概括
基因 4313
象征 MMP2
同义词 clg4 | clg4a | mmp-2 | mmp-ii | mona | tbe-1
描述 基质金属肽酶2
参考 MIM:120360|HGNC:HGNC:7166|Ensembl:ENSG00000087245|HPRD:00386|Vega:Otthumg00000133202
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16Q12.2
Pascal P值 0.915
胎儿β 0.195
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.4072

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 MMP2 4313 0 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005509 钙离子结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15146192
去:0004222 金属肽酶活性 IEA -
去:0004222 金属肽酶活性 塔斯 2834383
去:0008270 锌离子结合 塔斯 2834383
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001955 血管成熟 IEA -
去:0006508 蛋白水解 塔斯 2834383
去:0008152 代谢过程 IEA -
GO:0030574 胶原分解代谢过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005578 蛋白质细胞外基质 IEA -
去:0005615 细胞外空间 塔斯 2834383
去:0030017 肉皮 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0043231 细胞内膜结合的细胞器 艾达 18029348

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
A2M CPAMD5 |DKFZP779B086 |FWP007 |S863-7 α-2-巨球蛋白 重构的复合物 Biogrid 9344465
Bace1 asp2 |贝丝|FLJ90568 |HSPC104 |KIAA1149 β位点应用酶1 - HPRD 12586836
BCAN behab |CSPG7 |MGC13038 Brevican - HPRD,Biogrid 10986281
CCL7 fic |马克|MCP-3 |MCP3 |MGC138463 |MGC138465 |NC28 |scya6 |Scya7 趋化因子(C-C基序)配体7 - HPRD,Biogrid 10947989|12149192
cldn1 Cld1 |ilvasc |SEMP1 克劳丁1 - HPRD 11382769
COL18A1 FLJ27325 |FLJ34914 |kno |kno1 |MGC74745 胶原蛋白,XVIII类型,Alpha 1 - HPRD,Biogrid 12023034
Col1a1 OI4 胶原蛋白,I型,Alpha 1 - HPRD,Biogrid 11368514
COL6A3 DKFZP686D23123 |DKFZP686K04147 |DKFZP686N0262 |FLJ34702 |FLJ98399 胶原蛋白,VI型,Alpha 3 - HPRD 8862926
Col7a1 EBD1 |EBDCT |EBR1 胶原蛋白,第七型,alpha 1 - HPRD 10652000
CXCL12 PBSF |scyb12 |SDF-1A |SDF-1B |SDF1 |SDF1A |SDF1B |TLSF-A |TLSF-B |TPAR1 趋化因子(C-X-C基序)配体12(基质细胞衍生因子1) - HPRD,Biogrid 11571304
itgav CD51 |DKFZP686A08142 |MSK8 |vnra 整联蛋白,αV(玻璃原蛋白受体,α多肽,抗原CD51) - HPRD,Biogrid 11134507
LCN2 ngal Lipocalin 2 - HPRD,Biogrid 7683678
MMP17 MT4-MMP 基质金属肽酶17(膜插入) - HPRD,Biogrid 10551873
PZP CPAMD6 |MGC133093 怀孕区蛋白 重构的复合物 Biogrid 9344465
Spock1 FLJ37170 |Spock |睾丸|tic1 Sparc/osteotin,CWCV和Kazal样域蛋白聚糖(睾丸)1 - HPRD 12810672
TGFB1 CED |DPD1 |TGFB |TGFBETA 转化生长因子,β1 - HPRD,Biogrid 10652271
THBS1 thbs |TSP |TSP1 血小板传播1 - HPRD,Biogrid 10900205
THBS2 TSP2 血小板传播2 - HPRD,Biogrid 10900205
timp2 CSC-21K TIMP金属肽酶抑制剂2 - HPRD,Biogrid 9933646|10991943
|12032297|12374789
timp3 HSMRK222 |K222 |K222TA2 |SFD TIMP金属肽酶抑制剂3 - HPRD,Biogrid 10196161
timp4 - TIMP金属肽酶抑制剂4 - HPRD,Biogrid 9182583


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg白细胞跨内皮迁移 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg gnRH信号通路 101 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg膀胱癌 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径 66 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ER非原始组途径 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 OPN途径 31 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FRA路径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID血管生成素受体途径 50 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53下游途径 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AMB2中性粒细胞途径 41 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ATF2途径 59 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FOXM1途径 40 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Beta Catenin nuc途径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 2途径 33 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
细胞外基质的反应组降解 29 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞外基质组织 87 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖尿病途径 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素像生长因子结合蛋白IGFBPS对胰岛素类似生长因子IGF活性的反应组调节 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN 74 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wilcox对孕酮DN的反应 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Baris甲状腺癌DN 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roylance乳腺癌16Q副本编号DN 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP DN 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mahadevan GIST形态开关 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝克血液素质Stat1靶标 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝克造血STAT3目标 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Agarwal AKT途径目标 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAN从Anoikis逃脱 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karakas TGFB1信号传导 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肯尼CTNNB1靶向 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jechlinger上皮到间充质转变 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert)目标DN 87 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1本地化的Alcalay AML 140 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weston Vegfa目标6小时 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delaserna Myod目标DN 57 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿·维加法(Weston Vegfa)目标12小时 35 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卫星对干扰素βdn的响应 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿Vegfa目标 108 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C5的反应 21 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia延迟对TGFB1的响应 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Smarca4目标 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRAS和STK11 DN的JI致癌作用 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yague pryumor耐药性DN 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma dn 100 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alonso转移EMT 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ju Aging TERC靶向 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
flt3 itd的valk aml 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇2的时间反应2 86 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Leiomomyosarcoma CNN1 DN 20 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 134 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康AR目标 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Steger脂肪形成DN 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kohoutek CCNT2目标 58 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix RAR目标 48 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
anastassiou癌症间充质过渡特征 64 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM监管机构 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-29 299 305 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-324-3p 415 421 M8 HSA-MIR-324-3P ccacugccccaggugcugcugg