基因页:MMP2
概括?
基因 | 4313 |
象征 | MMP2 |
同义词 | clg4 | clg4a | mmp-2 | mmp-ii | mona | tbe-1 |
描述 | 基质金属肽酶2 |
参考 | MIM:120360|HGNC:HGNC:7166|Ensembl:ENSG00000087245|HPRD:00386|Vega:Otthumg00000133202 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q12.2 |
Pascal P值 | 0.915 |
胎儿β | 0.195 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | MMP2 | 4313 | 0 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MMP2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15146192 | |
去:0004222 | 金属肽酶活性 | IEA | - | |
去:0004222 | 金属肽酶活性 | 塔斯 | 2834383 | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 塔斯 | 2834383 | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001955 | 血管成熟 | IEA | - | |
去:0006508 | 蛋白水解 | 塔斯 | 2834383 | |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
GO:0030574 | 胶原分解代谢过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005578 | 蛋白质细胞外基质 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | 塔斯 | 2834383 | |
去:0030017 | 肉皮 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
GO:0043231 | 细胞内膜结合的细胞器 | 艾达 | 18029348 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
A2M | CPAMD5 |DKFZP779B086 |FWP007 |S863-7 | α-2-巨球蛋白 | 重构的复合物 | Biogrid | 9344465 |
Bace1 | asp2 |贝丝|FLJ90568 |HSPC104 |KIAA1149 | β位点应用酶1 | - | HPRD | 12586836 |
BCAN | behab |CSPG7 |MGC13038 | Brevican | - | HPRD,Biogrid | 10986281 |
CCL7 | fic |马克|MCP-3 |MCP3 |MGC138463 |MGC138465 |NC28 |scya6 |Scya7 | 趋化因子(C-C基序)配体7 | - | HPRD,Biogrid | 10947989|12149192 |
cldn1 | Cld1 |ilvasc |SEMP1 | 克劳丁1 | - | HPRD | 11382769 |
COL18A1 | FLJ27325 |FLJ34914 |kno |kno1 |MGC74745 | 胶原蛋白,XVIII类型,Alpha 1 | - | HPRD,Biogrid | 12023034 |
Col1a1 | OI4 | 胶原蛋白,I型,Alpha 1 | - | HPRD,Biogrid | 11368514 |
COL6A3 | DKFZP686D23123 |DKFZP686K04147 |DKFZP686N0262 |FLJ34702 |FLJ98399 | 胶原蛋白,VI型,Alpha 3 | - | HPRD | 8862926 |
Col7a1 | EBD1 |EBDCT |EBR1 | 胶原蛋白,第七型,alpha 1 | - | HPRD | 10652000 |
CXCL12 | PBSF |scyb12 |SDF-1A |SDF-1B |SDF1 |SDF1A |SDF1B |TLSF-A |TLSF-B |TPAR1 | 趋化因子(C-X-C基序)配体12(基质细胞衍生因子1) | - | HPRD,Biogrid | 11571304 |
itgav | CD51 |DKFZP686A08142 |MSK8 |vnra | 整联蛋白,αV(玻璃原蛋白受体,α多肽,抗原CD51) | - | HPRD,Biogrid | 11134507 |
LCN2 | ngal | Lipocalin 2 | - | HPRD,Biogrid | 7683678 |
MMP17 | MT4-MMP | 基质金属肽酶17(膜插入) | - | HPRD,Biogrid | 10551873 |
PZP | CPAMD6 |MGC133093 | 怀孕区蛋白 | 重构的复合物 | Biogrid | 9344465 |
Spock1 | FLJ37170 |Spock |睾丸|tic1 | Sparc/osteotin,CWCV和Kazal样域蛋白聚糖(睾丸)1 | - | HPRD | 12810672 |
TGFB1 | CED |DPD1 |TGFB |TGFBETA | 转化生长因子,β1 | - | HPRD,Biogrid | 10652271 |
THBS1 | thbs |TSP |TSP1 | 血小板传播1 | - | HPRD,Biogrid | 10900205 |
THBS2 | TSP2 | 血小板传播2 | - | HPRD,Biogrid | 10900205 |
timp2 | CSC-21K | TIMP金属肽酶抑制剂2 | - | HPRD,Biogrid | 9933646|10991943 |12032297|12374789 |
timp3 | HSMRK222 |K222 |K222TA2 |SFD | TIMP金属肽酶抑制剂3 | - | HPRD,Biogrid | 10196161 |
timp4 | - | TIMP金属肽酶抑制剂4 | - | HPRD,Biogrid | 9182583 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg白细胞跨内皮迁移 | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg gnRH信号通路 | 101 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg膀胱癌 | 42 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID溶物磷脂途径 | 66 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ER非原始组途径 | 41 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AVB3 OPN途径 | 31 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FRA路径 | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID血管生成素受体途径 | 50 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AMB2中性粒细胞途径 | 41 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ATF2途径 | 59 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID FOXM1途径 | 40 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Beta Catenin nuc途径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Syndecan 2途径 | 33 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
细胞外基质的反应组降解 | 29 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞外基质组织 | 87 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖尿病途径 | 133 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素像生长因子结合蛋白IGFBPS对胰岛素类似生长因子IGF活性的反应组调节 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钟对偶氮替丁的反应和tsa | 183 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN | 74 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wilcox对孕酮DN的反应 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 | 187 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 | 117 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Baris甲状腺癌DN | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roylance乳腺癌16Q副本编号DN | 26 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP DN | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向 | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mahadevan GIST形态开关 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝克血液素质Stat1靶标 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝克造血STAT3目标 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Agarwal AKT途径目标 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAN从Anoikis逃脱 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karakas TGFB1信号传导 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2向上 | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肯尼CTNNB1靶向 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard粉碎和燃烧突变体 | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML与PML RARA FUSION | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jechlinger上皮到间充质转变 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert)目标DN | 87 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1本地化的Alcalay AML | 140 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1的Verhaak AML突变 | 183 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1目标 | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Weston Vegfa目标6小时 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delaserna Myod目标DN | 57 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
韦斯顿·维加法(Weston Vegfa)目标12小时 | 35 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卫星对干扰素βdn的响应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
韦斯顿Vegfa目标 | 108 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verrecchia对TGFB1 C5的反应 | 21 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verrecchia延迟对TGFB1的响应 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Smarca4目标 | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KRAS和STK11 DN的JI致癌作用 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yague pryumor耐药性DN | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma dn | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冬季缺氧metagene | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Alonso转移EMT | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记 | 165 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记DN | 138 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ju Aging TERC靶向 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 | 338 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
flt3 itd的valk aml | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇2的时间反应2 | 86 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Leiomomyosarcoma CNN1 DN | 20 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手DN | 116 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad1和Smad5抑制Pangas肿瘤 | 134 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康AR目标 | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Steger脂肪形成DN | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kohoutek CCNT2目标 | 58 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix RAR目标 | 48 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
anastassiou癌症间充质过渡特征 | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-29 | 299 | 305 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
mir-324-3p | 415 | 421 | M8 | HSA-MIR-324-3P | ccacugccccaggugcugcugg |