Gene Page:MMP1

概括?
基因 4312
象征 MMP1
Synonyms CLG|CLGN
Description matrix metallopeptidase 1
Reference MIM:120353|HGNC:HGNC:7155|Ensembl:ENSG00000196611|HPRD:00384|Vega:OTTHUMG00000048192
Gene type protein-coding
Map location 11q22.3
Pascal p-value 0.7

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
PMID:cooccur High-throughput literature-search Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
SELT 0.86 0.86
RWDD2B 0.86 0.86
MDH1 0.85 0.90
TMEM111 0.85 0.88
CISD1 0.85 0.88
HPRT1 0.84 0.88
MKKS 0.84 0.83
C9orf95 0.83 0.79
KRT222P 0.83 0.88
UBXN8 0.83 0.84
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
SMTN -0.49 -0.55
FAM59B -0.43 -0.44
SH3BP2 -0.42 -0.49
AC010300.1 -0.42 -0.43
AF347015.18 -0.42 -0.20
SH2D2A -0.42 -0.47
CDC42EP4 -0.41 -0.44
SEMA4B -0.41 -0.42
GLIS2 -0.40 -0.43
C10orf108 -0.40 -0.39

V.途径注释

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG PPAR SIGNALING PATHWAY 69 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHWAYS IN CANCER 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG BLADDER CANCER 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ENDOTHELIN PATHWAY 63 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FRA PATHWAY 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid reg gr途径 82 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AP1 PATHWAY 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SYNDECAN 1 PATHWAY 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DEGRADATION OF THE EXTRACELLULAR MATRIX 29 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME EXTRACELLULAR MATRIX ORGANIZATION 87 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL 91 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME BASIGIN INTERACTIONS 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DIABETES PATHWAYS 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF INSULIN LIKE GROWTH FACTOR IGF ACTIVITY BY INSULIN LIKE GROWTH FACTOR BINDING PROTEINS IGFBPS 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE UP 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA WITH LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS UP 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOOI ST7 TARGETS DN 123 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROY WOUND BLOOD VESSEL UP 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BASAKI YBX1 TARGETS DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 8D DN 205 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 10D DN 142 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 16D DN 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION MONOCYTE UP 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 AND HDAC2 TARGETS UP 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC3 TARGETS UP 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SABATES COLORECTAL ADENOMA UP 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELYS THYROID CANCER UP 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VETTER TARGETS OF PRKCA AND ETS1 DN 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OZANNE AP1 TARGETS UP 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUZUKI AMPLIFIED IN ORAL CANCER 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU HGF SIGNALING NOT VIA AKT1 48HR UP 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHI SPARC TARGETS UP 24 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEITZ NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY 8P DELETION DN 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
温曼对缺氧DN的适应 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OXFORD RALA TARGETS UP 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OXFORD RALB TARGETS DN 9 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OXFORD RALA AND RALB TARGETS UP 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
h pilori的Murata毒力 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG RESPONSE TO BEXAROTENE DN 29 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FURUKAWA DUSP6 TARGETS PCI35 DN 74 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS POORLY DN 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井与中度DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRIDMAN SENESCENCE UP 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIPP DLBCL CURED VS FATAL UP 39 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB TARGETS 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG IMMORTALIZED BY TERT DN 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIANG SILENCED BY METHYLATION 2 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Traynor Rett综合征 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iyengar对脂肪细胞因子的反应 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX TARGETS 2 DN 16 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HENDRICKS SMARCA4 TARGETS UP 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Geiss对DSRNA DN的响应 16 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 24HR DN 148 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WESTON VEGFA TARGETS 108 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV 8 HR DN 53 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERRECCHIA DELAYED RESPONSE TO TGFB1 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV ALL DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU HBX TARGETS 1 UP 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERRECCHIA RESPONSE TO TGFB1 C4 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SATO SILENCED BY DEACETYLATION IN PANCREATIC CANCER 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C7 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WESTON VEGFA TARGETS 3HR 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES UP 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KONDO EZH2 TARGETS 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌萧述三腔的DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB UP 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROMER TUMORIGENESIS UP 63 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS UP 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS FIBROBLAST UP 84 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAVAZOIE METASTASIS 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POOLA INVASIVE BREAST CANCER UP 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER HEPATOBLAST 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DASU IL6 SIGNALING UP 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮德森焦油GETS OF 611CTF ISOFORM OF ERBB2 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GHANDHI DIRECT IRRADIATION UP 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GHANDHI BYSTANDER IRRADIATION UP 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM REGULATORS 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA MATRISOME ASSOCIATED 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA MATRISOME 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因