SZGR2 - Beplay体育中心

概括？

GeneID	4217
象征	MAP3K5
Synonyms	ask1 \| mapkkk5 \| mekk5
Description	有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶5
Reference	MIM：602448\|HGNC:HGNC:6857\|Ensembl：ENSG00000197442\|HPRD：03904\|Vega:OTTHUMG00000015647
基因类型	蛋白质编码
Map location	6q22.33
Pascal p-value	0.383
Sherlock p-value	0.444
胎儿β	-2.716
DMG	1(# studies)
主持人	Myers' cis & trans
Support	Ascano FMRP targets

数据源中的基因

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
CV:PGCnp	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG：JAFFE_2016	全基因组DNA甲基化分析	This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05.	1
Network	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	PPI网络中最短路径的贡献：0.139

第一节遗传学和表观遗传学注释

Differentially methylated gene

Probe	染色体	位置	Nearest gene	p（dis）	Beta (dis)	fdr（dis）	学习
CG07868909	6	137114217	MAP3K5	2.02E-9	-0.038	1.64E-6	DMG：JAFFE_2016

eQTL annotation

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	pvalue	QVALUE	TSS距离	EQTL类型
RS17034560	CHR1	10229157	MAP3K5	4217		0.08		反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

Top 10 positively co-expressed genes
Gene	Pearson's Correlation	Spearman's Correlation
Gli2	0.89	0.51
KIFC1	0.87	0.49
FOXM1	0.87	0.51
IQGAP3	0.87	0.42
Notch1	0.87	0.53
CDT1	0.86	0.52
PLK1	0.86	0.45
CDC20	0.86	0.56
KIF18B	0.85	0.51
mybl2	0.85	0.48

Top 10 negatively co-expressed genes
Gene	Pearson's Correlation	Spearman's Correlation
C5orf53	-0.27	-0.36
CCNI2	-0.27	-0.34
Rapgef4	-0.26	-0.35
serpini1	-0.26	-0.33
CKMT1A	-0.25	-0.33
NPM2	-0.25	-0.31
CKMT1B	-0.25	-0.27
OSBPL1A	-0.25	-0.33
AF347015.27	-0.25	-0.33
chn1	-0.24	-0.30

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0000166	nucleotide binding	IEA		-
去：0000287	magnesium ion binding	IDA		17210579
去：0005524	ATP binding	IDA		17210579
去：0004674	蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性	IEA		-
GO:0004709	MAP激酶激酶激酶活性	IDA		17210579
GO:0008656	caspase activator activity	IDA		14761963
GO：0016740	转移酶活性	IEA		-
GO：0042803	蛋白质同构化活性	IDA		11920685
Biological process	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0000165	MAPKKK cascade	IDA		17210579
去：0006468	protein amino acid phosphorylation	IEA		-
GO:0007257	activation of JNK activity	TAS		8974401
GO:0006915	凋亡	IEA		-
去：0008624	induction of apoptosis by extracellular signals	TAS		8974401
GO:0044419	interspecies interaction between organisms	IEA		-

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	官方全名b	实验	资源	PubMed ID
ARRB2	ARB2 \| ARR2 \| BARR2 \| DKFZp686L0365	arrestin, beta 2	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	11090355
ARRB2	ARB2 \| ARR2 \| BARR2 \| DKFZp686L0365	arrestin, beta 2	-	HPRD	11356842
cdc25a	CDC25A2	cell division cycle 25 homolog A (S. pombe)	-	HPRD,BioGRID	11416155
CDKN1A	CAP20 \|CDKN1 \|CIP1 \|MDA-6 \|p21 \|SDI1 \|WAF1 \|P21CIP1	细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1a（P21，CIP1）	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12820963
dab2ip	AF9Q34 \|AIP1 \|DIP1/2 \|FLJ39072 \|KIAA1743	DAB2 interacting protein	-	HPRD	12813029
daxx	Bing2 \|DAP6 \|EAP1 \|MGC126245 \|MGC126246	death-domain associated protein	-	HPRD,BioGRID	9743501
DUSP19	dusp17 \|lmwdsp3 \|MGC138210 \|SKRP1 \|TS-DSP1	dual specificity phosphatase 19	-	HPRD,BioGRID	11959862
EIF2AK2	EIF2AK1 \|MGC126524 \|PKR \|prkr	真核翻译起始因子2-α激酶2	-	HPRD,BioGRID	12473108
ERN1	FLJ30999 \|IRE1 \|IRE1P \|MGC163277 \|MGC163279	内质网核信号1	-	HPRD,BioGRID	12050113
GADD45B	DKFZP566B133 \|gadd45beta \|myd118	growth arrest and DNA-damage-inducible, beta	亲和力捕获 - 韦斯特恩重构的复合物	Biogrid	14743220
Glrx	grx \|grx1 \|MGC117407	谷毒素（硫醇转移酶）	GLRX（GRX）与MAP3K5（ask1）相互作用。	绑定	12244106
Glrx	grx \|grx1 \|MGC117407	谷毒素（硫醇转移酶）	-	HPRD,BioGRID	12244106
GSTM1	GST1 \| GSTM1-1 \| GSTM1a-1a \| GSTM1b-1b \| GTH4 \| GTM1 \| H-B \| MGC26563 \| MU \| MU-1	谷胱甘肽S-转移酶MU 1	-	HPRD,BioGRID	11278289\|12077134
HSPA1A	FLJ54303 \| FLJ54370 \| FLJ54392 \| FLJ54408 \| FLJ75127 \| HSP70-1 \| HSP70-1A \| HSP70I \| HSP72 \| HSPA1 \| HSPA1B	heat shock 70kDa protein 1A	-	HPRD,BioGRID	12391142
MAP2K6	MAPKK6 \|mek6 \|MKK6 \|prkmk6 \|SAPKK3	mitogen-activated protein kinase kinase 6	生化活动重构的复合物	Biogrid	11689443\|12820963
MAP2K6	MAPKK6 \|mek6 \|MKK6 \|prkmk6 \|SAPKK3	mitogen-activated protein kinase kinase 6	MKK6与Ask1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类MKK6和ask1之间的相互作用进行建模的。	绑定	15866172
MAP2K7	jnkk2 \|MAPKK7 \|MKK7 \|prkmk7	mitogen-activated protein kinase kinase 7	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	11959862
MAP3K2	mekk2 \|mekk2b	有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶2	-	HPRD	12912994
MAP3K5	Ask1 \|MAPKKK5 \|mekk5	有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶5	-	HPRD,BioGRID	11920685
MAP3K6	ASK2 \| MAPKKK6 \| MGC125653 \| MGC20114	有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶6	-	HPRD,BioGRID	9875215
MAP3K7	TAK1 \| TGF1a	有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶7	-	HPRD,BioGRID	10921914
MAPK8IP3	DKFZp762N1113 \| FLJ00027 \| JIP3 \| JSAP1 \| KIAA1066 \| SYD2	有丝分裂原激活的蛋白激酶8相互作用蛋白3	-	HPRD,BioGRID	12189133
MLL	all-1 \|CXXC7 \|FLJ11783 \|HRX \|htrx1 \|KMT2A \|MLL/GAS7 \|mll1a \|tet1-mll \|TRX1	myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila)	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	14607843
PDCD6	ALG-2 \| FLJ46208 \| MGC111017 \| MGC119050 \| MGC9123 \| PEF1B	程序性细胞死亡6	-	HPRD,BioGRID	12372597
PPP5C	FLJ36922 \| PP5 \| PPP5	protein phosphatase 5, catalytic subunit	-	HPRD,BioGRID	11689443
QARS	Glnrs \|Pro2195	谷氨酰胺基-TRNA合成酶	-	HPRD,BioGRID	11096076
RAF1	克拉夫\|NS5 \|RAF-1 \|C-Raf	v-raf-1 murine leukemia viral oncogene homolog 1	-	HPRD,BioGRID	11427728
RB1CC1	CC1 \| DRAGOU14 \| FIP200	RB1-inducible coiled-coil 1	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	17015619
traf1	EBI6 \|MGC：10353	TNF receptor-associated factor 1	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	9774977
traf2	MGC：45012 \|陷阱\|陷阱3	TNF receptor-associated factor 2	-	HPRD,BioGRID	9774977\|10523862
traf3	CAP-1 \|CD40BP \|craf1 \|LAP1	TNF receptor-associated factor 3	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	9774977
traf5	MGC:39780 \| RNF84	TNF receptor-associated factor 5	-	HPRD,BioGRID	10523862
traf6	MGC:3310 \| RNF85	TNF receptor-associated factor 6	-	HPRD,BioGRID	10523862
TXN	DKFZP686B1993 \|MGC61975 \|trx \|TRX1	硫氧还蛋白	亲和力捕获 - 韦斯特恩重构的复合物两个杂交	Biogrid	9564042\|11689443 \|12089063
TXN	DKFZP686B1993 \|MGC61975 \|trx \|TRX1	硫氧还蛋白	TXN（TRX）与MAP3K5（ask1）相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类TXN和MAP3K5之间的相互作用进行建模的。	绑定	12244106
TXN	DKFZP686B1993 \|MGC61975 \|trx \|TRX1	硫氧还蛋白	-	HPRD	9564042\|12089063
ywhaz	KCIP-1 \|MGC111427 \|MGC126532 \|MGC138156	tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta polypeptide	-	HPRD,BioGRID	10411906\|11336675

