概括
基因 43
象征 疼痛
同义词 acee | arache | n-ache | yt
描述 乙酰胆碱酯酶(YT血型)
参考 MIM:100740|HGNC:HGNC:108|Ensembl:ENSG00000087085|HPRD:00010|Vega:Otthumg00000157033
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q22
Pascal P值 4.263E-4
Sherlock P值 0.341
胎儿β -1.183
DMG 2(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:5

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08560942 7 100492945 疼痛 -0.016 0.91 DMG:Nishioka_2013
CG27220968 7 100493724 疼痛 1.02E-9 -0.013 1.18e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0017171 丝氨酸水解酶活性 艾达 谷氨酸(GO期限:4) 3954986
GO:0042166 乙酰胆碱结合 nas 突触,神经递质(GO术语级别:4) 1517212
去:0001540 β-淀粉样蛋白结合 塔斯 11283752
去:0003990 乙酰胆碱酯酶活性 小鬼 1517212
去:0004104 胆碱酯酶活性 艾达 1517212
去:0004104 胆碱酯酶活性 IEA -
去:0005518 胶原蛋白结合 艾达 12524166
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
GO:0042803 蛋白质同构化活性 nas 1517212
GO:0043237 层粘连蛋白1结合 艾达 12524166
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007416 突触发生 塔斯 突触(GO期限:6) 11283752
GO:0032223 突触传播,胆碱能的负调节 我知道了 神经元,胆碱能,突触,神经递质(GO期限:9) 1517212
去:0001507 突触裂口中的乙酰胆碱分解代谢过程 nas 胆碱能,突触(GO期限:11) 1517212
去:0002076 成骨细胞开发 IEP 15454088
去:0007155 细胞粘附 塔斯 11283752
去:0006260 基因复制 塔斯 11283752
去:0008283 细胞增殖 塔斯 11283752
去:0009611 对伤害的反应 塔斯 11283752
去:0007517 肌肉发育 塔斯 11283752
GO:0042982 淀粉样前体蛋白代谢过程 塔斯 12769797
GO:0050714 蛋白质分泌的阳性调节 塔斯 11283752
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0045202 突触 艾达 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) 8460160
去:0005794 高尔基体 艾达 15454088
去:0005576 细胞外区域 塔斯 11283752
去:0005605 基底薄片 nas 16289501
去:0016020 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0048471 细胞质的核周区 艾达 14766237
GO:0030054 细胞连接 IEA -
GO:0031225 锚定在膜上 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG甘油磷脂代谢 77 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ATF2途径 59 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PC的Reactome合成 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油磷脂生物合成 82 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
动摇对雄激素DN的反应 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ropero HDAC2目标 114 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai慢性肝炎与肝癌DN 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型Bii淋巴细胞UP 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
考夫曼DNA复制基因 147 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康(Kang)由tert dn永生 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
su唾液腺 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo卡路里限制肌肉DN 87 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江是衰老下丘脑DN 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化小脑DN 86 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1目标 90 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1B目标 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 102 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SYED雌二醇反应 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-28 673 680 1A,M8 HSA-MIR-28 Aaggagcucacagucuauugag
mir-370 719 725 1a HSA-MIR-370 gccugggggguggaaccugg
mir-503 727 733 M8 HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag