概括
基因 4335
象征 mnt
同义词 mad6 | mxd6 | rox | bhlhd33
描述 最大网络转录抑制器
参考 MIM:603039|HGNC:HGNC:7188|Ensembl:ENSG00000070444|HPRD:04331|Vega:Otthumg0000000090603
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p13.3
Pascal P值 0.006
Sherlock P值 0.792
胎儿β 0.296
DMG 3(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 3
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 3
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01485948 17 2296549 mnt 1.45e-7 -0.409 0.004 DMG:Wockner_2014
CG18557086 17 2304670 mnt -0.022 0.98 DMG:Nishioka_2013
CG23147149 17 2304328 mnt 9.81e-11 -0.012 4.49e-7 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6733654 CHR2 1963270 mnt 4335 0.11 反式
RS16827037 CHR3 117203284 mnt 4335 0.08 反式
RS317714 CHR7 29115553 mnt 4335 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Narg2 0.87 0.82
Smarca5 0.86 0.84
DHX40 0.85 0.79
PKN2 0.85 0.84
sfrs2ip 0.84 0.81
Haus6 0.84 0.81
SMC5 0.84 0.84
CEP192 0.84 0.81
CENPC1 0.84 0.83
PGGT1B 0.84 0.76
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.59 -0.67
AF347015.31 -0.58 -0.67
ifi27 -0.58 -0.67
higd1b -0.57 -0.67
FXYD1 -0.57 -0.65
增强 -0.56 -0.71
AF347015.21 -0.56 -0.65
AF347015.27 -0.55 -0.63
mt-cyb -0.55 -0.62
AF347015.33 -0.55 -0.61

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
渡边直肠癌放射疗法反应性DN 92 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿米特血清反应120 MCF10A 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans 185 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Menssen MYC目标 53 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL与VH重新排列 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卫星对干扰素βdn的响应 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dazard对UV NHEK DN的反应 318 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold脂肪形成 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠与直肠癌DN 56 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Cycling基因 148 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tian tnf信令不通过NFKB 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold对TZD DN的反应 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G1 S 147 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡mir302a目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 2小时的回应 53 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时DN的响应 114 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因