V.途径注释

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
kegg mapk信号通路	267	205	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NEUROTROPHIN SIGNALING PATHWAY	126	103	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS ALS	53	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Hivnef途径	58	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物质体角质形成细胞途径	46	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MAPK PATHWAY	87	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta P38MAPK途径	40	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA 41BB PATHWAY	17	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST P38 MAPK PATHWAY	37	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST GA13 PATHWAY	37	32	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST JNK MAPK PATHWAY	40	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST FAS SIGNALING PATHWAY	65	54	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P38 MKK3 6PATHWAY	26	21	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TNF途径	46	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIV NEF途径	35	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3KCI AKT PATHWAY	35	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARENT MTOR SIGNALING UP	567	375	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标	255	177	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS UP	579	346	该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病	1382	904	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEURIG T CELL PROLYMPHOCYTIC LEUKEMIA DN	320	184	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN NPM1 MUTATED SIGNATURE 1 UP	276	165	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3	341	197	该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN	805	505	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN	485	334	该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌	443	294	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANHARANTA UTERINE FIBROID DN	67	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN	1781	1082	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS LUMINAL	326	213	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLOSSER SERUM RESPONSE DN	712	443	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN	637	377	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH EED TARGETS	1062	725	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS	775	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF DN的响应	103	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
STANELLE E2F1 TARGETS	29	20	该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu IL4信号传导	94	56	该途径中的所有SZGR 2.0基因
THEILGAARD NEUTROPHIL AT SKIN WOUND DN	225	163	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR DN	101	70	该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老	262	186	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN	261	183	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应	318	220	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAZARD UV RESPONSE CLUSTER G6	153	112	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时DN	101	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定	491	310	该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激	1022	619	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标胸腺	196	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向	673	430	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS DN	593	372	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN	591	366	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION DN	154	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN	270	181	该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先	430	288	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING	510	309	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE UP	126	92	该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯白血病与MLL融合	78	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌拷贝编号DN	238	145	该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 DN	170	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞向上	47	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞DN	76	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合	67	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai慢性肝炎与肝癌	83	63	该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN	267	160	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO HEPATOBLASTOMA CLASSES DN	210	141	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN	56	39	该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束	1103	714	该途径中的所有SZGR 2.0基因
萨森对促性腺营养蛋白的反应	91	59	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin的反应	90	58	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转换签名	242	159	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN	505	328	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS DN	1972	1213	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1不是通过AKT1 DN的目标	88	61	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delpuech FOXO3靶向	68	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN	1080	713	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移1	46	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG MLL TARGETS	289	188	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BMP7的Zhang脂肪形成	14	12	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAO BOUND BY SALL4 ISOFORM B	517	302	该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

mirna家族	Target position			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
miR-145	368	374	1A	HSA-MIR-145	guccaguuucccaggaaucccuu
miR-17-5p/20/93.mr/106/519.d	98	105	1A，M8	hsa-miR-17-5p	CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
				hsa-miR-20a^brain	uaaagugcuuauagugcagguag
				hsa-miR-106a	AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC
				hsa-miR-106b^SZ	UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
				hsa-miR-20b^SZ	CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
				HSA-MIR-519D	caaagugccucccuuuagugugu
miR-199	367	373	1A	HSA-MIR-199A	CCCAGUGUUCAGACUACCUGUUC
miR-199	367	373	1A	HSA-MIR-199B	cccaguguuuagacuaucuuc
miR-23	384	390	M8	HSA-MIR-23A^brain	aucacauugccagggauucc
miR-23	384	390	M8	HSA-MIR-23B^brain	AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
mir-30-5p	117	123	M8	hsa-miR-30a-5p	UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
				hsa-miR-30c^brain	uguaaacauccuacucucucucucagc
				hsa-miR-30d^SZ	uguaaacauccccgacuggaag
				hsa-miR-30b^SZ	uguaaacauccuaccucucagcu
				hsa-miR-30e-5p	UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir-323	384	390	1A	HSA-MIR-323^brain	GCACAUUACACGGUCGACCUCU
mir-375	372	378	1A	HSA-MIR-375	UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击这里to see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击这里查看与大脑相关的miRNA列表。

Gene Page:MAP3K5