基因页：TRPM1
概括？
| 基因 | 4308 |
| 象征 | TRPM1 |
| 同义词 | CSNB1C | LTRPC1 | MLSN1 |
| 描述 | 瞬态受体电势阳离子通道亚家族M成员1 |
| 参考 | MIM：603576|HGNC：HGNC：7146|ENSEMBL：ENSG00000134160|HPRD：04656|Vega：Otthumg00000129267 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q13.3 |
| Pascal P值 | 0.04 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 梭子基底神经节 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CNV：是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| TRPM1 | CHR15 | 31327796 | t | 一个 | NM_001252020 NM_001252024 NM_002420 |
p.902i> f p.885i> f p.863i> f |
错过 错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11070808 | 15 | 31390533 | TRPM1 | ENSG00000134160.9 | 9.15446e-10 | 0 | 62943 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10851488 | 15 | 31392375 | TRPM1 | ENSG00000134160.9 | 3.11146E-9 | 0 | 61101 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10851489 | 15 | 31392436 | TRPM1 | ENSG00000134160.9 | 2.90923E-7 | 0 | 61040 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS6493454 | 15 | 31393945 | TRPM1 | ENSG00000134160.9 | 8.61323E-10 | 0 | 59531 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3809579 | 15 | 31394322 | TRPM1 | ENSG00000134160.9 | 1.48303E-11 | 0 | 59154 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS4779820 | 15 | 31394810 | TRPM1 | ENSG00000134160.9 | 2.64185E-10 | 0 | 58666 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7182946 | 15 | 31394868 | TRPM1 | ENSG00000134160.9 | 8.13879E-10 | 0 | 58608 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 | 229 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 铃木对TSA和Decitabine 1B的反应 | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McGowan RSP6靶向 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠与直肠癌DN | 56 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES HCP与H3未甲基化 | 63 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |