概括
基因 434
象征 ASIP
同义词 agsw | agti | agtil | asp | shep9
描述 Agouti信号蛋白
参考 MIM:600201|HGNC:HGNC:745|ENSEMBL:ENSG00000101440|HPRD:02562|Vega:Otthumg0000000032289
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20Q11.2-Q12
Pascal P值 0.401
胎儿β -0.004
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG05267394 20 32856898 ASIP 5.75e-4 0.959 0.049 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005102 受体结合 塔斯 神经递质(GO期限:4) 7757071
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 7757071
去:0006091 产生前体代谢物和能量 塔斯 7937887
去:0007165 信号转导 塔斯 7757071
去:0009755 激素介导的信号传导 IEA -
GO:0042438 黑色素生物合成过程 IEA -
GO:0043473 色素沉着 IEA -
GO:0032438 黑色素体组织 IEA -
GO:0032402 黑色素体运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005615 细胞外空间 塔斯 7937887

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg黑色素发生 102 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID胰岛素葡萄糖途径 26 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标8小时DN 129 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化新皮层DN 80 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 74 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期S 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因