基因页:mnt
概括?
基因 | 4335 |
象征 | mnt |
同义词 | mad6 | mxd6 | rox | bhlhd33 |
描述 | 最大网络转录抑制器 |
参考 | MIM:603039|HGNC:HGNC:7188|Ensembl:ENSG00000070444|HPRD:04331|Vega:Otthumg0000000090603 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17p13.3 |
Pascal P值 | 0.006 |
Sherlock P值 | 0.792 |
胎儿β | 0.296 |
DMG | 3(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 3 |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 3 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 3 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01485948 | 17 | 2296549 | mnt | 1.45e-7 | -0.409 | 0.004 | DMG:Wockner_2014 |
CG18557086 | 17 | 2304670 | mnt | -0.022 | 0.98 | DMG:Nishioka_2013 | |
CG23147149 | 17 | 2304328 | mnt | 9.81e-11 | -0.012 | 4.49e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6733654 | CHR2 | 1963270 | mnt | 4335 | 0.11 | 反式 | ||
RS16827037 | CHR3 | 117203284 | mnt | 4335 | 0.08 | 反式 | ||
RS317714 | CHR7 | 29115553 | mnt | 4335 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MNT_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Narg2 | 0.87 | 0.82 |
Smarca5 | 0.86 | 0.84 |
DHX40 | 0.85 | 0.79 |
PKN2 | 0.85 | 0.84 |
sfrs2ip | 0.84 | 0.81 |
Haus6 | 0.84 | 0.81 |
SMC5 | 0.84 | 0.84 |
CEP192 | 0.84 | 0.81 |
CENPC1 | 0.84 | 0.83 |
PGGT1B | 0.84 | 0.76 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.59 | -0.67 |
AF347015.31 | -0.58 | -0.67 |
ifi27 | -0.58 | -0.67 |
higd1b | -0.57 | -0.67 |
FXYD1 | -0.57 | -0.65 |
增强 | -0.56 | -0.71 |
AF347015.21 | -0.56 | -0.65 |
AF347015.27 | -0.55 | -0.63 |
mt-cyb | -0.55 | -0.62 |
AF347015.33 | -0.55 | -0.61 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
渡边直肠癌放射疗法反应性DN | 92 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应120 MCF10A | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans | 185 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Menssen MYC目标 | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FAELT B CLL与VH重新排列 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卫星对干扰素βdn的响应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold脂肪形成 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠与直肠癌DN | 56 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Cycling基因 | 148 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tian tnf信令不通过NFKB | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold对TZD DN的反应 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G1 S | 147 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卡mir302a目标 | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 2小时的回应 | 53 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 6小时DN的响应 | 114 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |