基因页：ASCL1

概括？
基因 429
象征 ASCL1
同义词 ash1 | hash1 | mash1 | bhlha46
描述 Achaete-Scute家族BHLH转录因子1
参考 MIM：100790|HGNC：HGNC：738|ENSEMBL：ENSG00000139352|HPRD：00011|Vega：Otthumg00000169967
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12q23.2
Pascal P值 0.004
胎儿β 0.91

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：7

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NT5DC2 0.90 0.83
SIRT6 0.90 0.90
miip 0.90 0.87
actl6b 0.90 0.90
SHF 0.90 0.86
DCAF15 0.90 0.86
FAM110A 0.89 0.86
ZNF821 0.89 0.90
AGBL5 0.89 0.89
DOK4 0.89 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.72 -0.76
AF347015.27 -0.71 -0.85
AF347015.31 -0.69 -0.83
MT-CO2 -0.69 -0.84
AF347015.33 -0.69 -0.83
mt-cyb -0.68 -0.84
AIFM3 -0.67 -0.68
S100B -0.67 -0.75
C5orf53 -0.67 -0.65
AF347015.8 -0.67 -0.85

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003700 转录因子活性 nas 8390674
去：0005515 蛋白质结合 IPI 10903890
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0060165 调节基柱神经元分化的时间 IEA 神经元（GO期限：11） -
GO：0060163 基础神经元命运承诺 IEA 神经元（GO期限：11） -
去：0007405 神经细胞增殖 IEA 神经元（GO期限：8） -
去：0001764 神经元迁移 IEA 神经元（GO期限：8） -
GO：0048666 神经元发展 IEA 神经元（GO期限：9） -
去：0010001 神经胶质细胞分化 IEA 神经胶质（GO期限：8） -
去：0007399 神经系统的发展 IEA 神经突（GO期限：5） -
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0007219 Notch信号通路 IEA -
去：0007400 神经细胞的命运确定 IEA -
去：0007389 模式规范过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
pid his hey pathway 48 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗雷索莫昔芬反应 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应FIMA DN 284 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧素DN的浓凋亡 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB靶向1个 118 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB目标 74 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼中的Smid乳腺癌复发 97 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔内B 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-22 1020 1026 1a HSA-MIR-22脑 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-369-3p 669 675 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 669 676 1A，M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-375 1007 1013 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
mir-493-5p 771 777 1a HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-496 811 817 M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc