基因页:ASIP
概括?
基因 | 434 |
象征 | ASIP |
同义词 | agsw | agti | agtil | asp | shep9 |
描述 | Agouti信号蛋白 |
参考 | MIM:600201|HGNC:HGNC:745|ENSEMBL:ENSG00000101440|HPRD:02562|Vega:Otthumg0000000032289 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20Q11.2-Q12 |
Pascal P值 | 0.401 |
胎儿β | -0.004 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG05267394 | 20 | 32856898 | ASIP | 5.75e-4 | 0.959 | 0.049 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ASIP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005102 | 受体结合 | 塔斯 | 神经递质(GO期限:4) | 7757071 |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007267 | 细胞细胞信号传导 | 塔斯 | 7757071 | |
去:0006091 | 产生前体代谢物和能量 | 塔斯 | 7937887 | |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 7757071 | |
去:0009755 | 激素介导的信号传导 | IEA | - | |
GO:0042438 | 黑色素生物合成过程 | IEA | - | |
GO:0043473 | 色素沉着 | IEA | - | |
GO:0032438 | 黑色素体组织 | IEA | - | |
GO:0032402 | 黑色素体运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | 塔斯 | 7937887 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg黑色素发生 | 102 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID胰岛素葡萄糖途径 | 26 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标8小时DN | 129 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee老化新皮层DN | 80 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制性新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 | 74 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期S | 162 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |