基因页：arvcf

概括？
基因 421
象征 arvcf
同义词 -
描述 在速食性综合征中删除的armadillo重复基因
参考 MIM：602269|HGNC：HGNC：728|Ensembl：ENSG0000000099889|HPRD：03778|Vega：Otthumg00000030426
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22Q11.21
Pascal P值 0.053
Sherlock P值 0.465
胎儿β 0.513
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
元
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV：是的 拷贝数变异研究 手动策划
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 2 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.031
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 arvcf 421 1.015E-10 反式
RS7584986 CHR2 184111432 arvcf 421 0.03 反式
RS17762315 CHR5 76807576 arvcf 421 0.13 反式
RS16955618 CHR15 29937543 arvcf 421 4.513E-8 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005488 捆绑 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0005198 结构分子活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007155 细胞粘附 塔斯 9126485
去：0007275 多细胞生物发育 塔斯 9126485
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005622 细胞内 塔斯 9126485

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Doane对雄激素DN的反应 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP53和MYC DN的CEBALLOS目标 38 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark Hyppocampus 22Q11缺失DN 20 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌遗传与零星 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bredemeyer抹布信令不是通过ATM DN 57 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C 47 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应中间 98 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-155 777 784 1A，M8 HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-214 733 739 M8 HSA-MIR-214脑 acagcaggcacagacaggcag
mir-223 219 225 1a HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-29 226 232 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu