAC-A | HDACA | KIAA0288 组蛋白脱乙酰酶4 - - - - - - HPRD 10523670|11504882
HDAC4 HA6116 | HD4 | HDAC-A | HDACA | KIAA0288 组蛋白脱乙酰酶4 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 10523670|11486037
MAPK14 CSBP1 | CSBP2 | CSPB1 | EXIP | Mxi2 | PRKM14 | PRKM15 | RK | SAPK2A | p38 | p38ALPHA 增殖蛋白激酶14 - - - - - - HPRD 9753748|10330143
MAPK7 BMK1 | ERK4 | ERK5 | PRKM7 增殖蛋白激酶7 - - - - - - HPRD, BioGRID 9753748
MAPK7 BMK1 | ERK4 | ERK5 | PRKM7 增殖蛋白激酶7 不详的同种型ERK5磷酸化MEF2C。之间的交互是仿照了交互ERK5从物种和MEF2C不详不详的物种。 绑定 12659851
MEF2D DKFZp686I1536 肌细胞增强因子2 d - - - - - - HPRD 9858528
MYOD1 抽水机MYF3 | MYOD | | bHLHc1 肌原性的分化1 2台混合动力 BioGRID 9418854
MYOG MYF4 | MYOGENIN | bHLHc3 myogenin(4)肌原性的因素 重新组成复杂 BioGRID 8548800
SMAD2 JV18 | JV18-1 | MADH2 | MADR2 | MGC22139 | MGC34440 | hMAD-2 | hSMAD2 SMAD家庭成员2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11160896
SOX18 停止 SRY(性别决定区域Y) 18箱 SOX18直接与MEF2C交互。这种交互建模证明小鼠蛋白质之间的相互作用。 绑定 11554755
SOX18 停止 SRY(性别决定区域Y) 18箱 - - - - - - HPRD, BioGRID 11554755
SP1 - - - - - - Sp1转录因子 - - - - - - HPRD, BioGRID 9748305
TEAD1 AA | REF1 | TCF13 | TEF-1 茶域家庭成员1 (SV40转录增强因子) 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 12061776
TWIST2 DERMO1 | MGC117334 | bHLHa39 捻同族体2(果蝇) - - - - - - HPRD, BioGRID 11809751
VGLL2 VGL2 | VITO1 残留像2(果蝇) - - - - - - HPRD 12376544
VGLL4 KIAA0121 | VGL-4 残留像4(果蝇) - - - - - - HPRD 15140898


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG MAPK信号通路 267年 205年 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA筛选途径 37 29日 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA AT1R通路 36 28 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CARM ER通路 35 27 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA HDAC通路 32 25 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA MAPK通路 87年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA NFAT通路 56 45 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA P38MAPK通路 40 31日 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA PGC1A通路 26 20. 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA ERK5通路 18 15 所有SZGR 2.0基因通路
PID SMAD2 3核通路 82年 63年 所有SZGR 2.0基因通路
PID HDAC CLASSII通路 34 27 所有SZGR 2.0基因通路
PID ERBB1下游通路 105年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
PID P38αβ下游通路 38 29日 所有SZGR 2.0基因通路
PID MAPK TRK通路 34 31日 所有SZGR 2.0基因通路
PID 1 RB通路 65年 46 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过神经生长因子 217年 167年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME发育生物学 396年 292年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME TRIF TLR3信号介导的 74年 54 所有SZGR 2.0基因通路
从质膜通过TRKA REACTOME神经生长因子信号 137年 105年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME核事件激酶和转录因子激活 24 20. 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME ERK MAPK的目标 21 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME肌细胞生成 28 20. 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME MAP激酶激活TLR级联 50 37 所有SZGR 2.0基因通路
由地图激酶REACTOME MAPK目标核事件 30. 24 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME生物钟 53 40 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME TRAF6介导的诱导NFKB和MAP激酶TLR7 8或9激活 77年 57 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME NFKB和MAP激酶激活TLR4介导的信号 72年 53 所有SZGR 2.0基因通路
在质膜REACTOME MYD88 MAL级联发起 83年 63年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME先天免疫系统 279年 178年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME激活TLR4信号 93年 69年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME免疫系统 933年 616年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME人数受体瀑布 118年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
通过CD40 HOLLMANN细胞凋亡 201年 125年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHUETZ乳腺癌导管侵入性 351年 230年 所有SZGR 2.0基因通路
CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN 663年 425年 所有SZGR 2.0基因通路
HUTTMANN B CLL穷人生存DN 60 39 所有SZGR 2.0基因通路
武田的目标NUP98 HOXA9融合8 d 157年 91年 所有SZGR 2.0基因通路
阿克勒说道HTLV1感染DN 68年 41 所有SZGR 2.0基因通路
大黄酸糖皮质激素治疗DN 362年 238年 所有SZGR 2.0基因通路
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1融合粒细胞 55 34 所有SZGR 2.0基因通路
李神经嵴干细胞 146年 99年 所有SZGR 2.0基因通路
金赛的目标EWSR1 FLII融合DN 329年 219年 所有SZGR 2.0基因通路
多德鼻咽癌起来 1821年 933年 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺未分化癌DN 537年 339年 所有SZGR 2.0基因通路
MCBRYAN发育期乳房5 6周DN 137年 97年 所有SZGR 2.0基因通路
MCBRYAN发育期乳房6 7周 197年 135年 所有SZGR 2.0基因通路
邓恩的目标AML1 MTG8融合DN 19 17 所有SZGR 2.0基因通路
MCBRYAN发育期TGFB1目标 169年 127年 所有SZGR 2.0基因通路
DARWICHE皮肤肿瘤促进剂DN 185年 115年 所有SZGR 2.0基因通路
DARWICHE乳头状瘤风险低的DN 165年 107年 所有SZGR 2.0基因通路
DARWICHE乳头状瘤风险高的DN 180年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
DARWICHE鳞状细胞癌DN 181年 107年 所有SZGR 2.0基因通路
RIZ红细胞分化APOBEC2 27 19 所有SZGR 2.0基因通路
RIZ红细胞分化6小时 40 23 所有SZGR 2.0基因通路
EBAUER目标PAX3 FOXO1融合起来 207年 128年 所有SZGR 2.0基因通路
TURJANSKI MAPK7目标 8 8 所有SZGR 2.0基因通路
TURJANSKI MAPK11目标 5 5 所有SZGR 2.0基因通路
TURJANSKI MAPK14目标 10 10 所有SZGR 2.0基因通路
EBAUER肌原性的目标PAX3 FOXO1融合 50 26 所有SZGR 2.0基因通路
AMUNDSON基因毒性的签名 105年 68年 所有SZGR 2.0基因通路
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN 584年 395年 所有SZGR 2.0基因通路
鲜明的前额叶皮层22 q11删除 195年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
MORI小PRE BII淋巴细胞DN 76年 52 所有SZGR 2.0基因通路
MORI成熟的B淋巴细胞 90年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
CHESLER大脑最高的遗传方差 37 21 所有SZGR 2.0基因通路
罗斯AML MLL融合 78年 45 所有SZGR 2.0基因通路
西普DLBCL和滤泡性淋巴瘤的DN 45 28 所有SZGR 2.0基因通路
IIZUKA肝癌早期复发 11 10 所有SZGR 2.0基因通路
由氯高铁血红素ADDYA红细胞分化 73年 47 所有SZGR 2.0基因通路
松田自然杀伤细胞分化 475年 313年 所有SZGR 2.0基因通路
哈达德B淋巴细胞祖 293年 193年 所有SZGR 2.0基因通路
公园HSC和多能祖细胞 50 33 所有SZGR 2.0基因通路
佩特洛娃内皮淋巴和血液 131年 87年 所有SZGR 2.0基因通路
VERHAAK AML NPM1突变的DN 246年 180年 所有SZGR 2.0基因通路
低音部CD40信号了 101年 76年 所有SZGR 2.0基因通路
KUMAR MLL AF9融合的目标 405年 264年 所有SZGR 2.0基因通路
陆衰老的大脑DN 153年 120年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
崔TCF21目标2 DN 830年 547年 所有SZGR 2.0基因通路
麦克朗三角洲FOSB目标2周 48 36 所有SZGR 2.0基因通路
埃利希ICF症侯群DN 15 13 所有SZGR 2.0基因通路
麦克朗CREB1目标了 One hundred. 72年 所有SZGR 2.0基因通路
WELCSH BRCA1目标了 198年 132年 所有SZGR 2.0基因通路
伊万诺娃造血干细胞和祖 681年 420年 所有SZGR 2.0基因通路
曾IRS1目标了 113年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
NIKOLSKY过于重视公关在导致乳腺癌 22 19 所有SZGR 2.0基因通路
KYNG DNA损伤射线和紫外线辐射 88年 65年 所有SZGR 2.0基因通路
KYNG DNA损伤了 226年 164年 所有SZGR 2.0基因通路
海勒HDAC目标了 317年 208年 所有SZGR 2.0基因通路
海勒HDAC目标被甲基化 461年 298年 所有SZGR 2.0基因通路
RIZKI肿瘤侵袭性的3 d DN 270年 181年 所有SZGR 2.0基因通路
萧述三乳腺癌等正常 476年 285年 所有SZGR 2.0基因通路
BONOME卵巢癌生存非最优减积 510年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
了吉西他滨抵抗了 79年 40 所有SZGR 2.0基因通路
公园APL发病了 14 11 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA CSF2RB和IL4 DN 315年 201年 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA应对HGF DN 235年 144年 所有SZGR 2.0基因通路
RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 408年 276年 所有SZGR 2.0基因通路
甜蜜的肺癌喀斯特DN 435年 289年 所有SZGR 2.0基因通路
霍夫曼小BII以前不成熟的B淋巴细胞 70年 49 所有SZGR 2.0基因通路
60张及目标的人力资源 293年 203年 所有SZGR 2.0基因通路
VALK AML集群1 28 19 所有SZGR 2.0基因通路
吴肝癌复发 105年 75年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和T 9 11易位 130年 87年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和11 q23处重新安排 351年 238年 所有SZGR 2.0基因通路
DN PILON KLF1目标 1972年 1213年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 898年 516年 所有SZGR 2.0基因通路
TORCHIA EWSR1 FLI1融合DN的目标 321年 200年 所有SZGR 2.0基因通路
GOBERT少突细胞分化了 570年 339年 所有SZGR 2.0基因通路
若林史江脂肪生成PPARG 36小时 29日 23 所有SZGR 2.0基因通路
PLASARI TGFB1目标10人力资源DN 244年 157年 所有SZGR 2.0基因通路
不是通过P38冯氏TNF响应 337年 236年 所有SZGR 2.0基因通路
黄宗泽过敏原诱导TH2相关模块 151年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
叠成白血病干细胞 29日 15 所有SZGR 2.0基因通路
LIM乳腺干细胞 489年 314年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 135 857年 863年 m8 hsa - mir - 135 a UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA
hsa - mir - 135 b UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
mir - 153 398年 404年 1 hsa - mir - 153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
mir - 182 355年 362年 1、m8 hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
mir - 183 1875年 1882年 1、m8 hsa - mir - 183 UAUGGCACUGGUAGAAUUCACUG
mir - 188 1842年 1848年 m8 hsa - mir - 188 CAUCCCUUGCAUGGUGGAGGGU
miR-19 1080年 1086年 1 hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir - 194 287年 293年 1 hsa - mir - 194 UGUAACAGCAACUCCAUGUGGA
mir - 203.1 1331年 1337年 1 hsa - mir - 203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
hsa - mir - 203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
mir - 223 1627年 1633年 m8 hsa - mir - 223 UGUCAGUUUGUCAAAUACCCC
hsa - mir - 223 UGUCAGUUUGUCAAAUACCCC
miR-23 1945年 1952年 1、m8 hsa-miR-23a大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
hsa-miR-23b大脑 AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
miR-27 975年 981年 1 hsa-miR-27a大脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
hsa-miR-27b大脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC
miR-30-3p 377年 383年 m8 hsa-miR-30a-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC
hsa-miR-30e-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC
mir - 323 1945年 1951年 1 hsa - mir - 323大脑 GCACAUUACACGGUCGACCUCU
mir - 329 1677年 1683年 m8 hsa - mir - 329大脑 AACACACCUGGUUAACCUCUUU
mir - 330 875年 881年 m8 hsa - mir - 330大脑 GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA
mir - 362 1158年 1164年 1 hsa - mir - 362 AAUCCUUGGAACCUAGGUGUGAGU
mir - 376 c 1787年 1793年 m8 hsa - mir - 376 c AACAUAGAGGAAAUUCCACG
mir - 381 836年 842年 1 hsa - mir - 381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
hsa - mir - 381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir - 410 942年 948年 1 hsa - mir - 410 AAUAUAACACAGAUGGCCUGU
mir - 448 79年 85年 m8 hsa - mir - 448 UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU
hsa - mir - 448 UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU
mir - 493 - 5 - p 677年 683年 m8 hsa - mir - 493 - 5 - p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
hsa - mir - 493 - 5 - p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
hsa - mir - 493 - 5 - p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
mir - 496 330年 337年 1、m8 hsa - mir - 496 AUUACAUGGCCAAUCUC
mir - 505 1663年 1669年 1 hsa - mir - 505 GUCAACACUUGCUGGUUUCCUC
mir - 539 2091年 2097年 1 hsa - mir - 539 GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU
米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 200年 206年 m8 hsa - mir - 93大脑 AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG
hsa - mir - 302 a UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA
hsa - mir - 302 b UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG
hsa - mir - 302 c UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
hsa - mir - 302 d UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU
hsa - mir - 372 AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU
hsa - mir - 373 GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU
hsa - mir - 520 e AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
hsa - mir - 520 a AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU
hsa - mir - 520 b AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG
hsa - mir - 520 c AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU
hsa - mir - 520 d AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU
mir - 96 356年 362年 1 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC