基因页：MMP16
概括？
| 基因 | 4325 |
| 象征 | MMP16 |
| 同义词 | c8orf57 | mmp-x2 | mt-mmp2 | mt-mmp3 | mt3-mmp |
| 描述 | 基质金属肽酶16 |
| 参考 | MIM：602262|HGNC：HGNC：7162|ENSEMBL：ENSG00000156103|HPRD：03776|Vega：Otthumg00000163769 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8Q21.3 |
| Pascal P值 | 5.134E-7 |
| Sherlock P值 | 0.581 |
| 胎儿β | 1.586 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| LK：是的 | 全基因组协会研究 | 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG07609388 | 8 | 89341103 | MMP16 | 3.9e-9 | -0.023 | 2.43e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| DRG2 | 0.85 | 0.83 |
| WDR45 | 0.85 | 0.82 |
| NIT1 | 0.85 | 0.82 |
| PHKG2 | 0.85 | 0.81 |
| ATP6V0D1 | 0.84 | 0.82 |
| trub2 | 0.84 | 0.86 |
| Foxred1 | 0.83 | 0.81 |
| 格里纳 | 0.83 | 0.82 |
| Med29 | 0.83 | 0.83 |
| SLC25A11 | 0.82 | 0.81 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.18 | -0.55 | -0.36 |
| AF347015.21 | -0.50 | -0.27 |
| AC010300.1 | -0.49 | -0.50 |
| MT-ATP8 | -0.48 | -0.28 |
| AF347015.2 | -0.45 | -0.22 |
| AF347015.8 | -0.45 | -0.23 |
| NSBP1 | -0.44 | -0.36 |
| FAM159B | -0.43 | -0.52 |
| AL139819.3 | -0.43 | -0.35 |
| AC100783.1 | -0.43 | -0.27 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 细胞外基质的反应组降解 | 29 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞外基质组织 | 87 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌基础与间充质DN | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王对福斯科林的反应 | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 留置权乳腺癌变质 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ropero HDAC2目标 | 114 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON | 132 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CERVERA SDHB目标1 DN | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 尼尔森对雄激素DN的反应 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stanelle E2F1目标 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nouzova在APL中甲基化 | 68 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia对TGFB1 C2的反应 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia对TGFB1的早期反应 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 海勒被甲基化DN沉默 | 105 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应6小时DN | 91 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 朱凯尔的目标 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹通过FN1信号传导翻译 | 35 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |