基因页：MEIS1

Summary？
基因 4211
象征 MEIS1
Synonyms -
Description Meis homeobox 1
Reference MIM：601739|HGNC：HGNC：7000|Ensembl：ENSG00000143995|HPRD：03442|Vega：Otthumg00000150714
基因类型 蛋白质编码
Map location 2P14
Pascal p-value 0.02
Sherlock p-value 0.165
胎儿β 2.852
DMG 1 (# studies)
主持人 尾状基底神经节
Myers' cis & trans

Gene in Data Sources
基因集名称 Method of gene set Description 信息
CV:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 5
PMID：cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

Probe 染色体 位置 最近的基因 p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
cg06796713 2 66664871 MEIS1 4.52E-6 -0.699 0.01 DMG：Wockner_2014
cg06994420 2 66672553 MEIS1 8.31E-6 0.427 0.013 DMG：Wockner_2014
CG03589296 2 66666292 MEIS1 1.03E-4 -0.38 0.028 DMG：Wockner_2014
cg00995986 2 66665428 MEIS1 1.08E-4 -0.629 0.028 DMG：Wockner_2014
cg12082609 2 66671727 MEIS1 5.584e-4 0.497 0.049 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17392743 CHR1 54764240 MEIS1 4211 0.13 反式
rs12405921 CHR1 206695730 MEIS1 4211 0.15 反式
RS17572651 CHR1 218943612 MEIS1 4211 5.194E-4 反式
RS16829545 CHR2 151977407 MEIS1 4211 9.03E-14 反式
rs3845734 CHR2 171125572 MEIS1 4211 0.02 反式
RS7584986 CHR2 184111432 MEIS1 4211 4.342E-8 反式
RS17762315 CHR5 76807576 MEIS1 4211 0.11 反式
RS3118341 Chr9 25185518 MEIS1 4211 0.03 反式
rs11139334 Chr9 84209393 MEIS1 4211 0.02 反式
RS2393316 Chr10 59333070 MEIS1 4211 5.253E-4 反式
rs16955618 CHR15 29937543 MEIS1 4211 1.143E-23 反式
RS3790307 CHR20 17652571 MEIS1 4211 0.18 反式
RS1041786 CHR21 22617710 MEIS1 4211 0.01 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
Gene 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GTPBP4 0.95 0.94
我知道 0.93 0.95
NCL 0.93 0.95
SNW1 0.93 0.95
ZNF830 0.93 0.93
htatsf1 0.93 0.93
fip1l1 0.92 0.93
OS9 0.92 0.93
RIOK1 0.92 0.93
Ctr9 0.92 0.93
前10个负共表达基因
Gene 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.77 -0.83
MT-CO2 -0.77 -0.82
FXYD1 -0.76 -0.83
ifi27 -0.75 -0.84
AF347015.33 -0.74 -0.80
AF347015.27 -0.73 -0.80
HIGD1B -0.73 -0.81
HLA-F -0.72 -0.78
mt-cyb -0.72 -0.78
AF347015.8 -0.71 -0.79

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
HOXA10 HOX1 |HOX1.8 |HOX1H |MGC12859 |pl Homeobox A10 - HPRD 9343407
Hoxa7 antp |HOX1 |HOX1.1 |HOX1A Homeobox A7 - HPRD 9405651
Hoxa9 ABD-B |HOX1 |HOX1.7 |Hox1g |MGC1934 Homeobox A9 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物		 Biogrid 9343407|10082572
HOXB1 HOX2 |Hox2i |HOX-2.9 |MGC116843 |MGC116844 |MGC116845 Homeobox B1 - HPRD,BioGRID 10373562
HOXB13 PSGD Homeobox B13 - HPRD 9343407
HOXD11 HOX4 |HOX4F Homeobox D11 - HPRD 9343407
HOXD12 HOX4H HONEOBOX D12 - HPRD 9343407
HOXD9 HOX4 |HOX4C |HOX-4.3 |HOX-5.2 HONEOBOX D9 重构的复合物 Biogrid 10523646
PBX1 DKFZp686B09108 | MGC126627 前B细胞白血病HONEOBOX 1 重构的复合物 Biogrid 10082572|10523646
PBX2 G17 | HOX12 | PBX2MHC 前B细胞白血病HONEOBOX 2 - HPRD 10082572
PBX3 - 前B细胞白血病HONEOBOX 3 - HPRD 15466398


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
PYEON HPV阳性肿瘤 98 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
刘前列腺癌DN 481 290 All SZGR 2.0 genes in this pathway
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BASAKI YBX1 TARGETS DN 384 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Slebos头和颈癌与HPV 84 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS BLUE DN 61 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 3D UP 182 110 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MULLIGHAN NPM1 MUTATED SIGNATURE 2 UP 139 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MULLIGHAN MLL签名1 UP 380 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MULLIGHAN MLL签名2UP 418 263 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1签名3 341 197 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION GRANULOCYTE UP 55 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向DN 260 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jaatinen造血干细胞向上 316 190 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA UP 1821年 933 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindgren膀胱癌簇3 DN 229 142 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tomlins前列腺癌DN 40 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER SOX9 TARGETS IN PROSTATE DEVELOPMENT DN 45 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 79 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang由Hoxa9和Meis1 DN永生 24 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NPM1本地化的Alcalay AML 140 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
公园HSC标记 44 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VERHAAK AML WITH NPM1 MUTATED UP 183 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GEISS RESPONSE TO DSRNA DN 16 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2向上 428 266 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 All SZGR 2.0 genes in this pathway
dazard UV响应集群G6 153 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JI对FSH的响应 74 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 3 720 440 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR UP 430 288 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞向上 260 174 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ruiz TNC目标 153 107 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗斯白血病与MLL融合 78 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌Kras DN 435 289 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Valk AML群集15 31 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML带8 21易位 368 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML WITH T 9 11 TRANSLOCATION 130 87 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML WITH 11Q23 REARRANGED 351 238 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MEF ICP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 38 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 126 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 193 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束 1103 714 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄成人组织茎模块 721 492 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VERHAAK GLIOBLASTOMA CLASSICAL 162 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gabriely miR21靶标 289 187 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DN WIERENGA STAT5A目标 213 127 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RAO BOUND BY SALL4 ISOFORM B 517 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lim乳腺腔内成熟 116 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 All SZGR 2.0 genes in this pathway