基因页：LHX8

概括？
基因 431707
象征 LHX8
同义词 LHX7
描述 Lim Homeobox 8
参考 MIM：604425|HGNC：HGNC：28838|ENSEMBL：ENSG00000162624|HPRD：17275|Vega：Otthumg00000009692
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p31.1
Pascal P值 0.063

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.02692
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003677 DNA结合 IEA -
去：0003700 转录因子活性 IEA -
去：0008270 锌离子结合 IEA -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
GO：0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 229 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞DN 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-125/351 9 15 1a HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug
mir-142-5p 423 430 1A，M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 292 298 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-188 11 17 1a HSA-MIR-188 cucccuugcaugguggggu
mir-221/222 511 517 1a HSA-MIR-221脑 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222脑 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-27 446 452 1a HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-30-3p 459 465 M8 HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-30-5p 197 204 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-363 323 329 1a HSA-MIR-363 auugcacgguauccaucuguaa
mir-382 420 426 M8 HSA-MIR-382脑 Gaaguuucgugguggauucg
mir-431 156 163 1A，M8 HSA-MIR-431 uguugcaggccguauga
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 291 297 M8 HSA-MIR-93脑 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu