Gene Page:MGP

概括?
基因 4256
Symbol MGP
Synonyms GIG36|MGLAP|NTI
Description matrix Gla protein
Reference MIM:154870|HGNC:HGNC:7060|Ensembl:ENSG00000111341|HPRD:01112|Vega:OTTHUMG00000168740
Gene type protein-coding
Map location 12p12.3
Pascal p-value 0.427
Fetal beta -2.657
eGene Myers' cis & trans

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
PMID:cooccur High-throughput literature-search 系统搜索PubMed co-occ基因urring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias Click to show details

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs2922180 chr3 125280472 MGP 4256 2.388E-4 trans
rs2976809 chr3 125451738 MGP 4256 0.15 trans
rs16894149 chr5 61013724 MGP 4256 0.08 trans
rs11954814 chr5 155088338 MGP 4256 0.05 trans
rs283058 chr6 118625224 MGP 4256 0.1 trans
rs2199402 chr8 9201002 MGP 4256 0.07 trans
rs7841407 chr8 9243427 MGP 4256 0.01 trans
rs16881829 chr8 34072296 MGP 4256 0.16 trans
rs10879027 chr12 70237156 MGP 4256 0.12 trans
rs4942043 chr13 41978218 MGP 4256 0.16 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
CTBP2 0.90 0.86
UNG 0.86 0.77
SMARCC1 0.86 0.84
F2R 0.86 0.85
PRKX 0.85 0.83
SMAD4 0.85 0.86
G3BP1 0.85 0.85
BARD1 0.84 0.83
CDON 0.84 0.84
MCL1 0.84 0.86
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
C5orf53 -0.53 -0.69
HLA-F -0.49 -0.62
SLC9A3R2 -0.49 -0.40
TNFSF12 -0.49 -0.51
AF347015.31 -0.49 -0.76
PTH1R -0.49 -0.59
SLC16A11 -0.49 -0.51
IFI27 -0.49 -0.74
AIFM3 -0.49 -0.61
FBXO2 -0.49 -0.53

Section V. Pathway annotation

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
PID FRA PATHWAY 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Korkola Teratoma Up 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST DUCTAL CARCINOMA VS DUCTAL NORMAL DN 198 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST DUCTAL CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL DN 69 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST LOBULAR CARCINOMA VS DUCTAL NORMAL DN 91 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WILCOX RESPONSE TO PROGESTERONE DN 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE RESPONSE TO ANDROGEN DN 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION DN 329 219 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELYS THYROID CANCER DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION KRAS CDC25 DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION CDC25 UP 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASTELLANO NRAS TARGETS UP 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA FOREVER DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN RESPONSE TO ARSENIC TRIOXIDE 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APPIERTO RESPONSE TO FENRETINIDE UP 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER HIGH RECURRENCE 49 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AIYAR COBRA1 TARGETS UP 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KORKOLA TERATOMA 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
korkola蛋黄囊肿瘤 62 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HEIDENBLAD AMPLICON 12P11 12 UP 33 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON GENOTOXIC SIGNATURE 105 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
INGRAM SHH TARGETS UP 127 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN METASTASIS UP 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时 176 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POMEROY MEDULLOBLASTOMA DESMOPLASIC VS CLASSIC DN 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WESTON VEGFA TARGETS 6HR 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿·维加法（Weston Vegfa）目标12小时 35 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIMBULAN PARP1 TARGETS UP 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUNINGER IGF1 VS PDGFB TARGETS DN 46 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WESTON VEGFA TARGETS 108 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 UP 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEEN RESPONSE TO ROSIGLITAZONE DN 106 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 0HR 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABE INNER EAR 48 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向 113 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG CISPLATIN RESPONSE AND XPC UP 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS UP 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WESTON VEGFA TARGETS 3HR 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tseng成脂潜力 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES UP 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HARRIS BRAIN CANCER PROGENITORS 44 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEIN CHOROID PLEXUS MARKERS 103 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG LSD1 TARGETS UP 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE METASTASIS AND ALTERNATIVE SPLICING UP 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASRI RESISTANCE TO TAMOXIFEN AND AROMATASE INHIBITORS UP 20 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER UP 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌，H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL UP 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHRAETS MLL TARGETS DN 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POOLA INVASIVE BREAST CANCER DN 134 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G1 UP 113 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOO LIVER CANCER RECURRENCE UP 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG REGULATED BY MYC DN 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村脂肪形成晚期 104 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP B 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM GLIS2 TARGETS UP 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 6 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG MLL TARGETS 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
因宗乳腺干细胞向上 146 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM GLYCOPROTEINS 196 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA CORE MATRISOME 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA MATRISOME 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因