基因页:疼痛
概括?
基因 | 43 |
象征 | 疼痛 |
同义词 | acee | arache | n-ache | yt |
描述 | 乙酰胆碱酯酶(YT血型) |
参考 | MIM:100740|HGNC:HGNC:108|Ensembl:ENSG00000087085|HPRD:00010|Vega:Otthumg00000157033 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q22 |
Pascal P值 | 4.263E-4 |
Sherlock P值 | 0.341 |
胎儿β | -1.183 |
DMG | 2(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:5 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG08560942 | 7 | 100492945 | 疼痛 | -0.016 | 0.91 | DMG:Nishioka_2013 | |
CG27220968 | 7 | 100493724 | 疼痛 | 1.02E-9 | -0.013 | 1.18e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ACHE_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0017171 | 丝氨酸水解酶活性 | 艾达 | 谷氨酸(GO期限:4) | 3954986 |
GO:0042166 | 乙酰胆碱结合 | nas | 突触,神经递质(GO术语级别:4) | 1517212 |
去:0001540 | β-淀粉样蛋白结合 | 塔斯 | 11283752 | |
去:0003990 | 乙酰胆碱酯酶活性 | 小鬼 | 1517212 | |
去:0004104 | 胆碱酯酶活性 | 艾达 | 1517212 | |
去:0004104 | 胆碱酯酶活性 | IEA | - | |
去:0005518 | 胶原蛋白结合 | 艾达 | 12524166 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
GO:0042803 | 蛋白质同构化活性 | nas | 1517212 | |
GO:0043237 | 层粘连蛋白1结合 | 艾达 | 12524166 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007416 | 突触发生 | 塔斯 | 突触(GO期限:6) | 11283752 |
GO:0032223 | 突触传播,胆碱能的负调节 | 我知道了 | 神经元,胆碱能,突触,神经递质(GO期限:9) | 1517212 |
去:0001507 | 突触裂口中的乙酰胆碱分解代谢过程 | nas | 胆碱能,突触(GO期限:11) | 1517212 |
去:0002076 | 成骨细胞开发 | IEP | 15454088 | |
去:0007155 | 细胞粘附 | 塔斯 | 11283752 | |
去:0006260 | 基因复制 | 塔斯 | 11283752 | |
去:0008283 | 细胞增殖 | 塔斯 | 11283752 | |
去:0009611 | 对伤害的反应 | 塔斯 | 11283752 | |
去:0007517 | 肌肉发育 | 塔斯 | 11283752 | |
GO:0042982 | 淀粉样前体蛋白代谢过程 | 塔斯 | 12769797 | |
GO:0050714 | 蛋白质分泌的阳性调节 | 塔斯 | 11283752 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0045202 | 突触 | 艾达 | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | 8460160 |
去:0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 15454088 | |
去:0005576 | 细胞外区域 | 塔斯 | 11283752 | |
去:0005605 | 基底薄片 | nas | 16289501 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0048471 | 细胞质的核周区 | 艾达 | 14766237 | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - | |
GO:0031225 | 锚定在膜上 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG甘油磷脂代谢 | 77 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ATF2途径 | 59 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PC的Reactome合成 | 18 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组甘油磷脂生物合成 | 82 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
动摇对雄激素DN的反应 | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 | 207 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ropero HDAC2目标 | 114 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sakai慢性肝炎与肝癌DN | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori小型Bii淋巴细胞UP | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
考夫曼DNA复制基因 | 147 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康(Kang)由tert dn永生 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
su唾液腺 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo卡路里限制肌肉DN | 87 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江是衰老下丘脑DN | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee老化小脑DN | 86 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SYED雌二醇反应 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-28 | 673 | 680 | 1A,M8 | HSA-MIR-28脑 | Aaggagcucacagucuauugag |
mir-370 | 719 | 725 | 1a | HSA-MIR-370脑 | gccugggggguggaaccugg |
mir-503 | 727 | 733 | M8 | HSA-MIR-503 | uagcagcgggaacaguucugcag |